More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4029 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_4029  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 217 aa  427  1e-119  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.697639  normal  0.116148 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0305  transcriptional regulator, TetR family  45.88 
 
 		 215 aa  171  1e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.437849  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0828  transcriptional regulator, TetR family  40.2 
 
 		 275 aa  146  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3020  transcriptional regulator, TetR family  38.5 
 
 		 213 aa  140  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000370253  normal  0.25528 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21260  transcriptional regulator, tetR family  39.71 
 
 		 251 aa  135  4e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.646658  normal  0.296128 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06690  transcriptional regulator  33.16 
 
 		 256 aa  117  9.999999999999999e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2143  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 249 aa  117  9.999999999999999e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.101921  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1890  transcriptional regulator, TetR family  34.95 
 
 		 253 aa  114  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00021201 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11710  transcriptional regulator, tetR family  39.58 
 
 		 237 aa  112  4.0000000000000004e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.010685  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0805  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 227 aa  109  3e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0640  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 235 aa  108  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.346756  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0653  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 235 aa  108  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.553642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34880  transcriptional regulator, tetR family  37.56 
 
 		 218 aa  108  7.000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0633  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 235 aa  108  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0416702 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0103  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 234 aa  105  5e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.257993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10480  TetR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 234 aa  103  2e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3112  transcriptional regulator, TetR family  48.65 
 
 		 238 aa  102  4e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.151742  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3569  transcriptional regulator, TetR family  34.85 
 
 		 226 aa  101  9e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.467129  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2936  transcriptional regulator, TetR family  35.81 
 
 		 266 aa  99.8  3e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.273782 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0771  regulatory protein TetR  30.69 
 
 		 246 aa  99.4  3e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1451  TetR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 224 aa  99  5e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1397  TetR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 224 aa  98.6  7e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.515474  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1415  TetR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 224 aa  98.6  7e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4626  transcriptional regulator, TetR family  37.18 
 
 		 211 aa  95.5  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.110176  hitchhiker  0.00755279 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1827  TetR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 246 aa  95.1  8e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1874  TetR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 246 aa  95.1  8e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0418563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1808  TetR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 246 aa  95.1  8e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.229482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2377  transcriptional regulator, TetR family  33.5 
 
 		 211 aa  95.1  8e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.081674 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4290  TetR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 246 aa  91.7  7e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.362272  normal  0.446856 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13232  TetR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 228 aa  91.3  9e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.414971 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4588  transcriptional regulator, TetR family  32.45 
 
 		 206 aa  90.5  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112472 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23490  transcriptional regulator, tetR family  32.02 
 
 		 223 aa  90.1  2e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.411786  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2056  TetR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 253 aa  87.8  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.391496 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0452  TetR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 212 aa  87  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.681881  decreased coverage  0.00000297509 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 224 aa  85.9  4e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1473  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 195 aa  84.7  9e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1795  TetR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 224 aa  84.7  9e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2497  transcriptional regulator, TetR family  29.63 
 
 		 221 aa  84.3  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000693939 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0381  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 212 aa  84  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0919  TetR family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 215 aa  82.8  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1204  transcriptional regulator, TetR family  31.05 
 
 		 206 aa  80.9  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.260768  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2993  TetR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 206 aa  80.1  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4251  transcriptional regulator, TetR family  33.68 
 
 		 216 aa  80.5  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22701  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2134  transcriptional regulator, TetR family  32.43 
 
 		 219 aa  80.5  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00399747  normal  0.0273951 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0830  transcriptional regulator, TetR family  31.71 
 
 		 214 aa  80.1  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  28.93 
 
 		 222 aa  79.3  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3806  TetR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 238 aa  79.3  0.00000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65239  normal  0.316965 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2775  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 228 aa  79  0.00000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0212844  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3512  regulatory protein TetR  29.65 
 
 		 237 aa  79  0.00000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0994  transcriptional regulator, TetR family  32.12 
 
 		 271 aa  78.6  0.00000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06720  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 221 aa  77.4  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1120  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 223 aa  75.5  0.0000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.917457  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7816  transcriptional regulator, TetR family  28.27 
 
