More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1150 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_1150  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 222 aa  444  1.0000000000000001e-124  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3781  TetR family transcriptional regulator  35.47 
 
 		 214 aa  103  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5773  TetR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 198 aa  102  4e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6138  TetR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 198 aa  102  4e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.890581 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7672  TetR family transcriptional regulator  34.24 
 
 		 198 aa  102  6e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.245363  normal  0.688993 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0429  TetR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 213 aa  100  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0148562 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1665  transcriptional regulator, TetR family  31.9 
 
 		 223 aa  97.8  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117381  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0464  transcriptional regulator, TetR family  37.1 
 
 		 211 aa  97.4  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.128175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6941  transcriptional regulator, TetR family  35.56 
 
 		 221 aa  92.4  5e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3312  transcriptional regulator UidR  37.18 
 
 		 198 aa  92.4  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0395  regulatory protein TetR  34.95 
 
 		 211 aa  90.5  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.796791 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0428  transcriptional regulator, TetR family  34.41 
 
 		 211 aa  87.4  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1493  transcriptional regulator, TetR family  34.95 
 
 		 198 aa  87.4  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.127102 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0018  TetR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 196 aa  85.9  5e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7736  putative transcriptional regulator, TetR family  44.25 
 
 		 205 aa  82.4  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.97147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6228  transcriptional regulator, TetR family  32.57 
 
 		 194 aa  80.1  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.301912  normal  0.923303 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1826  transcriptional regulator UidR  32.69 
 
 		 196 aa  79  0.00000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1805  transcriptional regulator UidR  32.69 
 
 		 196 aa  79  0.00000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.947665  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01587  DNA-binding transcriptional repressor  32.69 
 
 		 196 aa  77.8  0.0000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2024  transcriptional regulator, TetR family  32.69 
 
 		 192 aa  77.8  0.0000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.180766  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1693  transcriptional regulator UidR  32.69 
 
 		 196 aa  77.8  0.0000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1581  transcriptional regulator UidR  32.69 
 
 		 192 aa  77.8  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01577  hypothetical protein  32.69 
 
 		 196 aa  77.8  0.0000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.98021  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2330  transcriptional regulator UidR  32.69 
 
 		 195 aa  77.8  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1090  transcriptional regulator, TetR family  62.07 
 
 		 204 aa  77.8  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.141216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2012  TetR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 196 aa  77.8  0.0000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.952906  normal  0.615913 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1372  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 212 aa  76.3  0.0000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00027491 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2134  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 205 aa  75.5  0.0000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.269562  normal  0.11419 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4024  TetR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 199 aa  75.5  0.0000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.497962  normal  0.530155 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2111  transcriptional regulator, TetR family  32.92 
 
 		 214 aa  73.6  0.000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.780559 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1173  regulatory protein, TetR  31.84 
 
 		 202 aa  73.2  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.959952 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5076  TetR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 209 aa  71.6  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5784  TetR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 209 aa  71.6  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.907377 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4394  TetR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 198 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3998  transcriptional regulator, TetR family  32.98 
 
 		 205 aa  71.2  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0825494  normal  0.0160725 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1015  transcriptional regulator, TetR family  32.19 
 
 		 201 aa  69.3  0.00000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1333  TetR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 201 aa  68.9  0.00000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.103575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1426  transcriptional regulator, TetR family  45.45 
 
 		 204 aa  68.9  0.00000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0803354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1419  TetR family transcriptional regulator  43.44 
 
 		 220 aa  68.6  0.00000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1843  transcriptional regulatory protein  37.1 
 
 		 201 aa  67.8  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.677238  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2962  TetR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 201 aa  67  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2697  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 202 aa  66.2  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1719  transcriptional regulator, TetR family  35.93 
 
 		 196 aa  65.5  0.0000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1926  transcriptional regulator EefR  31.72 
 
 		 188 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0902915  hitchhiker  0.0000000455593 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1837  transcriptional regulator EefR  31.72 
 
