More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3998 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_3998  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 205 aa  404  1.0000000000000001e-112  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0825494  normal  0.0160725 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7736  putative transcriptional regulator, TetR family  35.78 
 
 		 205 aa  116  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.97147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2134  TetR family transcriptional regulator  34.47 
 
 		 205 aa  106  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.269562  normal  0.11419 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1173  regulatory protein, TetR  38.94 
 
 		 202 aa  106  3e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.959952 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1090  transcriptional regulator, TetR family  35.1 
 
 		 204 aa  102  5e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.141216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1843  transcriptional regulatory protein  34.85 
 
 		 201 aa  99  5e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.677238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1426  transcriptional regulator, TetR family  33.15 
 
 		 204 aa  89.7  3e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0803354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6228  transcriptional regulator, TetR family  30.85 
 
 		 194 aa  89.4  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.301912  normal  0.923303 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0369  transcriptional regulator, TetR family  30.1 
 
 		 204 aa  83.2  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.238864 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1015  transcriptional regulator, TetR family  30.65 
 
 		 201 aa  81.3  0.000000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22050  transcriptional regulator  33.51 
 
 		 199 aa  79.7  0.00000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0903673 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00350  transcriptional regulator  31.73 
 
 		 199 aa  77.8  0.0000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7672  TetR family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 198 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.245363  normal  0.688993 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5773  TetR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 198 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6138  TetR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 198 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.890581 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1665  transcriptional regulator, TetR family  30.35 
 
 		 223 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117381  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1150  TetR family transcriptional regulator  46.81 
 
 		 222 aa  70.5  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0429  TetR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 213 aa  69.3  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0148562 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1372  TetR family transcriptional regulator  56.36 
 
 		 212 aa  67.4  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00027491 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0018  TetR family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 196 aa  66.6  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0700  TetR family transcriptional regulator  48.48 
 
 		 178 aa  65.5  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1926  transcriptional regulator EefR  57.69 
 
 		 188 aa  64.7  0.0000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0902915  hitchhiker  0.0000000455593 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1837  transcriptional regulator EefR  57.69 
 
 		 188 aa  64.7  0.0000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000033131 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2477  transcriptional regulator, TetR family  44.62 
 
 		 190 aa  64.7  0.0000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3469  transcriptional regulator, TetR family  29.02 
 
 		 219 aa  63.5  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.930137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3312  transcriptional regulator UidR  29.61 
 
 		 198 aa  63.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0626  TetR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 199 aa  63.2  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2200  transcriptional regulator, TetR family  26.37 
 
 		 203 aa  63.2  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0428  transcriptional regulator, TetR family  50.91 
 
 		 211 aa  62.4  0.000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0464  transcriptional regulator, TetR family  50.91 
 
 		 211 aa  62  0.000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.128175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4024  TetR family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 199 aa  62.4  0.000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.497962  normal  0.530155 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0899  TetR family transcriptional regulator  24.73 
 
 		 193 aa  62.4  0.000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.494549  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2513  transcriptional regulator, TetR family  54.24 
 
 		 199 aa  62.4  0.000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0395  regulatory protein TetR  50.91 
 
 		 211 aa  62  0.000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.796791 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5076  TetR family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 209 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4336  TetR family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 210 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.426629 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5784  TetR family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 209 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.907377 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3781  TetR family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 214 aa  61.2  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1493  transcriptional regulator, TetR family  48.39 
 
 		 198 aa  60.8  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.127102 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2502  transcriptional regulator, TetR family  38.81 
 
 		 291 aa  61.2  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4426  TetR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 210 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.062473  normal  0.279059 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3352  transcriptional regulator, TetR family  30.22 
 
 		 183 aa  60.5  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0512596  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2111  transcriptional regulator, TetR family  35.48 
 
 		 214 aa  60.5  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.780559 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4394  TetR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 198 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1387  TetR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.649854  normal  0.844436 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0444  TetR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 220 aa  58.9  0.00000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.275459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0707  TetR family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 219 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1398  transcriptional regulator, TetR family  41.51 
 
