More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4630 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_4630  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 213 aa  433  1e-121  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4594  TetR family transcriptional regulator  91.9 
 
 		 211 aa  365  1e-100  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.780124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0313  TetR family transcriptional regulator  91.51 
 
 		 213 aa  367  1e-100  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3200  TetR family transcriptional regulator  61.79 
 
 		 224 aa  270  9e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.415485  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3262  TetR family transcriptional regulator  61.79 
 
 		 224 aa  270  9e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.376016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3209  TetR family transcriptional regulator  61.79 
 
 		 224 aa  270  9e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5407  transcriptional regulator, TetR family  34.57 
 
 		 211 aa  106  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.924589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3563  TetR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 203 aa  105  4e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3378  regulatory protein TetR  37.99 
 
 		 196 aa  100  1e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22680  transcriptional regulator  36.46 
 
 		 202 aa  97.1  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4521  hypothetical protein  31.18 
 
 		 244 aa  94.7  1e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1244  TetR family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 206 aa  94  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218846 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0957  TetR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 199 aa  90.9  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.962367  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0975  TetR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 199 aa  90.9  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0353361 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0978  TetR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 199 aa  90.5  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4893  TetR family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 194 aa  90.1  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0909608  normal  0.312291 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4510  TetR family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 194 aa  90.1  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.576125  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4597  TetR family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 194 aa  90.1  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.908107 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0607  putative transcriptional regulator, TetR family  30.53 
 
 		 194 aa  90.5  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.174677  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3198  TetR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 228 aa  88.2  9e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3260  TetR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 245 aa  87.8  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3207  TetR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 245 aa  87.8  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10840  hypothetical protein  30.65 
 
 		 213 aa  87  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.96162e-38  hitchhiker  0.00000829572 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5109  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 201 aa  87  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.313188  normal  0.176776 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5084  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 193 aa  86.7  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0331  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 209 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10279  TetR family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 241 aa  80.9  0.00000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000004651  normal  0.205699 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0436  transcriptional regulator, TetR family  33.14 
 
 		 230 aa  79.3  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4631  TetR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 232 aa  77.8  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1669  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 193 aa  75.1  0.0000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4936  TetR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 211 aa  73.6  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1013  TetR family transcriptional regulator  39.45 
 
 		 209 aa  73.6  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.421012  normal  0.993866 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0367  TetR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 205 aa  72  0.000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.526712  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0377  TetR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 205 aa  72  0.000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0356  TetR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 205 aa  72  0.000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0908  TetR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 200 aa  71.2  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.376971  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1142  transcriptional regulator, TetR family  35.65 
 
 		 236 aa  68.2  0.00000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.627372  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4846  regulatory protein TetR  31.33 
 
 		 228 aa  67.8  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0409  FadD27  32.3 
 
 		 165 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.25545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0816  TetR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 221 aa  66.2  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1526  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 218 aa  66.2  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4611  TetR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 224 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0444  transcriptional regulator, TetR family  35.14 
 
 		 222 aa  63.2  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0515  transcriptional regulator, TetR family  27.68 
 
 		 211 aa  63.2  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0187  regulatory protein TetR  34.82 
 
 		 205 aa  62.8  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4838  transcriptional regulator, TetR family  30.71 
 
 		 217 aa  60.5  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1283  TetR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 229 aa  57.8  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.299217  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0432  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 222 aa  57  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.147068  hitchhiker  0.000000839635 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2779  transcriptional regulator, TetR family  33.82 
 
 		 185 aa  57.4  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.441306  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2116  transcriptional regulator, TetR family  30.22 
 
 		 192 aa  57.4  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2297  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 305 aa  55.8  0.0000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0935054  hitchhiker  0.00257224 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0405  TetR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 222 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1079  TetR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 215 aa  55.5  0.0000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4347  transcriptional regulator, TetR family  30.06 
 
 		 191 aa  55.1  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.685734 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0973  TetR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 198 aa  55.1  0.0000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3227  transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 		 204 aa  55.1  0.0000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2442  TetR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 218 aa  54.3  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0351  TetR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 230 aa  54.3  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2497  TetR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 201 aa  54.3  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.55388 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4918  transcriptional regulator, TetR family  27.12 
 
 		 221 aa  54.3  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5042  TetR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 225 aa  53.5  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.449178  normal  0.617447 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0815  transcriptional regulator, TetR family  30.33 
 
 		 207 aa  53.1  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3466  TetR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 200 aa  53.1  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2580  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 211 aa  53.1  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.257801 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0102  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 216 aa  52.8  0.000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1073  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 222 aa  52.8  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1486  TetR family transcriptional regulator  52.17 
 
 		 201 aa  52.8  0.000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.260636  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2672  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 217 aa  52.8  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0121  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 216 aa  52.8  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2901  TetR family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 218 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.781877  normal  0.0527686 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1263  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 216 aa  52.8  0.000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1540  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 221 aa  52.8  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.608661  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0136  TetR family transcriptional regulator  52.17 
 
 		 201 aa  52.8  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.563717  normal  0.436061 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2819  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 222 aa  52.8  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7871  transcriptional regulator, TetR family  33.91 
 
 		 212 aa  52.4  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.519364  normal  0.175428 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3152  transcriptional regulator, TetR family  26.97 
 
 		 248 aa  52.4  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.262017  normal  0.121031 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3855  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 213 aa  52  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.898863  normal  0.650046 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4696  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 218 aa  52.4  0.000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3666  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 218 aa  52.4  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0498574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0589  TetR family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 191 aa  52  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7494  transcriptional regulator, TetR family  34.44 
 
 		 188 aa  52  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3517  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 236 aa  51.6  0.000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0435497  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0564  transcriptional regulator, TetR family  31 
 
 		 203 aa  51.6  0.000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  25.71 
 
 		 242 aa  51.6  0.000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3410  TetR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 196 aa  50.8  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000655293  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0005  TetR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 195 aa  51.2  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0931339  normal  0.381518 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1840  transcriptional regulator, TetR family  29.52 
 
 		 213 aa  50.8  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0700993  normal  0.104485 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0119  TetR family transcriptional regulator  25.25 
 
 		 201 aa  51.2  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.00000000566826  decreased coverage  0.00000000000241144 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3566  TetR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 187 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.730164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1933  AcrR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 243 aa  50.1  0.00002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.189914  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5390  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 291 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.787919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3062  transcriptional regulator, TetR family  37.21 
 
 		 199 aa  50.1  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0638813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2654  TetR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 196 aa  50.4  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.136013  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4404  TetR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 213 aa  50.4  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5414  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 218 aa  50.4  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1169  TetR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 202 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3570  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 219 aa  50.8  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.649978  decreased coverage  0.00133713 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4794  transcriptional regulator, TetR family  32.97 
 
 		 187 aa  49.7  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2697  transcriptional regulator, TetR family  33.75 
 
 		 202 aa  50.1  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0744  hypothetical protein  22.75 
 
 		 184 aa  49.7  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.202203  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>