140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4846 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4846  regulatory protein TetR  100 
 
 		 228 aa  446  1.0000000000000001e-124  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1142  transcriptional regulator, TetR family  37.88 
 
 		 236 aa  114  2.0000000000000002e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.627372  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4936  TetR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 211 aa  97.4  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1013  TetR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 209 aa  95.5  6e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.421012  normal  0.993866 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0816  TetR family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 221 aa  93.6  2e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5407  transcriptional regulator, TetR family  37.89 
 
 		 211 aa  92.8  4e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.924589  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0102  TetR family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 216 aa  87  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1073  TetR family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 222 aa  87  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1263  TetR family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 216 aa  87  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1540  TetR family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 221 aa  87  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.608661  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2819  TetR family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 222 aa  87  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2672  TetR family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 217 aa  86.7  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0121  TetR family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 216 aa  87  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3570  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 219 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.649978  decreased coverage  0.00133713 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5414  TetR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 218 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5042  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 225 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.449178  normal  0.617447 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2442  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 218 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0405  TetR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 222 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4696  TetR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 218 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3666  TetR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 218 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0498574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10840  hypothetical protein  30.94 
 
 		 213 aa  80.5  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.96162e-38  hitchhiker  0.00000829572 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3855  TetR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 213 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.898863  normal  0.650046 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0978  TetR family transcriptional regulator  32.3 
 
 		 199 aa  79.7  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3378  regulatory protein TetR  30.77 
 
 		 196 aa  79.7  0.00000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0444  transcriptional regulator, TetR family  31.94 
 
 		 222 aa  79.3  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0187  regulatory protein TetR  31.89 
 
 		 205 aa  79  0.00000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0957  TetR family transcriptional regulator  39.84 
 
 		 199 aa  78.6  0.00000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.962367  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0975  TetR family transcriptional regulator  39.84 
 
 		 199 aa  78.6  0.00000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0353361 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0432  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 222 aa  77.4  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.147068  hitchhiker  0.000000839635 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4510  TetR family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 194 aa  76.6  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.576125  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4597  TetR family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 194 aa  76.6  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.908107 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4893  TetR family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 194 aa  76.6  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0909608  normal  0.312291 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0515  transcriptional regulator, TetR family  33.87 
 
 		 211 aa  75.9  0.0000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0908  TetR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 200 aa  75.9  0.0000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.376971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3200  TetR family transcriptional regulator  33.76 
 
 		 224 aa  75.1  0.0000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.415485  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3262  TetR family transcriptional regulator  33.76 
 
 		 224 aa  75.1  0.0000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.376016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3209  TetR family transcriptional regulator  33.76 
 
 		 224 aa  75.1  0.0000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1682  putative transcriptional regulator, TetR family  27.6 
 
 		 201 aa  73.6  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.546444 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1244  TetR family transcriptional regulator  39.52 
 
 		 206 aa  73.2  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218846 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5084  TetR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 193 aa  72.8  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4918  transcriptional regulator, TetR family  35.41 
 
 		 221 aa  72.8  0.000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4630  TetR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 213 aa  71.6  0.000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22680  transcriptional regulator  33.15 
 
 		 202 aa  71.6  0.000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4594  TetR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 211 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.780124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5109  TetR family transcriptional regulator  36.72 
 
 		 201 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.313188  normal  0.176776 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4521  hypothetical protein  30.28 
 
 		 244 aa  67.8  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3198  TetR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 228 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3260  TetR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 245 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3207  TetR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 245 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0607  putative transcriptional regulator, TetR family  29.14 
 
 		 194 aa  66.6  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.174677  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0436  transcriptional regulator, TetR family  39.05 
 
 		 230 aa  66.2  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0313  TetR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 213 aa  65.1  0.0000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3563  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 203 aa  60.5  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1526  TetR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 218 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1669  TetR family transcriptional regulator  36.15 
 
 		 193 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1283  TetR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 229 aa  59.3  0.00000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.299217  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4631  TetR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 232 aa  58.9  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0331  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 209 aa  55.1  0.0000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4611  TetR family transcriptional regulator  24.7 
 
 		 224 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0367  TetR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 205 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.526712  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0377  TetR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 205 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0356  TetR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 205 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10279  TetR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 241 aa  51.6  0.000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000004651  normal  0.205699 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13324  TetR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 221 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.119785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1489  transcriptional regulator, TetR family  35.16 
 
 		 212 aa  50.1  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3265  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 206 aa  49.7  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.111309  normal  0.286417 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2901  TetR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 218 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.781877  normal  0.0527686 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5168  TetR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 215 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5790  transcriptional regulator, TetR family  25.95 
 
 		 220 aa  47.8  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0399068 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5257  TetR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 215 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5216  TetR family transcriptional regulator  43.9 
 
 		 226 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.999138  hitchhiker  0.00983469 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5549  TetR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 215 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3153  transcriptional regulator, TetR family  37.8 
 
 		 243 aa  47.4  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.12439 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0880  transcriptional regulator, TetR family  31.87 
 
 		 212 aa  47  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.987052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1647  TetR family transcriptional regulator  24.39 
 
 		 215 aa  46.6  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1288  TetR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 211 aa  46.2  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5172  TetR family transcriptional regulator  26.75 
 
 		 201 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.369972  normal  0.335335 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6158  TetR family transcriptional regulator  25.87 
 
 		 212 aa  46.6  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.488727  normal  0.104212 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4838  transcriptional regulator, TetR family  28.1 
 
 		 217 aa  45.8  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5717  transcriptional regulator, TetR family  29.2 
 
 		 197 aa  45.4  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.985195 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2740  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 257 aa  45.1  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.933804 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3073  TetR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 198 aa  45.1  0.0009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1351  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 212 aa  44.7  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2910  TetR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 215 aa  44.7  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1014  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 212 aa  44.7  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4848  TetR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 144 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4936  TetR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 144 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.725344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5197  transcriptional regulator, TetR family  31.09 
 
 		 211 aa  44.7  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128867  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1291  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 190 aa  44.7  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.170651  normal  0.326718 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0203  regulatory protein TetR  48 
 
 		 186 aa  45.1  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.041689  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1283  regulatory protein TetR  32.05 
 
 		 205 aa  45.1  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1149  transcriptional regulator, TetR family protein  30.67 
 
 		 226 aa  43.5  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1778  transcriptional regulator, TetR family  39.62 
 
 		 211 aa  44.3  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0339  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 213 aa  43.9  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.736532 
 
 
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NC_009565  TBFG_10159  TetR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 214 aa  43.9  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010322  PputGB1_2069  TetR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 198 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011729  PCC7424_2395  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 423 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.764783 
 
 
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NC_013739  Cwoe_3152  transcriptional regulator, TetR family  25.3 
 
 		 248 aa  43.9  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.262017  normal  0.121031 
 
 
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NC_012917  PC1_0836  transcriptional regulator, TetR family  33.9 
 
 		 199 aa  44.3  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013204  Elen_1392  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 205 aa  44.3  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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