64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_10279 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_10279  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 241 aa  483  1e-136  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000004651  normal  0.205699 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0367  TetR family transcriptional regulator  66.5 
 
 		 205 aa  258  6e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.526712  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0356  TetR family transcriptional regulator  66.5 
 
 		 205 aa  258  6e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0377  TetR family transcriptional regulator  66.5 
 
 		 205 aa  258  6e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0331  TetR family transcriptional regulator  62.87 
 
 		 209 aa  234  8e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0409  FadD27  65.85 
 
 		 165 aa  208  6e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.25545  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4521  hypothetical protein  41.33 
 
 		 244 aa  133  3e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0978  TetR family transcriptional regulator  38.74 
 
 		 199 aa  106  4e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0957  TetR family transcriptional regulator  38.74 
 
 		 199 aa  106  4e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.962367  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0975  TetR family transcriptional regulator  38.74 
 
 		 199 aa  106  4e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0353361 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3378  regulatory protein TetR  35.71 
 
 		 196 aa  103  3e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1244  TetR family transcriptional regulator  37.82 
 
 		 206 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218846 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5109  TetR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 201 aa  86.7  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.313188  normal  0.176776 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5407  transcriptional regulator, TetR family  33.82 
 
 		 211 aa  83.2  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.924589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3262  TetR family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 224 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.376016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3209  TetR family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 224 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3200  TetR family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 224 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.415485  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4893  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 194 aa  80.1  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0909608  normal  0.312291 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4597  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 194 aa  80.1  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.908107 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4510  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 194 aa  80.1  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.576125  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5084  TetR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 193 aa  76.6  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22680  transcriptional regulator  33.85 
 
 		 202 aa  75.1  0.0000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10840  hypothetical protein  32.63 
 
 		 213 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.96162e-38  hitchhiker  0.00000829572 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3563  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 203 aa  71.2  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4630  TetR family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 213 aa  69.3  0.00000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0908  TetR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 200 aa  69.3  0.00000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.376971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0816  TetR family transcriptional regulator  42.17 
 
 		 221 aa  68.9  0.00000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1669  TetR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 193 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0436  transcriptional regulator, TetR family  32.22 
 
 		 230 aa  65.9  0.0000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1526  TetR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 218 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4611  TetR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 224 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3207  TetR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 245 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3260  TetR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 245 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3198  TetR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 228 aa  59.7  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0607  putative transcriptional regulator, TetR family  29 
 
 		 194 aa  59.7  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.174677  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4594  TetR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 211 aa  58.9  0.00000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.780124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4631  TetR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 232 aa  58.5  0.00000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0313  TetR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 213 aa  57  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1283  TetR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 229 aa  56.6  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.299217  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1013  TetR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 209 aa  55.1  0.0000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.421012  normal  0.993866 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1682  putative transcriptional regulator, TetR family  30.21 
 
 		 201 aa  53.1  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.546444 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0515  transcriptional regulator, TetR family  26.7 
 
 		 211 aa  53.1  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0187  regulatory protein TetR  38.96 
 
 		 205 aa  51.6  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2656  transcriptional regulator, TetR family  27.75 
 
 		 212 aa  51.6  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000478919  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4936  TetR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 211 aa  50.1  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4918  transcriptional regulator, TetR family  28.23 
 
 		 221 aa  49.7  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1142  transcriptional regulator, TetR family  32.77 
 
 		 236 aa  48.9  0.00007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.627372  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2213  putative transcription regulator transcription regulator protein  27.78 
 
 		 236 aa  47.4  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0744  hypothetical protein  20.77 
 
 		 184 aa  47  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.202203  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4846  regulatory protein TetR  35.62 
 
 		 228 aa  44.7  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0727  hypothetical protein  20.77 
 
 		 184 aa  43.9  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  22.35 
 
 		 222 aa  43.1  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1073  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 222 aa  43.1  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0121  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 216 aa  43.1  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0102  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 216 aa  43.1  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1263  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 216 aa  43.1  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1540  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 221 aa  43.1  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.608661  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2819  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 222 aa  43.1  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2672  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 217 aa  43.1  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0405  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 222 aa  42.7  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0432  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 222 aa  42  0.008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.147068  hitchhiker  0.000000839635 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5216  TetR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 226 aa  42  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.999138  hitchhiker  0.00983469 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2901  TetR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 218 aa  42  0.009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.781877  normal  0.0527686 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0540  TetR family transcriptional regulator  24.77 
 
 		 247 aa  41.6  0.01  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000321251  hitchhiker  0.0000104132 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>