More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1120 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1120  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 223 aa  447  1e-125  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.917457  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3512  regulatory protein TetR  68.34 
 
 		 237 aa  292  3e-78  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  65.15 
 
 		 224 aa  261  4.999999999999999e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13232  TetR family transcriptional regulator  61.78 
 
 		 228 aa  260  1e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.414971 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1795  TetR family transcriptional regulator  64.14 
 
 		 224 aa  259  2e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1397  TetR family transcriptional regulator  60.18 
 
 		 224 aa  255  4e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.515474  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1415  TetR family transcriptional regulator  60.18 
 
 		 224 aa  255  4e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1451  TetR family transcriptional regulator  64.29 
 
 		 224 aa  252  3e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06720  transcriptional regulator, TetR family  56.32 
 
 		 221 aa  216  2.9999999999999998e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0452  TetR family transcriptional regulator  52.53 
 
 		 212 aa  213  9.999999999999999e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.681881  decreased coverage  0.00000297509 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0381  TetR family transcriptional regulator  52.53 
 
 		 212 aa  212  4.9999999999999996e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2134  transcriptional regulator, TetR family  52.66 
 
 		 219 aa  211  7e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00399747  normal  0.0273951 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0919  TetR family transcriptional regulator  52.09 
 
 		 215 aa  211  7.999999999999999e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3806  TetR family transcriptional regulator  51.74 
 
 		 238 aa  209  3e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65239  normal  0.316965 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4588  transcriptional regulator, TetR family  51.01 
 
 		 206 aa  208  4e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112472 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2993  TetR family transcriptional regulator  52.58 
 
 		 206 aa  207  1e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0830  transcriptional regulator, TetR family  54.25 
 
 		 214 aa  204  8e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7816  transcriptional regulator, TetR family  51.53 
 
 		 216 aa  202  4e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1204  transcriptional regulator, TetR family  52.82 
 
 		 206 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.260768  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4251  transcriptional regulator, TetR family  50.75 
 
 		 216 aa  196  2.0000000000000003e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22701  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  48.97 
 
 		 222 aa  192  4e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0518  TetR family transcriptional regulator  49.49 
 
 		 206 aa  187  1e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290772  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2497  transcriptional regulator, TetR family  45.24 
 
 		 221 aa  174  7e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000693939 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1473  TetR family transcriptional regulator  45.36 
 
 		 195 aa  174  8e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3827  transcriptional regulator, TetR family  49.44 
 
 		 212 aa  166  2.9999999999999998e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.31638 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2775  TetR family transcriptional regulator  46.11 
 
 		 228 aa  165  5e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0212844  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4247  TetR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 212 aa  107  1e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4333  TetR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 212 aa  107  1e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.771402  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4626  TetR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 212 aa  107  1e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0305  transcriptional regulator, TetR family  36.04 
 
 		 215 aa  105  8e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.437849  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11350  transcriptional regulator  33.84 
 
 		 220 aa  102  3e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15250  transcriptional regulator, tetR family  37.97 
 
 		 218 aa  103  3e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.110377  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4778  TetR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 217 aa  102  7e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0731  TetR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 227 aa  101  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250469 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1947  TetR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 197 aa  100  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0787  regulatory protein, TetR  31.53 
 
 		 226 aa  100  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27670  transcriptional regulator  40.97 
 
 		 254 aa  97.8  1e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.208365 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1558  regulatory protein TetR  31.16 
 
 		 220 aa  97.4  1e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11037  TetR family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 197 aa  96.7  2e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.102388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0166  transcriptional regulator, TetR family  33.68 
 
 		 221 aa  94.7  9e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0611363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2710  transcriptional regulator, TetR family  31.43 
 
 		 218 aa  92.8  4e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.448517  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3992  transcriptional regulator, TetR family  31.44 
 
 		 218 aa  91.7  8e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0931  transcriptional regulator, TetR family  32.2 
 
 		 215 aa  91.7  9e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.588864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  31.84 
 
 		 205 aa  91.3  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0994  transcriptional regulator, TetR family  30.88 
 
 		 271 aa  90.9  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0872  transcriptional regulator, TetR family  30.46 
 
 		 211 aa  90.9  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.678947 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0564  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 203 aa  90.5  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0194  transcriptional regulator, TetR family  33.51 
 
 		 225 aa  89.4  4e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1944  transcriptional regulator, TetR family  34.38 
 
 		 205 aa  89.4  4e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00538978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28930  transcriptional regulator  31.12 
 
 		 205 aa  88.2  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.218384 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3157  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 330 aa  87  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3183  transcriptional regulator, TetR family  31.19 
 
