166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_5407 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



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Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_5407  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 
211 aa  407  1e-113  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.924589  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22680  transcriptional regulator  52.91 
 
 
202 aa  174  6e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10840  hypothetical protein  43.37 
 
 
213 aa  140  9e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.96162e-38  hitchhiker  0.00000829572 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5084  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
193 aa  136  2e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4510  TetR family transcriptional regulator  42.49 
 
 
194 aa  136  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.576125  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4597  TetR family transcriptional regulator  42.49 
 
 
194 aa  136  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.908107 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4893  TetR family transcriptional regulator  42.49 
 
 
194 aa  136  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0909608  normal  0.312291 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1669  TetR family transcriptional regulator  42.35 
 
 
193 aa  120  9.999999999999999e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0607  putative transcriptional regulator, TetR family  41.36 
 
 
194 aa  118  7.999999999999999e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.174677  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3200  TetR family transcriptional regulator  35.1 
 
 
224 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.415485  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3262  TetR family transcriptional regulator  35.1 
 
 
224 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.376016  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3209  TetR family transcriptional regulator  35.1 
 
 
224 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0436  transcriptional regulator, TetR family  40.57 
 
 
230 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0957  TetR family transcriptional regulator  38.61 
 
 
199 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.962367  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0975  TetR family transcriptional regulator  38.61 
 
 
199 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0353361 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0978  TetR family transcriptional regulator  38.61 
 
 
199 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3260  TetR family transcriptional regulator  34.36 
 
 
245 aa  102  4e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3207  TetR family transcriptional regulator  34.36 
 
 
245 aa  102  4e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3198  TetR family transcriptional regulator  34.36 
 
 
228 aa  102  5e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1244  TetR family transcriptional regulator  37.75 
 
 
206 aa  101  6e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.218846 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3378  regulatory protein TetR  35.56 
 
 
196 aa  98.6  5e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4630  TetR family transcriptional regulator  34.57 
 
 
213 aa  97.8  9e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5109  TetR family transcriptional regulator  37.88 
 
 
201 aa  96.3  3e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.313188  normal  0.176776 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4521  hypothetical protein  33.01 
 
 
244 aa  95.9  4e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1013  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 
209 aa  90.1  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.421012  normal  0.993866 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4594  TetR family transcriptional regulator  34.04 
 
 
211 aa  89.7  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.780124  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3563  TetR family transcriptional regulator  35.75 
 
 
203 aa  88.2  7e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4936  TetR family transcriptional regulator  34.57 
 
 
211 aa  87  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0313  TetR family transcriptional regulator  33.51 
 
 
213 aa  87.4  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0816  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
221 aa  85.1  7e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4846  regulatory protein TetR  38.04 
 
 
228 aa  82.8  0.000000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10279  TetR family transcriptional regulator  33.82 
 
 
241 aa  82.8  0.000000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000004651  normal  0.205699 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0444  transcriptional regulator, TetR family  31.22 
 
 
222 aa  82.4  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4631  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 
232 aa  81.6  0.000000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0908  TetR family transcriptional regulator  29.9 
 
 
200 aa  81.3  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.376971  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0432  transcriptional regulator, TetR family  31.19 
 
 
222 aa  80.1  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.147068  hitchhiker  0.000000839635 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0187  regulatory protein TetR  34.67 
 
 
205 aa  77.4  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1682  putative transcriptional regulator, TetR family  27.18 
 
 
201 aa  76.6  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.546444 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1073  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 
222 aa  75.1  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2819  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 
222 aa  75.1  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0102  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 
216 aa  75.1  0.0000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1263  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 
216 aa  75.1  0.0000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1540  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 
221 aa  75.1  0.0000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.608661  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0121  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 
216 aa  75.1  0.0000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2672  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 
217 aa  75.1  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2442  TetR family transcriptional regulator  31.98 
 
 
218 aa  74.7  0.0000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0405  TetR family transcriptional regulator  30.5 
 
 
222 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5414  TetR family transcriptional regulator  31.47 
 
 
218 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3570  TetR family transcriptional regulator  31.98 
 
 
219 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.649978  decreased coverage  0.00133713 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4696  TetR family transcriptional regulator  31.47 
 
 
218 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3666  TetR family transcriptional regulator  31.47 
 
 
218 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0498574  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3855  TetR family transcriptional regulator  31.47 
 
 
213 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.898863  normal  0.650046 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4611  TetR family transcriptional regulator  33.51 
 
 
224 aa  72  0.000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0367  TetR family transcriptional regulator  29.08 
 
 
205 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.526712  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0377  TetR family transcriptional regulator  29.08 
 