 		 195 aa  58.2  0.00000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2695  transcriptional regulator, TetR family  36.56 
 
 		 185 aa  58.2  0.00000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000333836  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1428  TetR family transcriptional regulator  28.34 
 
 		 204 aa  58.2  0.00000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.530378  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16270  transcriptional regulator  26.37 
 
 		 287 aa  58.2  0.00000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3449  TetR family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 209 aa  58.2  0.00000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.772262  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2292  transcriptional regulator, TetR family  40.62 
 
 		 186 aa  57.4  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.030142  hitchhiker  0.00610108 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0316  putative transcriptional regulator, TetR family  53.06 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2996  TetR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 237 aa  57.8  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4608  TetR family transcriptional regulator  33.76 
 
 		 206 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.198377  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6941  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 221 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2980  TetR family transcriptional regulator  54.72 
 
 		 203 aa  57.4  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0949  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 286 aa  57  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2922  transcriptional regulator, TetR family  28 
 
 		 204 aa  57  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.404278 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 196 aa  57  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1027  TetR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 210 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1941  transcriptional regulator, TetR family  37.88 
 
 		 194 aa  57  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000874649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1191  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 198 aa  56.6  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0432  transcriptional regulator, TetR family  29.38 
 
 		 214 aa  56.6  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0796504  hitchhiker  0.00000000967411 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3293  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 190 aa  56.6  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00124137 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1719  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 196 aa  56.2  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3066  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 190 aa  56.6  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.122558 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0332  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 208 aa  55.8  0.0000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0255  transcriptional regulator, TetR family  29.38 
 
 		 243 aa  56.2  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.540416  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0726  transcriptional regulator, TetR family  34.85 
 
 		 203 aa  55.8  0.0000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2067  TetR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 216 aa  55.8  0.0000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22500  transcriptional regulator, TetR family  39.71 
 
 		 199 aa  55.8  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.589103  normal  0.921764 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1381  transcriptional regulator, TetR family  27.08 
 
 		 184 aa  55.8  0.0000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.419771  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  28.09 
 
 		 242 aa  55.8  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3259  transcriptional regulator, TetR family  27.81 
 
 		 219 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.147915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1056  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 205 aa  55.5  0.0000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0248365  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11567  transcriptional regulator  37.5 
 
 		 225 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05020  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 194 aa  55.8  0.0000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  31.11 
 
 		 230 aa  55.5  0.0000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1333  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 201 aa  55.5  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.103575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1419  TetR family transcriptional regulator  49.18 
 
 		 220 aa  55.1  0.0000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1826  transcriptional regulator UidR  24.48 
 
 		 196 aa  55.1  0.0000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1805  transcriptional regulator UidR  24.48 
 
 		 196 aa  55.1  0.0000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.947665  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4300  transcriptional regulator  30.51 
 
 		 225 aa  55.1  0.0000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2962  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 201 aa  54.7  0.0000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24090  transcriptional regulator  31.64 
 
 		 209 aa  54.7  0.0000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01587  DNA-binding transcriptional repressor  25.52 
 
 		 196 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2024  transcriptional regulator, TetR family  25.52 
 
 		 192 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.180766  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2012  TetR family transcriptional regulator  25.52 
 
 		 196 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.952906  normal  0.615913 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0806  transcriptional regulator, TetR family  43.86 
 
 		 202 aa  54.3  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.265645  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4873  transcriptional regulator, TetR family  29.63 
 
 		 193 aa  54.3  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1581  transcriptional regulator UidR  25.52 
 
 		 192 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01577  hypothetical protein  25.52 
 
 		 196 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.98021  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1668  TetR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 204 aa  54.7  0.000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4111  regulatory protein, TetR  27.49 
 
 		 211 aa  53.9  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.856223  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1098  TetR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 209 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0976848 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1693  transcriptional regulator UidR  25.52 
 
 		 196 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3604  TetR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 207 aa  54.3  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.461648 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3405  TetR family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 207 aa  53.9  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0751749 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>