More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1114 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE1114  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 223 aa  463  9.999999999999999e-131  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23890  transcriptional regulator  31.28 
 
 		 197 aa  89  5e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.109769  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0355  transcriptional regulator, TetR family  30.29 
 
 		 195 aa  76.6  0.0000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3750  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 230 aa  63.5  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13232  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 228 aa  58.9  0.00000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.414971 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1397  TetR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 224 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.515474  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1451  TetR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 224 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1415  TetR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 224 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2113  transcriptional regulator, TetR family  31.07 
 
 		 207 aa  56.2  0.0000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.918403  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1587  TetR family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 255 aa  55.5  0.0000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0494603  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3170  transcriptional regulator, TetR family  35.11 
 
 		 216 aa  55.1  0.0000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2242  transcriptional regulator, TetR family  41.89 
 
 		 208 aa  55.1  0.0000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0149249  normal  0.352289 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 224 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0067  TetR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 212 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000826521  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3297  TetR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 98 aa  54.7  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.368335  normal  0.535572 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1795  TetR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 224 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2495  transcriptional regulator, TetR family  25.35 
 
 		 287 aa  53.1  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0937177  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1380  transcriptional regulator, TetR family  36 
 
 		 214 aa  53.1  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000685689  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3938  transcriptional regulator, TetR family  38.16 
 
 		 231 aa  53.1  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00284915  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3546  transcriptional regulator, TetR family  35.06 
 
 		 206 aa  53.5  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.726096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2734  transcriptional regulator, TetR family  32.48 
 
 		 225 aa  53.1  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4588  transcriptional regulator, TetR family  35.56 
 
 		 206 aa  52.4  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112472 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0265  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 194 aa  52.4  0.000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.250901  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1637  transcriptional regulator, TetR family  36.62 
 
 		 193 aa  52  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.890844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0511  TetR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 194 aa  52  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2028  TetR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 222 aa  52  0.000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.578288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1898  TetR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 239 aa  51.6  0.000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.643398 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0908  TetR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 200 aa  51.2  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.376971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0750  transcriptional regulator, TetR family  26.72 
 
 		 236 aa  51.2  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0322855 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3299  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 307 aa  51.2  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0167  transcriptional regulator, TetR family  42.25 
 
 		 200 aa  51.2  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1623  transcriptional regulator, TetR family  34.21 
 
 		 205 aa  51.2  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28300  transcriptional regulator  31.4 
 
 		 280 aa  51.2  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1120  transcriptional regulator, TetR family  29.1 
 
 		 223 aa  51.2  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.917457  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3234  TetR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 228 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.20483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4729  TetR family transcriptional regulator  25.43 
 
 		 240 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0024  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 212 aa  50.8  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10308  TetR/AcrR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 210 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000336223  normal  0.125099 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4464  TetR family transcriptional regulator  24.12 
 
 		 204 aa  50.4  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0680244 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1550  transcriptional regulator, TetR family  26.17 
 
 		 201 aa  50.4  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1173  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 189 aa  50.4  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0351  TetR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 230 aa  50.8  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3024  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 197 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.101312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0257  TetR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 209 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102981 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3376  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 197 aa  50.4  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.423093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5185  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 212 aa  50.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3223  TetR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 228 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3512  regulatory protein TetR  34.07 
 
 		 237 aa  50.4  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0117  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 225 aa  50.4  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.678219 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5674  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 212 aa  50.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.166194  hitchhiker  0.00758562 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4561  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 212 aa  50.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.286179  normal  0.0846577 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  37.31 
 
 		 310 aa  50.1  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2765  regulatory protein, TetR  36 
 
 		 210 aa  50.4  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.267077  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3285  TetR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 228 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.678887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0395  regulatory protein TetR  31.91 
 
 		 211 aa  49.7  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.796791 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0340  transcriptional regulator, TetR family  48.21 
 
 		 388 aa  50.1  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2579  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 199 aa  50.1  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2285  TetR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 211 aa  49.7  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0118465  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3438  transcriptional regulator, TetR family  34.67 
 
 		 190 aa  50.1  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.547681  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2052  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 212 aa  50.1  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00634978  normal  0.379689 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3508  TetR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 227 aa  50.1  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.343043  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3531  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 199 aa  50.1  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0006  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 199 aa  50.1  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0589242  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1978  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 199 aa  50.1  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3117  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 199 aa  50.1  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.100627  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2233  transcriptional regulator, TetR family  30.85 
 
 		 246 aa  49.7  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0329344  normal  0.539811 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2917  TetR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 218 aa  50.1  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.761743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0428  transcriptional regulator, TetR family  31.91 
 
 		 211 aa  49.7  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2226  TetR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 211 aa  49.3  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0397604  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1103  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 248 aa  49.7  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.575371  normal  0.523139 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0110  transcriptional regulator, TetR family  27.04 
 
 		 225 aa  49.7  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0030  TetR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 193 aa  49.3  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.19641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5318  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 197 aa  49.3  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2304  TetR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 211 aa  49.3  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373552  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2272  TetR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 211 aa  49.3  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000566042  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2500  transcriptional regulator, TetR family  38.98 
 
 		 211 aa  49.3  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2479  TetR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 211 aa  49.3  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660065  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2575  transcriptional regulator, TetR family  38.98 
 
 		 211 aa  49.3  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000582548  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3324  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 212 aa  49.3  0.00005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.272078  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2434  transcriptional regulator, TetR family  38.98 
 
 		 211 aa  48.9  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4076  putative transcriptional regulator  28.26 
 
 		 204 aa  48.9  0.00006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.462339  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0440  TetR family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 207 aa  48.9  0.00006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3888  TetR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 193 aa  48.9  0.00007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0944552  normal  0.0941974 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3016  transcriptional regulator, TetR family  29.35 
 
 		 209 aa  48.9  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150997  normal  0.125451 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0464  transcriptional regulator, TetR family  30.85 
 
 		 211 aa  48.9  0.00007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.128175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4603  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 240 aa  48.9  0.00007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.488249 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0377  transcriptional regulator, TetR family  26.87 
 
 		 224 aa  48.9  0.00007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.294343  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2666  TetR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 213 aa  48.5  0.00008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0414  TetR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 215 aa  48.5  0.00008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.462572  normal  0.0664832 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4789  transcriptional regulator  31.11 
 
 		 212 aa  48.5  0.00009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1586  TetR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 215 aa  48.1  0.00009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.377059  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4787  transcriptional regulator, TetR family  31.11 
 
 		 212 aa  48.5  0.00009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0422575  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2249  transcriptional regulator, TetR family  34.09 
 
 		 228 aa  48.1  0.00009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.115177  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1604  AcrR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 221 aa  48.5  0.00009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.388293  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2510  TetR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 209 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00262483  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4551  transcriptional regulator, N-terminus  31.11 
 
 		 112 aa  48.1  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2440  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 190 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1392  transcriptional regulator, TetR family  29.27 
 
 		 205 aa  47.8  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1129  TetR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 231 aa  47.8  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0848  transcriptional regulator, TetR family  29.21 
 
 		 204 aa  48.1  0.0001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000568716  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>