270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4631 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_4631  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 232 aa  464  9.999999999999999e-131  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3198  TetR family transcriptional regulator  77.33 
 
 		 228 aa  358  4e-98  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3260  TetR family transcriptional regulator  76.65 
 
 		 245 aa  356  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3207  TetR family transcriptional regulator  76.65 
 
 		 245 aa  356  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4611  TetR family transcriptional regulator  77.23 
 
 		 224 aa  341  5.999999999999999e-93  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0957  TetR family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 199 aa  98.6  8e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.962367  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0975  TetR family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 199 aa  98.6  8e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0353361 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0978  TetR family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 199 aa  98.6  8e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3200  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 224 aa  92  7e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.415485  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3262  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 224 aa  92  7e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.376016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3209  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 224 aa  92  7e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3378  regulatory protein TetR  35 
 
 		 196 aa  91.7  9e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1244  TetR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 206 aa  91.7  9e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218846 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5407  transcriptional regulator, TetR family  31.12 
 
 		 211 aa  90.1  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.924589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4521  hypothetical protein  33.64 
 
 		 244 aa  89  5e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5109  TetR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 201 aa  87.4  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.313188  normal  0.176776 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22680  transcriptional regulator  31.09 
 
 		 202 aa  79.3  0.00000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3563  TetR family transcriptional regulator  32.83 
 
 		 203 aa  79.3  0.00000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1283  TetR family transcriptional regulator  33.53 
 
 		 229 aa  78.6  0.00000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.299217  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0816  TetR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 221 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0187  regulatory protein TetR  29.79 
 
 		 205 aa  76.6  0.0000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2901  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 218 aa  74.7  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.781877  normal  0.0527686 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4630  TetR family transcriptional regulator  30.24 
 
 		 213 aa  72.4  0.000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4510  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 194 aa  72  0.000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.576125  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4597  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 194 aa  72  0.000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.908107 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4893  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 194 aa  72  0.000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0909608  normal  0.312291 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1526  TetR family transcriptional regulator  32.4 
 
 		 218 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0331  TetR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 209 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1013  TetR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 209 aa  70.5  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.421012  normal  0.993866 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5084  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 193 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1669  TetR family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 193 aa  69.7  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4594  TetR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 211 aa  69.7  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.780124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0515  transcriptional regulator, TetR family  27.53 
 
 		 211 aa  68.9  0.00000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5042  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 225 aa  68.6  0.00000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.449178  normal  0.617447 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10279  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 241 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000004651  normal  0.205699 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0313  TetR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 213 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3570  TetR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 219 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.649978  decreased coverage  0.00133713 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2442  TetR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 218 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0607  putative transcriptional regulator, TetR family  27.55 
 
 		 194 aa  66.6  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.174677  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4936  TetR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 211 aa  66.2  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0367  TetR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 205 aa  66.2  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.526712  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0377  TetR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 205 aa  66.2  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0356  TetR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 205 aa  66.2  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3855  TetR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 213 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.898863  normal  0.650046 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4696  TetR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 218 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5414  TetR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 218 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3666  TetR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 218 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0498574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10840  hypothetical protein  25 
 
 		 213 aa  65.5  0.0000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.96162e-38  hitchhiker  0.00000829572 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0436  transcriptional regulator, TetR family  32.22 
 
 		 230 aa  64.7  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0444  transcriptional regulator, TetR family  29.28 
 
 		 222 aa  62.8  0.000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0908  TetR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 200 aa  61.6  0.000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.376971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0432  transcriptional regulator, TetR family  27.59 
 
 		 222 aa  60.5  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.147068  hitchhiker  0.000000839635 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22630  transcriptional regulator  41.33 
 
 		 202 aa  56.6  0.0000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0405  TetR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 222 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4846  regulatory protein TetR  26.09 
 
 		 228 aa  56.2  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5790  transcriptional regulator, TetR family  26.72 
 
 		 220 aa  55.5  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0399068 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0409  FadD27  28.9 
 
 		 165 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.25545  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0880  transcriptional regulator, TetR family  34.41 
 
 		 212 aa  53.5  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.987052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3152  transcriptional regulator, TetR family  29.17 
 
 		 248 aa  53.5  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.262017  normal  0.121031 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1682  putative transcriptional regulator, TetR family  31.01 
 
 		 201 aa  53.5  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.546444 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1150  TetR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 222 aa  52.8  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4599  TetR family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 220 aa  52.8  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0102  TetR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 216 aa  52  0.000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1263  TetR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 216 aa  52  0.000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1540  TetR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 221 aa  52  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.608661  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0121  TetR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 216 aa  52  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1073  TetR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 222 aa  52  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2819  TetR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 222 aa  52  0.000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2672  TetR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 217 aa  52  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3836  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 211 aa  52  0.000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4572  transcriptional regulator, TetR family  27.61 
 
 		 200 aa  51.2  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.209013  normal  0.793533 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0026  transcriptional regulator, TetR family  40.26 
 
 		 194 aa  51.2  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.348467  normal  0.209562 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3965  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 208 aa  50.4  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11350  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 220 aa  50.4  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1142  transcriptional regulator, TetR family  26.92 
 
 		 236 aa  50.4  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.627372  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3512  regulatory protein TetR  25.66 
 
 		 237 aa  51.2  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4442  TetR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 192 aa  50.1  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6228  transcriptional regulator, TetR family  28.85 
 
 		 194 aa  50.1  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.301912  normal  0.923303 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3166  transcriptional regulator, TetR family  33.75 
 
 		 234 aa  50.4  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.335744  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2165  transcriptional regulator, TetR family  29.17 
 
 		 263 aa  48.9  0.00006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3410  TetR family transcriptional regulator  27.15 
 
 		 196 aa  48.9  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000655293  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0351  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 230 aa  48.9  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5286  TetR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 196 aa  48.5  0.00009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0166031 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0659  transcriptional regulator TetR family  28.32 
 
 		 196 aa  48.5  0.00009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0906  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 232 aa  48.1  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.052988  normal  0.0196 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4404  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 213 aa  47.8  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3354  transcriptional regulator, TetR family  34.48 
 
 		 210 aa  48.1  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.216649  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3153  transcriptional regulator, TetR family  34.92 
 
 		 243 aa  48.1  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.12439 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3995  transcriptional regulator, TetR family  28.38 
 
 		 197 aa  47.8  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.200757  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1987  TetR family transcriptional regulator  25.21 
 
 		 210 aa  48.5  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0074  TetR/AcrR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 196 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1335  transcriptional regulator, TetR family  30.56 
 
 		 194 aa  47.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.293374 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4171  TetR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 203 aa  47  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0201849  hitchhiker  0.000462956 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5987  transcriptional regulator, TetR family  32.76 
 
 		 204 aa  47  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1260  transcriptional regulator, TetR family  32.98 
 
 		 222 aa  47.4  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.194739 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2297  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 305 aa  47  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0935054  hitchhiker  0.00257224 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3786  DNA-binding transcriptional repressor FabR  26.12 
 
 		 212 aa  47  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.55352  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0414  TetR family transcriptional regulator  25.45 
 
 		 215 aa  47  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.462572  normal  0.0664832 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0320  transcriptional regulator, TetR family  24.6 
 
 		 206 aa  47  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4838  transcriptional regulator, TetR family  35.53 
 
 		 217 aa  47  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>