More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_0320 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_0320  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 206 aa  400  1e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5172  TetR family transcriptional regulator  43.43 
 
 		 201 aa  154  8e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.369972  normal  0.335335 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1169  TetR family transcriptional regulator  39.11 
 
 		 202 aa  142  3e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5197  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 211 aa  136  3.0000000000000003e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128867  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4838  transcriptional regulator, TetR family  43.79 
 
 		 217 aa  120  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3152  transcriptional regulator, TetR family  41.22 
 
 		 248 aa  113  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.262017  normal  0.121031 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4572  transcriptional regulator, TetR family  39.41 
 
 		 200 aa  91.7  7e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.209013  normal  0.793533 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3166  transcriptional regulator, TetR family  43.94 
 
 		 234 aa  87.4  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.335744  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5790  transcriptional regulator, TetR family  37.18 
 
 		 220 aa  87.8  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0399068 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3167  transcriptional regulator, TetR family  50.44 
 
 		 213 aa  84.7  9e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1840  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 213 aa  80.1  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0700993  normal  0.104485 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3153  transcriptional regulator, TetR family  40.71 
 
 		 243 aa  78.2  0.00000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.12439 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2521  TetR family transcriptional regulator  37.4 
 
 		 200 aa  76.6  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2355  transcriptional regulator, TetR family  37.17 
 
 		 204 aa  76.3  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.284642  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4885  putative transcriptional regulator, TetR family  36 
 
 		 202 aa  69.7  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0329972  normal  0.0964504 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5473  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 193 aa  66.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.906106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5094  TetR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 201 aa  64.7  0.0000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0170525  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5182  TetR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 193 aa  64.7  0.0000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1914  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 212 aa  63.2  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.183306 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0353  transcriptional regulator, TetR family  33.02 
 
 		 228 aa  61.6  0.000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0616658  normal  0.0838621 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5977  transcriptional regulator, TetR family  30.91 
 
 		 271 aa  59.7  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.414781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10136  transcriptional regulator  30.77 
 
 		 201 aa  58.9  0.00000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.984674 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5713  TetR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 198 aa  58.2  0.00000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3689  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 213 aa  57.8  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5693  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0563608  normal  0.866587 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1103  TetR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 185 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.716955  normal  0.719209 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1922  transcriptional regulator, TetR family  31.68 
 
 		 201 aa  57  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1473  TetR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 195 aa  56.6  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4588  transcriptional regulator, TetR family  29.69 
 
 		 206 aa  55.5  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112472 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2639  transcriptional regulator, TetR family  28.91 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.302097  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4215  TetR family transcriptional regulator  26.01 
 
 		 269 aa  54.3  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.261755 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0919  TetR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 215 aa  54.3  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3836  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 211 aa  54.7  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1955  transcriptional regulator, TetR family  29.36 
 
 		 202 aa  53.5  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.22623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0518  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 206 aa  53.1  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290772  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5987  transcriptional regulator, TetR family  37.93 
 
 		 204 aa  52.8  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0313  TetR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 202 aa  53.1  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.121906  hitchhiker  0.00929139 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1451  TetR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 224 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1086  transcriptional regulator, TetR family  33.06 
 
 		 239 aa  52.4  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.566372  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3846  transcriptional regulator, TetR family  30.94 
 
 		 206 aa  52.8  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.213396  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0027  TetR family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 209 aa  52.8  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790094 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1674  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 192 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.344236  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3806  TetR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 238 aa  52.8  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65239  normal  0.316965 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1397  TetR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 224 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.515474  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1415  TetR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 224 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4222  TetR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 221 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.42669  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4288  TetR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 221 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.458199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4600  TetR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 221 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0411306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2816  TetR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 192 aa  52  0.000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0557  regulatory protein TetR  30.77 
 
 		 251 aa  52  0.000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3260  TetR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 245 aa  51.6  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0477  TetR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 211 aa  52  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178939  normal  0.0289146 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5079  TetR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 190 aa  52  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3207  TetR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 245 aa  51.6  0.000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0888  TetR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 203 aa  51.6  0.000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3198  TetR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 228 aa  51.6  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C37  transcriptional regulator  28.99 
 
 		 191 aa  51.6  0.000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4890  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 206 aa  51.2  0.000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.218482 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0626  TetR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 215 aa  50.8  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2497  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 221 aa  51.2  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000693939 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10440  transcriptional regulator  28.97 
 
 		 211 aa  51.2  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0189255  normal  0.0235057 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0092  transcriptional regulator, TetR family  27.66 
 
 		 207 aa  50.8  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00302716  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2444  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 217 aa  51.2  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4507  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 224 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.916577  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4594  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 224 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.60513  normal  0.70435 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3960  TetR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 201 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110455  normal  0.471806 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1381  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 184 aa  50.4  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.419771  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0503  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 376 aa  50.4  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  23.62 
 
 		 224 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2304  transcriptional regulator, TetR family  36.14 
 
 		 201 aa  50.8  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2482  transcriptional regulator, TetR family  29.92 
 
 		 196 aa  50.1  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1866  TetR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 201 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.115406 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1795  TetR family transcriptional regulator  22.83 
 
 		 224 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11350  transcriptional regulator  29.79 
 
 		 220 aa  50.1  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4693  transcriptional regulator  30.08 
 
 		 227 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13232  TetR family transcriptional regulator  24.07 
 
 		 228 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.414971 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6228  transcriptional regulator, TetR family  28.9 
 
 		 194 aa  50.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.301912  normal  0.923303 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00759  transcriptional regulator, TetR family protein  25.44 
 
 		 224 aa  50.1  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2739  transcriptional regulator, TetR family  27.59 
 
 		 225 aa  50.1  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000589766  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0662  TetR family transcriptional regulator  24.51 
 
 		 205 aa  49.7  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0228  TetR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 205 aa  49.7  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.728602  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2495  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 287 aa  49.3  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0937177  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5159  transcriptional regulator, TetR family  29.73 
 
 		 202 aa  49.3  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3071  TetR family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 210 aa  49.3  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2116  transcriptional regulator, TetR family  33.75 
 
 		 192 aa  49.3  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7136  transcriptional regulator, TetR family  31.91 
 
 		 237 aa  48.9  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00720754  normal  0.217815 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2692  TetR family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 195 aa  48.9  0.00005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.728372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0381  TetR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 212 aa  48.9  0.00006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9073  putative transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 193 aa  48.5  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0452  TetR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 212 aa  48.9  0.00006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.681881  decreased coverage  0.00000297509 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4364  TetR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 206 aa  48.9  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0433  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 204 aa  48.5  0.00006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.376909  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1551  TetR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 227 aa  48.5  0.00007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.386957  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2993  TetR family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 206 aa  48.5  0.00007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5710  TetR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 222 aa  48.5  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.572132  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47240  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 204 aa  48.5  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53550  transcriptional regulator  29.32 
 
 		 227 aa  48.5  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00980972  decreased coverage  0.0000958508 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1204  transcriptional regulator, TetR family  30.65 
 
 		 206 aa  48.5  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.260768  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1045  transcriptional regulator, TetR family  29.2 
 
 		 203 aa  48.1  0.00008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00830488  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1013  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 209 aa  48.1  0.00009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.421012  normal  0.993866 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>