 		 216 aa  73.6  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1434  transcriptional regulator, TetR family  28.42 
 
 		 225 aa  72.4  0.000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.185065  normal  0.789444 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13066  AsnC family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 246 aa  72  0.000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.117427 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2710  transcriptional regulator, TetR family  29.86 
 
 		 218 aa  71.2  0.00000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.448517  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0518  TetR family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 206 aa  70.5  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290772  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1050  transcriptional regulator, TetR family  30.26 
 
 		 225 aa  70.5  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.549541 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0564  transcriptional regulator, TetR family  26.98 
 
 		 203 aa  70.1  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2486  transcriptional regulator, TetR family  28.96 
 
 		 200 aa  68.9  0.00000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00165208  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0194  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 225 aa  68.9  0.00000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0731  TetR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 227 aa  68.2  0.00000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250469 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3410  TetR family transcriptional regulator  27.44 
 
 		 196 aa  68.2  0.00000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000655293  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3962  putative transcriptional regulator, TetR family  30.3 
 
 		 194 aa  68.2  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.545183  normal  0.218359 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0787  regulatory protein, TetR  30.26 
 
 		 226 aa  67.8  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1683  TetR family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 197 aa  67.8  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.947535  normal  0.202583 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4590  regulatory protein TetR  30.05 
 
 		 206 aa  67  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0908  transcriptional regulator, TetR family  26.8 
 
 		 207 aa  67  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469028  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1383  putative transcriptional regulatory protein  26.63 
 
 		 212 aa  66.6  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0832  transcriptional regulator, TetR family  28.79 
 
 		 196 aa  66.2  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0931  transcriptional regulator, TetR family  27.89 
 
 		 215 aa  66.6  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.588864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 216 aa  66.2  0.0000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13360  transcriptional regulator, TetR family  30.09 
 
 		 215 aa  65.9  0.0000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0417905  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4602  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 219 aa  65.1  0.0000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.904797 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1286  transcriptional regulator, TetR family  28.71 
 
 		 199 aa  64.7  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000123202 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  26.56 
 
 		 205 aa  63.2  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11350  transcriptional regulator  30.2 
 
 		 220 aa  63.2  0.000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3827  transcriptional regulator, TetR family  31.87 
 
 		 212 aa  62.8  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.31638 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3157  TetR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 330 aa  62.8  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2089  transcriptional regulator, TetR family  32.54 
 
 		 220 aa  62.4  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0021127  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1216  TetR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 204 aa  62  0.000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4481  transcriptional regulator, TetR family  32.6 
 
 		 216 aa  61.6  0.000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.918639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0166  transcriptional regulator, TetR family  25.93 
 
 		 221 aa  61.2  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0611363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32320  transcriptional regulator, TetR family  27.23 
 
 		 200 aa  61.2  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.247928 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1944  transcriptional regulator, TetR family  26.2 
 
 		 205 aa  61.6  0.00000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00538978  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0951  TetR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 196 aa  60.5  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0144  TetR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 224 aa  60.8  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.522541  decreased coverage  0.0000264507 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0872  transcriptional regulator, TetR family  25.85 
 
 		 211 aa  60.5  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.678947 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30200  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 		 231 aa  60.1  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.296423  normal  0.124528 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0984  transcriptional regulator, TetR family  26.94 
 
 		 245 aa  60.1  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.50937  hitchhiker  0.00233885 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0223  transcriptional regulator, TetR family  32.35 
 
 		 195 aa  58.9  0.00000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000853805  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8610  putative transcriptional regulator, TetR family  29.63 
 
 		 317 aa  58.9  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8965  putative transcriptional regulator, TetR family  43.82 
 
 		 173 aa  58.9  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0138  TetR family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 218 aa  58.2  0.00000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15250  transcriptional regulator, tetR family  27.33 
 
 		 218 aa  58.2  0.00000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.110377  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5318  transcriptional regulator, TetR family  44.78 
 
 		 197 aa  58.2  0.00000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3709  TetR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 205 aa  57.8  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0764  TetR family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 203 aa  57.8  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0005262  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3091  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 224 aa  57.8  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3198  TetR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 215 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00193732  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>