 
205 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0356  TetR family transcriptional regulator  29.08 
 
 
205 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5042  TetR family transcriptional regulator  29.95 
 
 
225 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.449178  normal  0.617447 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0331  TetR family transcriptional regulator  31.98 
 
 
209 aa  70.1  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0515  transcriptional regulator, TetR family  29.24 
 
 
211 aa  69.7  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1526  TetR family transcriptional regulator  33.98 
 
 
218 aa  68.2  0.00000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1142  transcriptional regulator, TetR family  34.43 
 
 
236 aa  67  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.627372  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2901  TetR family transcriptional regulator  26.23 
 
 
218 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.781877  normal  0.0527686 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4918  transcriptional regulator, TetR family  30.1 
 
 
221 aa  63.2  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5197  transcriptional regulator, TetR family  27.67 
 
 
211 aa  60.8  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128867  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0509  TetR family transcriptional regulator  31.91 
 
 
191 aa  59.3  0.00000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3512  regulatory protein TetR  27.04 
 
 
237 aa  55.5  0.0000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1283  TetR family transcriptional regulator  29.85 
 
 
229 aa  55.1  0.0000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.299217  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1405  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 
212 aa  54.7  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.408275 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4590  regulatory protein TetR  32.22 
 
 
206 aa  52.8  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0908  transcriptional regulator, TetR family  30.41 
 
 
207 aa  51.6  0.000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469028  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1840  transcriptional regulator, TetR family  28.05 
 
 
213 aa  51.6  0.000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0700993  normal  0.104485 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0409  FadD27  29.11 
 
 
165 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.25545  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5216  TetR family transcriptional regulator  33.83 
 
 
226 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.999138  hitchhiker  0.00983469 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2297  TetR family transcriptional regulator  31.13 
 
 
305 aa  51.2  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0935054  hitchhiker  0.00257224 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2426  TetR family transcriptional regulator  32.58 
 
 
205 aa  50.4  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0305  transcriptional regulator, TetR family  31.66 
 
 
215 aa  49.7  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.437849  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3755  TetR family transcriptional regulator  29.8 
 
 
239 aa  48.5  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2108  TetR family transcriptional regulator  25.91 
 
 
207 aa  48.5  0.00007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3828  TetR family transcriptional regulator  29.8 
 
 
239 aa  48.5  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3157  TetR family transcriptional regulator  25.41 
 
 
330 aa  48.5  0.00007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3767  TetR family transcriptional regulator  29.8 
 
 
239 aa  48.5  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0858  regulatory protein TetR  33 
 
 
201 aa  48.5  0.00007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00117784  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5790  transcriptional regulator, TetR family  29.36 
 
 
220 aa  48.1  0.00009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0399068 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3838  transcriptional regulator, TetR family  33.14 
 
 
213 aa  47.8  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3992  transcriptional regulator, TetR family  31.02 
 
 
218 aa  47.8  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6485  regulatory protein, TetR  32.97 
 
 
278 aa  47.4  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.521213  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1216  TetR family transcriptional regulator  28.26 
 
 
204 aa  47.4  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5693  transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 
211 aa  47  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0563608  normal  0.866587 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  23.66 
 
 
224 aa  47  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0880  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 
212 aa  47  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.987052  normal 
 
 
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NC_009767  Rcas_4215  TetR family transcriptional regulator  22.34 
 
 
269 aa  47.4  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.261755 
 
 
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NC_013739  Cwoe_4481  transcriptional regulator, TetR family  25.25 
 
 
216 aa  46.6  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.918639  normal 
 
 
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NC_008531  LEUM_0265  TetR family transcriptional regulator  24 
 
 
194 aa  46.2  0.0003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.250901  n/a   
 
 
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NC_013131  Caci_4626  transcriptional regulator, TetR family  29.44 
 
 
211 aa  46.6  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.110176  hitchhiker  0.00755279 
 
 
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NC_013441  Gbro_4456  regulatory protein TetR  25.79 
 
 
202 aa  46.6  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0166479  n/a   
 
 
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NC_013441  Gbro_0987  regulatory protein TetR  37.89 
 
 
192 aa  46.2  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.383045  n/a   
 
 
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NC_009380  Strop_0787  regulatory protein, TetR  26.52 
 
 
226 aa  46.6  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_009565  TBFG_13232  TetR family transcriptional regulator  24.87 
 
 
228 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.414971 
 
 
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NC_013510  Tcur_0994  transcriptional regulator, TetR family  28.02 
 
 
271 aa  46.6  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_013203  Apar_0500  transcriptional regulator, TetR family  23.21 
 
 
241 aa  46.6  0.0003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
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