 		 188 aa  63.5  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000033131 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0880  transcriptional regulator, TetR family  44.62 
 
 		 212 aa  62  0.000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.987052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0626  TetR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 199 aa  61.2  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4887  putative TetR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 191 aa  61.6  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0109337  normal  0.0985913 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0184  TetR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 335 aa  61.6  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000505732  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22050  transcriptional regulator  36.44 
 
 		 199 aa  60.8  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0903673 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0455  TetR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 224 aa  60.5  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366206  normal  0.106872 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3459  TetR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 324 aa  60.1  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3416  transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 226 aa  59.7  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.180038  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13760  transcriptional regulator, tetR family  29.63 
 
 		 192 aa  60.1  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.484561  normal  0.0851511 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22500  transcriptional regulator, TetR family  27.49 
 
 		 199 aa  60.1  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.589103  normal  0.921764 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2292  transcriptional regulator, TetR family  41.18 
 
 		 186 aa  59.3  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.030142  hitchhiker  0.00610108 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3212  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 223 aa  59.7  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.59703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5205  TetR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 235 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.155344  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3714  transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 226 aa  59.3  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.576002 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5654  TetR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 235 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.346197  normal  0.300572 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4298  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 233 aa  59.3  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.530374  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4581  TetR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 235 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000712688 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3443  TetR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.61751 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4533  TetR family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 218 aa  59.3  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.505005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4973  TetR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 201 aa  58.9  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0231413  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8200  putative transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 237 aa  58.9  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.53611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2853  TetR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 213 aa  58.5  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.788684  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0817  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 332 aa  58.5  0.00000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1745  TetR family transcriptional regulator  39.05 
 
 		 216 aa  58.5  0.00000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1792  TetR family transcriptional regulator  39.05 
 
 		 216 aa  58.5  0.00000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.651799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1726  TetR family transcriptional regulator  39.05 
 
 		 216 aa  58.5  0.00000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.379747  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3995  transcriptional regulator, TetR family  48.15 
 
 		 197 aa  58.2  0.00000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.200757  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2179  TetR family transcriptional regulator  40.78 
 
 		 218 aa  57.8  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2948  TetR family transcriptional regulator  26.86 
 
 		 191 aa  58.2  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0700  TetR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 178 aa  58.2  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2327  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 199 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.194102 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3319  transcriptional regulator, TetR family  30.14 
 
 		 214 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00311946  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1428  TetR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 204 aa  57  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.530378  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2477  transcriptional regulator, TetR family  40.28 
 
 		 190 aa  57.4  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1440  TetR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 213 aa  57.4  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0208928 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2513  transcriptional regulator, TetR family  49.02 
 
 		 199 aa  56.6  0.0000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0091  HTH-type transcriptional regulator, TetR family  40.62 
 
 		 199 aa  56.6  0.0000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.903201  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2980  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 203 aa  56.6  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0457  TetR family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2120  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 198 aa  56.6  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 190 aa  55.8  0.0000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0432  transcriptional regulator, TetR family  40.51 
 
 		 214 aa  55.8  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0796504  hitchhiker  0.00000000967411 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4466  transcriptional regulator, TetR family  29.61 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.575375  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04680  transcriptional regulator  52.94 
 
 		 225 aa  56.2  0.0000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2257  TetR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 202 aa  55.8  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.92818  normal  0.36633 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3066  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 190 aa  55.8  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.122558 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3500  transcriptional regulator, TetR family  47.17 
 
 		 209 aa  55.8  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00016281 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1772  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 202 aa  55.8  0.0000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.706828  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00350  transcriptional regulator  43.55 
 
 		 199 aa  55.8  0.0000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0027  TetR family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790094 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0270  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 192 aa  55.5  0.0000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.522665  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0255  transcriptional regulator, TetR family  40.51 
 
 		 243 aa  55.5  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.540416  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 190 aa  55.1  0.0000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4644  transcriptional regulator, TetR family  33.68 
 
 		 188 aa  55.5  0.0000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0446716 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>