91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMASAVP1_1263 on replicon NC_008784
Organism: Burkholderia mallei SAVP1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006349  BMAA0102  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 216 aa  431  1e-120  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0121  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 216 aa  431  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1073  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 222 aa  432  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2672  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 217 aa  432  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2819  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 222 aa  432  1e-120  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1540  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 221 aa  433  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.608661  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1263  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 216 aa  431  1e-120  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0405  TetR family transcriptional regulator  89.3 
 
 		 222 aa  390  1e-108  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0444  transcriptional regulator, TetR family  75.45 
 
 		 222 aa  324  5e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0432  transcriptional regulator, TetR family  74.11 
 
 		 222 aa  320  9.999999999999999e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.147068  hitchhiker  0.000000839635 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5042  TetR family transcriptional regulator  68.95 
 
 		 225 aa  301  7.000000000000001e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.449178  normal  0.617447 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4696  TetR family transcriptional regulator  70.75 
 
 		 218 aa  298  5e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3666  TetR family transcriptional regulator  70.75 
 
 		 218 aa  298  5e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0498574  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3855  TetR family transcriptional regulator  70.75 
 
 		 213 aa  298  6e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.898863  normal  0.650046 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3570  TetR family transcriptional regulator  69.3 
 
 		 219 aa  295  4e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.649978  decreased coverage  0.00133713 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2442  TetR family transcriptional regulator  69.77 
 
 		 218 aa  294  7e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5414  TetR family transcriptional regulator  68.84 
 
 		 218 aa  293  9e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0816  TetR family transcriptional regulator  30.35 
 
 		 221 aa  107  1e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1013  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 209 aa  89.4  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.421012  normal  0.993866 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4936  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 211 aa  87.4  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1142  transcriptional regulator, TetR family  33.78 
 
 		 236 aa  77  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.627372  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4846  regulatory protein TetR  35.29 
 
 		 228 aa  70.5  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0978  TetR family transcriptional regulator  42.72 
 
 		 199 aa  69.7  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1682  putative transcriptional regulator, TetR family  29.84 
 
 		 201 aa  70.1  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.546444 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0957  TetR family transcriptional regulator  42.72 
 
 		 199 aa  69.7  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.962367  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5407  transcriptional regulator, TetR family  30.65 
 
 		 211 aa  69.3  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.924589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0975  TetR family transcriptional regulator  42.72 
 
 		 199 aa  69.7  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0353361 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5109  TetR family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 201 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.313188  normal  0.176776 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5084  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 193 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3378  regulatory protein TetR  29.8 
 
 		 196 aa  67  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10840  hypothetical protein  28.78 
 
 		 213 aa  65.9  0.0000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.96162e-38  hitchhiker  0.00000829572 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1244  TetR family transcriptional regulator  32.4 
 
 		 206 aa  64.7  0.0000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218846 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0908  TetR family transcriptional regulator  21.29 
 
 		 200 aa  62.4  0.000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.376971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0187  regulatory protein TetR  31.82 
 
 		 205 aa  61.6  0.000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4597  TetR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 194 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.908107 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4510  TetR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 194 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.576125  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4893  TetR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 194 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0909608  normal  0.312291 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22680  transcriptional regulator  30.2 
 
 		 202 aa  59.7  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3806  TetR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 238 aa  58.5  0.00000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65239  normal  0.316965 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4521  hypothetical protein  30.56 
 
 		 244 aa  58.2  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3209  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 224 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3200  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 224 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.415485  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1669  TetR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 193 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3262  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 224 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.376016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3207  TetR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 245 aa  55.8  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3198  TetR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 228 aa  55.8  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3260  TetR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 245 aa  55.8  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1987  TetR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 211 aa  52.8  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.15936  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0919  TetR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 215 aa  52.4  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2778  TetR family transcriptional regulator  22.78 
 
 		 205 aa  51.6  0.000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0436  transcriptional regulator, TetR family  31.65 
 
 		 230 aa  49.3  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0607  putative transcriptional regulator, TetR family  26.77 
 
 		 194 aa  49.3  0.00005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.174677  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1283  TetR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 229 aa  48.9  0.00006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.299217  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0331  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 209 aa  48.5  0.00009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1458  TetR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 209 aa  47.8  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121951 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2993  TetR family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 206 aa  47.4  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13360  transcriptional regulator, TetR family  24.87 
 
 		 215 aa  46.6  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0417905  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1061  transcriptional regulator, TetR family  30.36 
 
 		 196 aa  46.2  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0250707  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2557  TetR family transcriptional regulator  24.7 
 
 		 250 aa  45.8  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.705718  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1120  transcriptional regulator, TetR family  26.11 
 
 		 223 aa  45.4  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.917457  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  25.58 
 
 		 242 aa  45.4  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0313  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 213 aa  45.1  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0381  TetR family transcriptional regulator  25.43 
 
 		 212 aa  45.1  0.0008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3995  transcriptional regulator, TetR family  36.49 
 
 		 197 aa  45.1  0.0008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.200757  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0330  transcriptional regulator, TetR family  26.51 
 
 		 233 aa  44.7  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0194  transcriptional regulator, TetR family  31.1 
 
 		 225 aa  44.3  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3312  transcriptional regulator UidR  20.48 
 
 		 198 aa  44.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4611  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 224 aa  44.3  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4481  transcriptional regulator, TetR family  25.66 
 
 		 216 aa  44.3  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.918639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1204  transcriptional regulator, TetR family  28.21 
 
 		 206 aa  44.7  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.260768  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9073  putative transcriptional regulator, TetR family  24.62 
 
 		 193 aa  43.5  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0367  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 205 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.526712  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0377  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 205 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5607  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 209 aa  43.9  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.897418  normal  0.557491 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0130  TetR family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 212 aa  43.9  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0356  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 205 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1592  transcriptional regulator, TetR family  23.76 
 
 		 198 aa  43.9  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10279  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 241 aa  43.1  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000004651  normal  0.205699 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0518  TetR family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 206 aa  43.5  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290772  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1436  TetR family transcriptional regulator  29.12 
 
 		 197 aa  43.5  0.003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0043  regulatory protein, TetR  26.04 
 
 		 211 aa  42.7  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1114  TetR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 223 aa  42.7  0.004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4631  TetR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 232 aa  43.1  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1018  transcriptional regulator, TetR family  28.81 
 
 		 205 aa  42  0.006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4401  TetR family transcriptional regulator  20.94 
 
 		 205 aa  42.4  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00379703  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0027  TetR family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 209 aa  42  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790094 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0515  transcriptional regulator, TetR family  27.72 
 
 		 211 aa  42  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4594  TetR family transcriptional regulator  41.25 
 
 		 211 aa  42  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.780124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0904  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 222 aa  41.6  0.009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0154143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0570  TetR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 209 aa  41.6  0.009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4678  transcriptional regulator, TetR family  22.92 
 
 		 205 aa  41.6  0.01  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000014554  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>