 		 220 aa  86.3  3e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8610  putative transcriptional regulator, TetR family  31.22 
 
 		 317 aa  86.3  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 216 aa  85.9  5e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2475  transcriptional regulator, TetR family  35.47 
 
 		 222 aa  85.9  5e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.260568  hitchhiker  0.0024636 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1496  transcriptional regulator, TetR family  29.7 
 
 		 206 aa  84.7  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10241  TetR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 204 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000764085  normal  0.925652 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0710  transcriptional regulator, TetR family  28.77 
 
 		 248 aa  84  0.000000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0330  transcriptional regulator, TetR family  32.51 
 
 		 233 aa  82.8  0.000000000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38900  transcriptional regulator, TetR family  31.22 
 
 		 226 aa  82.4  0.000000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.749862  normal  0.429215 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4626  transcriptional regulator, TetR family  32.79 
 
 		 211 aa  82.4  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.110176  hitchhiker  0.00755279 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0984  transcriptional regulator, TetR family  31.75 
 
 		 245 aa  82  0.000000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.50937  hitchhiker  0.00233885 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0908  transcriptional regulator, TetR family  28.43 
 
 		 207 aa  81.6  0.000000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469028  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30200  transcriptional regulator, TetR family  30.54 
 
 		 231 aa  81.3  0.00000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.296423  normal  0.124528 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0236  TetR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 218 aa  80.5  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0269868  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0246  TetR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 218 aa  80.5  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.314505 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1050  transcriptional regulator, TetR family  29.47 
 
 		 225 aa  80.1  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.549541 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0226  TetR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 218 aa  80.5  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.131166 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6979  transcriptional regulator, TetR family  31.31 
 
 		 220 aa  80.1  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.941023  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2089  transcriptional regulator, TetR family  31.53 
 
 		 220 aa  79.3  0.00000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0021127  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4481  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 216 aa  79.3  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.918639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0138  TetR family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 218 aa  79  0.00000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13360  transcriptional regulator, TetR family  31.4 
 
 		 215 aa  78.2  0.00000000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0417905  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3016  transcriptional regulator, TetR family  28.16 
 
 		 209 aa  78.6  0.00000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150997  normal  0.125451 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0144  TetR family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 224 aa  78.6  0.00000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.522541  decreased coverage  0.0000264507 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1238  AcrR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 273 aa  78.2  0.00000000000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4456  regulatory protein TetR  31.68 
 
 		 202 aa  77  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0166479  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0257  TetR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 209 aa  76.6  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102981 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32320  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 200 aa  76.3  0.0000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.247928 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0414  TetR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 215 aa  76.3  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.462572  normal  0.0664832 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4029  transcriptional regulator, TetR family  30.12 
 
 		 217 aa  73.2  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.697639  normal  0.116148 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1216  TetR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 204 aa  72.4  0.000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3836  transcriptional regulator, TetR family  31.53 
 
 		 211 aa  71.2  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0828  transcriptional regulator, TetR family  32.32 
 
 		 275 aa  70.1  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06690  transcriptional regulator  27.54 
 
 		 256 aa  70.1  0.00000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5318  transcriptional regulator, TetR family  36 
 
 		 197 aa  70.1  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0424  transcriptional regulator, TetR family  25.26 
 
 		 201 aa  69.3  0.00000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.315635  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3020  transcriptional regulator, TetR family  28.42 
 
 		 213 aa  69.3  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000370253  normal  0.25528 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2242  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 208 aa  68.6  0.00000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0149249  normal  0.352289 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1922  transcriptional regulator, TetR family  35.25 
 
 		 201 aa  67  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5607  transcriptional regulator, TetR family  27.92 
 
 		 209 aa  66.6  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.897418  normal  0.557491 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3962  putative transcriptional regulator, TetR family  30.06 
 
 		 194 aa  66.2  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.545183  normal  0.218359 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1286  transcriptional regulator, TetR family  28.19 
 
 		 199 aa  65.5  0.0000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000123202 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1383  putative transcriptional regulatory protein  28.03 
 
 		 212 aa  63.5  0.000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0030  TetR family transcriptional regulator  41.76 
 
 		 193 aa  63.2  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.19641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4061  TetR family transcriptional regulator  24.87 
 
 		 240 aa  63.2  0.000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1061  transcriptional regulator, TetR family  27.46 
 
 		 196 aa  62.8  0.000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0250707  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1434  transcriptional regulator, TetR family  29.01 
 
 		 225 aa  62.8  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.185065  normal  0.789444 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12528  TetR family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 215 aa  62.4  0.000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0275989 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0908  TetR family transcriptional regulator  24.73 
 
 		 200 aa  62.4  0.000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.376971  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>