More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_3153 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_3153  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 243 aa  481  1e-135  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.12439 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3152  transcriptional regulator, TetR family  43.89 
 
 		 248 aa  168  6e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.262017  normal  0.121031 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3166  transcriptional regulator, TetR family  44.88 
 
 		 234 aa  148  6e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.335744  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3167  transcriptional regulator, TetR family  48.3 
 
 		 213 aa  135  5e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4838  transcriptional regulator, TetR family  40.59 
 
 		 217 aa  124  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5197  transcriptional regulator, TetR family  33.51 
 
 		 211 aa  97.1  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128867  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4885  putative transcriptional regulator, TetR family  37.23 
 
 		 202 aa  96.7  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0329972  normal  0.0964504 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2521  TetR family transcriptional regulator  35.26 
 
 		 200 aa  96.7  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1840  transcriptional regulator, TetR family  36.14 
 
 		 213 aa  90.5  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0700993  normal  0.104485 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0320  transcriptional regulator, TetR family  40.71 
 
 		 206 aa  89.4  5e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1169  TetR family transcriptional regulator  39.84 
 
 		 202 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5790  transcriptional regulator, TetR family  37.41 
 
 		 220 aa  84.7  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0399068 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4572  transcriptional regulator, TetR family  37.42 
 
 		 200 aa  84.7  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.209013  normal  0.793533 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5977  transcriptional regulator, TetR family  31.68 
 
 		 271 aa  82.8  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.414781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5172  TetR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 201 aa  77.8  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.369972  normal  0.335335 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0353  transcriptional regulator, TetR family  34.15 
 
 		 228 aa  75.9  0.0000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0616658  normal  0.0838621 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2639  transcriptional regulator, TetR family  31.4 
 
 		 196 aa  75.5  0.0000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.302097  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2355  transcriptional regulator, TetR family  29.34 
 
 		 204 aa  74.7  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.284642  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  34.58 
 
 		 222 aa  72  0.000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4936  TetR family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 211 aa  68.9  0.00000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2993  TetR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 206 aa  68.2  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1914  TetR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 212 aa  67.8  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.183306 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1103  TetR family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 185 aa  65.9  0.0000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.716955  normal  0.719209 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1682  putative transcriptional regulator, TetR family  24.72 
 
 		 201 aa  63.9  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.546444 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5182  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 193 aa  63.5  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1674  TetR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 192 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.344236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5094  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 201 aa  63.2  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0170525  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1204  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 206 aa  63.2  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.260768  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10136  transcriptional regulator  28.93 
 
 		 201 aa  62  0.000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.984674 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0919  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 215 aa  61.2  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0412  TetR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 212 aa  61.6  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.417244  normal  0.216002 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1398  TetR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 191 aa  61.6  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5473  TetR family transcriptional regulator  28.39 
 
 		 193 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.906106  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3494  transcriptional regulator, TetR family  32.08 
 
 		 208 aa  60.5  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1451  TetR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 224 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4890  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 206 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.218482 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1397  TetR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 224 aa  59.7  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.515474  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  29.13 
 
 		 310 aa  60.1  0.00000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1415  TetR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 224 aa  59.7  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4507  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 224 aa  59.3  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.916577  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4594  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 224 aa  59.3  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.60513  normal  0.70435 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0452  TetR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.681881  decreased coverage  0.00000297509 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1013  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 209 aa  58.2  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.421012  normal  0.993866 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4512  transcriptional regulator, TetR family  37.04 
 
 		 188 aa  58.2  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.551086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3512  regulatory protein TetR  30.68 
 
 		 237 aa  58.2  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5079  TetR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 190 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4644  transcriptional regulator, TetR family  37.04 
 
 		 188 aa  58.2  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0446716 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1778  transcriptional regulator, TetR family  39.45 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1473  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 195 aa  57.8  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1922  transcriptional regulator, TetR family  26.82 
 
 		 201 aa  57.4  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5713  TetR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 198 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 224 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3806  TetR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 238 aa  57  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65239  normal  0.316965 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11350  transcriptional regulator  29.52 
 
 		 220 aa  56.6  0.0000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12230  transcriptional regulator  40.48 
 
 		 199 aa  57  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13232  TetR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 228 aa  56.6  0.0000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.414971 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06720  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 221 aa  56.2  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1987  TetR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.15936  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1795  TetR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 224 aa  55.8  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 216 aa  55.5  0.0000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1028  regulatory protein TetR  30.84 
 
 		 262 aa  55.5  0.0000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.190494  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9073  putative transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 193 aa  55.5  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3363  regulatory protein TetR  38.24 
 
 		 213 aa  54.7  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.268151  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3299  transcriptional regulator, TetR family  40.32 
 
 		 307 aa  54.7  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0788  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 221 aa  54.7  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.796627 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0969  TetR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 216 aa  55.1  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.19098 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4773  TetR family transcriptional regulator  22.93 
 
 		 212 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000164473  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0360  TetR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 193 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0870  transcriptional regulator, TetR family  34.35 
 
 		 186 aa  54.7  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.65823  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2089  transcriptional regulator, TetR family  33.98 
 
 		 220 aa  54.7  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0021127  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3656  TetR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 223 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3801  TetR family transcriptional regulator  23.73 
 
 		 215 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000675626  normal  0.64863 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4455  TetR family transcriptional regulator  23.73 
 
 		 215 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.10893e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2134  transcriptional regulator, TetR family  30.85 
 
 		 219 aa  54.3  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00399747  normal  0.0273951 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6345  transcriptional regulator, TetR family  27.81 
 
 		 241 aa  54.3  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1142  transcriptional regulator, TetR family  26.13 
 
 		 236 aa  53.9  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.627372  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4588  transcriptional regulator, TetR family  28.79 
 
 		 206 aa  53.9  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112472 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1120  transcriptional regulator, TetR family  30.68 
 
 		 223 aa  53.9  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.917457  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1940  TetR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 198 aa  54.3  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.688335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0381  TetR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 212 aa  53.9  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4251  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 216 aa  54.3  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22701  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4747  transcriptional regulator, TetR family  23.73 
 
 		 215 aa  54.3  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000342659  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0518  TetR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 206 aa  53.5  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290772  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2497  transcriptional regulator, TetR family  25.44 
 
 		 221 aa  53.1  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000693939 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2327  transcriptional regulator, TetR family  30.87 
 
 		 192 aa  53.9  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.215572  normal  0.48242 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1689  transcriptional regulator, TetR family  28.4 
 
 		 199 aa  53.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.403978 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3637  TetR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 228 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04039  hypothetical protein  23.16 
 
 		 215 aa  53.5  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000282396  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3839  TetR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 251 aa  53.1  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0828  transcriptional regulator, TetR family  21.18 
 
 		 195 aa  53.1  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1218  TetR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 206 aa  52.8  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4813  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 223 aa  52.8  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4004  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 196 aa  52.4  0.000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.638592  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0583  TetR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 205 aa  52.4  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3834  TetR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 216 aa  52.4  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000963392 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1496  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 206 aa  52.4  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5693  transcriptional regulator, TetR family  31.37 
 
 		 211 aa  52.4  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0563608  normal  0.866587 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  46.03 
 
 		 218 aa  52.4  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2592  transcriptional regulator, TetR family  35.94 
 
 		 192 aa  52.4  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.119823  normal  0.0690788 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0432  transcriptional regulator, TetR family  31.43 
 
 		 222 aa  52  0.000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.147068  hitchhiker  0.000000839635 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>