143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0904 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_0904  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 222 aa  449  1e-125  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0154143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4816  TetR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 244 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0244477 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0458  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 204 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2314  transcriptional regulator, TetR family  32.63 
 
 		 213 aa  50.4  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.251224 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4880  TetR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 204 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5006  TetR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 204 aa  48.5  0.00008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.162058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5593  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 233 aa  48.1  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.531399  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5056  TetR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 204 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3466  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 200 aa  47  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6361  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 229 aa  47.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.529564  normal  0.439154 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10308  TetR/AcrR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 210 aa  47  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000336223  normal  0.125099 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06360  transcriptional regulator  29.06 
 
 		 201 aa  46.6  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.589658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1730  regulatory protein, TetR  43.75 
 
 		 201 aa  46.6  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0035  TetR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 206 aa  46.6  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00656395  normal  0.0912126 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1978  transcriptional regulator, TetR family  29.93 
 
 		 190 aa  46.6  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00000899637  hitchhiker  0.000000574301 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5550  TetR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 190 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1020  TetR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 198 aa  46.6  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.13954 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5281  TetR family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 257 aa  47  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0196  transcriptional regulator, TetR family  27.4 
 
 		 200 aa  46.6  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1909  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 197 aa  46.2  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63880  putative transcriptional regulator  35.71 
 
 		 186 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5576  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 234 aa  46.2  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000947  transcriptional regulator  26.16 
 
 		 196 aa  46.2  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4404  TetR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 213 aa  45.8  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4372  TetR/AcrR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 224 aa  45.8  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0837582  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2858  transcriptional regulator, TetR family  42.37 
 
 		 218 aa  45.4  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6464  putative transcriptional regulator, TetR family  31.43 
 
 		 245 aa  45.4  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0682753 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3099  TetR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 221 aa  45.1  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00451486  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4082  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 343 aa  45.1  0.0008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.63573 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1156  TetR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 193 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.813518  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0982  TetR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 193 aa  44.7  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0971  TetR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 193 aa  44.7  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0971  TetR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 193 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4322  TetR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 198 aa  44.3  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0136212  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1052  TetR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 193 aa  44.7  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1056  TetR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 205 aa  44.7  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0248365  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0303  TetR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 228 aa  44.7  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.402109  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1885  TetR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 196 aa  44.7  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0331  TetR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 195 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2996  TetR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 237 aa  45.1  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66850  TetR family transcriptional regulator  26.44 
 
 		 205 aa  45.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0128  TetR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 191 aa  44.7  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1436  TetR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 197 aa  44.7  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0341  TetR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 195 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.317306 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0320  TetR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 195 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6204  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 199 aa  45.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.308886  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0974  TetR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 194 aa  45.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1516  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 203 aa  44.7  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1217  transcriptional regulator, TetR family  32.73 
 
 		 193 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1088  transcriptional regulator, TetR family  32.73 
 
 		 193 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4217  transcriptional regulator, TetR family  32.73 
 
 		 193 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.152492 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1137  transcriptional regulator, TetR family  32.73 
 
 		 193 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3171  transcriptional regulator, TetR family  27.38 
 
 		 216 aa  43.9  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.323724  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51850  Transcriptional regulatory protein, TetR family  34.21 
 
 		 186 aa  44.3  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0068  TetR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 193 aa  43.5  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0483  transcriptional regulator, TetR family  35.82 
 
 		 226 aa  43.5  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4763  transcriptional regulator, TetR family  30.36 
 
 		 252 aa  43.9  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0000323039  decreased coverage  0.0000700922 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6209  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 208 aa  44.3  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4140  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 240 aa  43.9  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3566  TetR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 187 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.730164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4442  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 192 aa  44.3  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06958  transcriptional regulator  31.82 
 
 		 198 aa  43.9  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4464  TetR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 204 aa  43.9  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0680244 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5087  TetR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 196 aa  43.9  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.305126  normal  0.842071 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5150  TetR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 204 aa  43.9  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.491017  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0408  transcriptional regulator, TetR family  30.16 
 
 		 212 aa  43.9  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8986  putative transcriptional regulator, TetR family  38.33 
 
 		 220 aa  43.5  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3319  transcriptional regulator, TetR family  37.74 
 
 		 214 aa  43.1  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00311946  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4429  TetR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 192 aa  43.1  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.247191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5718  transcriptional regulator, TetR family  42.22 
 
 		 212 aa  43.5  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.283499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1753  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 210 aa  43.1  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1578  regulatory protein TetR  29.51 
 
 		 231 aa  43.1  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.358729  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1800  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 210 aa  43.1  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.865555  normal  0.363073 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5169  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 196 aa  43.1  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.767063 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1734  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 210 aa  43.5  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.657322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1404  transcriptional regulator, TetR family  36.96 
 
 		 193 aa  43.1  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1290  AcrR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 199 aa  43.5  0.003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3154  regulatory protein, TetR  37.74 
 
 		 214 aa  43.1  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0193225  normal  0.108939 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0444  transcriptional regulator, TetR family  28.09 
 
 		 222 aa  42.7  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4245  regulatory protein, TetR  25.15 
 
 		 221 aa  42.7  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.933468  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0520  transcriptional regulator, TetR family  27.59 
 
 		 197 aa  42.7  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.711752  normal  0.521102 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2105  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 202 aa  42.7  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.143952  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4347  transcriptional regulator, TetR family  31.08 
 
 		 190 aa  43.1  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2935  transcriptional regulator, TetR family  32.53 
 
 		 208 aa  42.7  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309221  normal  0.0172625 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5146  transcriptional regulator PhaD  26.47 
 
 		 204 aa  42.7  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3036  regulatory protein, TetR  28.99 
 
 		 216 aa  42.4  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0300267  normal  0.0658454 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7073  transcriptional regulator, TetR family  27.68 
 
 		 248 aa  42.4  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.672487  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0405  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 222 aa  42.7  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1626  TetR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 222 aa  42.7  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0432632 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1293  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 199 aa  42.7  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0628  transcriptional regulator, TetR family  29.73 
 
 		 218 aa  42.4  0.005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.504351 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2360  regulatory protein, TetR  27.42 
 
 		 190 aa  42.4  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.173305 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3543  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 223 aa  42.7  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0364286 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2609  TetR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 194 aa  42.7  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000163063  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3233  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 193 aa  42.4  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.659753 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0301  transcriptional regulator, TetR family  27.66 
 
 		 199 aa  42.7  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0864199  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23630  transcriptional regulator  37.7 
 
 		 210 aa  42.4  0.006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.119387 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3353  TetR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 195 aa  42.4  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0355  transcriptional regulator, TetR family  39.58 
 
 		 195 aa  42.4  0.006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1426  transcriptional regulator, TetR family  35.38 
 
 		 190 aa  42.4  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.620095 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>