More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3995 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3995  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 197 aa  380  1e-105  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.200757  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5987  transcriptional regulator, TetR family  42 
 
 		 204 aa  119  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0397  transcriptional regulator, TetR family  37.3 
 
 		 211 aa  92  4e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0669765  normal  0.062689 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9154  putative transcriptional regulator, TetR family  41.28 
 
 		 226 aa  90.9  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.231214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1116  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 209 aa  79.3  0.00000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.863597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3219  transcriptional regulator, TetR family  39.26 
 
 		 215 aa  79  0.00000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1428  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 204 aa  74.7  0.0000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.530378  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2217  TetR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 210 aa  73.2  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1264  TetR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 206 aa  72  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.599329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2460  TetR family transcriptional regulator  35.26 
 
 		 201 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.315446  normal  0.37249 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1969  TetR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 205 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0320964 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6341  TetR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 206 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0497044  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1738  TetR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 206 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1751  TetR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 206 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1225  TetR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 208 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.657492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2257  TetR family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 202 aa  68.6  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.92818  normal  0.36633 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0518  TetR family transcriptional regulator  46.97 
 
 		 206 aa  68.2  0.00000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290772  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2327  TetR family transcriptional regulator  32.57 
 
 		 199 aa  68.2  0.00000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.194102 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  43.21 
 
 		 222 aa  68.2  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3938  transcriptional regulator, TetR family  29.89 
 
 		 231 aa  67.8  0.00000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00284915  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2461  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 234 aa  67.8  0.00000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.460998  normal  0.536684 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0483  transcriptional regulator, TetR family  29.44 
 
 		 226 aa  67.8  0.00000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2291  transcriptional regulator, TetR family  32.97 
 
 		 205 aa  67  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.857741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0919  TetR family transcriptional regulator  46.25 
 
 		 215 aa  67  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4194  TetR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 201 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1032  TetR family transcriptional regulator  30.64 
 
 		 208 aa  66.6  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2993  TetR family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 206 aa  65.9  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3021  regulatory protein, TetR  31.33 
 
 		 205 aa  66.2  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.84883  normal  0.636371 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2373  TetR family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 205 aa  65.9  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1204  transcriptional regulator, TetR family  45.45 
 
 		 206 aa  66.2  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.260768  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3806  TetR family transcriptional regulator  33.53 
 
 		 238 aa  65.5  0.0000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65239  normal  0.316965 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3512  regulatory protein TetR  42.19 
 
 		 237 aa  65.5  0.0000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7816  transcriptional regulator, TetR family  40.51 
 
 		 216 aa  64.7  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1493  transcriptional regulator, TetR family  36.13 
 
 		 198 aa  64.3  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.127102 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3354  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 210 aa  63.9  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.216649  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1665  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 223 aa  63.2  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117381  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2996  TetR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 237 aa  63.5  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2431  TetR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 214 aa  62.8  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0857946 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1521  TetR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 206 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.375612 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0830  transcriptional regulator, TetR family  46.43 
 
 		 214 aa  62.4  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0452  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 212 aa  62.4  0.000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.681881  decreased coverage  0.00000297509 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3722  TetR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 202 aa  62  0.000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.869277  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3795  TetR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 202 aa  62  0.000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.796114  normal  0.124585 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2962  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 201 aa  62  0.000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0027  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 209 aa  62  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790094 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1496  transcriptional regulator, TetR family  33.92 
 
 		 206 aa  61.6  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0381  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 212 aa  61.2  0.000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1515  putative transcriptional regulator, TetR family  45 
 
 		 219 aa  60.8  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254086  hitchhiker  0.00363064 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2672  TetR family transcriptional regulator  33.92 
 
 		 208 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15710  transcriptional regulator  29.44 
 
 		 221 aa  60.5  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.274511  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1473  TetR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 195 aa  60.5  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4215  TetR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 269 aa  61.2  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.261755 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0335  transcriptional regulator, TetR family  34.3 
 
 		 197 aa  59.7  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0635756  normal  0.0355079 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4251  transcriptional regulator, TetR family  40.91 
 
 		 216 aa  60.5  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22701  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0429  TetR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 213 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0148562 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0583  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 205 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4588  transcriptional regulator, TetR family  39.39 
 
 		 206 aa  60.1  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112472 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1120  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 223 aa  60.1  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.917457  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4193  TetR family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 200 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0543  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 203 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.889127 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3734  TetR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 202 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0165853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06720  transcriptional regulator, TetR family  40.62 
 
 		 221 aa  59.3  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1146  TetR family transcriptional regulator  28.31 
 
 		 216 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.390773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1150  TetR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 222 aa  59.7  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5463  transcriptional regulator, TetR family  28.67 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1719  transcriptional regulator, TetR family  30.46 
 
 		 196 aa  58.9  0.00000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3438  transcriptional regulator, TetR family  43.94 
 
 		 190 aa  59.3  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.547681  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4931  TetR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 497 aa  58.9  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.475051  normal  0.080695 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0795  TetR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 199 aa  59.3  0.00000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00985009  normal  0.205797 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3312  transcriptional regulator UidR  29.75 
 
 		 198 aa  59.3  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3035  transcriptional regulator, TetR family  34.31 
 
 		 219 aa  58.5  0.00000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.514093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0908  transcriptional regulator, TetR family  34.48 
 
 		 207 aa  58.5  0.00000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469028  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0144  TetR family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 224 aa  58.9  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.522541  decreased coverage  0.0000264507 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5045  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 206 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.906168  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5815  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 206 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0955  TetR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 212 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2294  TetR family regulatory protein  30.6 
 
 		 206 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1397  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 224 aa  58.5  0.00000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.515474  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3724  TetR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 200 aa  58.5  0.00000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.29601  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1415  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 224 aa  58.5  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3797  TetR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 200 aa  58.5  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.388195  normal  0.0386626 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0686  transcriptional regulator, TetR family  28.43 
 
 		 247 aa  58.5  0.00000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2102  TetR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 206 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.526616  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2161  TetR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 206 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.720901  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1451  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 224 aa  58.5  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3736  TetR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 200 aa  58.5  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.042499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1845  transcriptional regulator, TetR family  26.9 
 
 		 211 aa  58.5  0.00000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.025211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0059  transcriptional regulator, TetR family  25.95 
 
 		 194 aa  58.2  0.00000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00007304  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0994  transcriptional regulator, TetR family  38.27 
 
 		 271 aa  58.2  0.00000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0145  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 202 aa  58.2  0.00000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.437687  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30610  transcriptional regulator  39.39 
 
 		 201 aa  58.2  0.00000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0949  transcriptional regulator, TetR family  39.39 
 
 		 286 aa  58.2  0.00000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28300  transcriptional regulator  37.11 
 
 		 280 aa  58.2  0.00000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13232  TetR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 228 aa  58.2  0.00000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.414971 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 224 aa  57.8  0.00000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5034  TetR family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 206 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.553825 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 216 aa  57.4  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0507  TetR family transcriptional regulator  51.85 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.982351 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3524  TetR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 187 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1709  transcriptional regulator, TetR family  27.01 
 
 		 198 aa  57.4  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>