232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4763 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_4763  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 252 aa  501  1e-141  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0000323039  decreased coverage  0.0000700922 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3007  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 239 aa  138  7.999999999999999e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0040024 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00320  transcriptional regulator, tetR family  40.34 
 
 		 256 aa  137  2e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.48619  normal  0.068604 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0240  TetR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 281 aa  130  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.679484 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1669  transcriptional regulator, TetR family  36.71 
 
 		 255 aa  130  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.269764  normal  0.168881 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1694  transcriptional regulator, TetR family  37.89 
 
 		 252 aa  130  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.239761 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1527  transcriptional regulator, TetR family  37.02 
 
 		 263 aa  127  1.0000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.413191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1315  TetR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 255 aa  126  3e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.156581 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4188  transcriptional regulator, TetR family  36.82 
 
 		 256 aa  126  4.0000000000000003e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4082  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 343 aa  122  7e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.63573 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7217  putative transcriptional regulator, TetR family  36.99 
 
 		 247 aa  121  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.466124  normal  0.580256 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30920  transcriptional regulator, tetR family  33.73 
 
 		 266 aa  115  8.999999999999998e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5957  transcriptional regulator, TetR family  36.05 
 
 		 229 aa  114  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.769485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5425  putative transcriptional regulator, TetR family  35.56 
 
 		 272 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1050  TetR family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 238 aa  112  6e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.361662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3083  regulatory protein TetR  32.03 
 
 		 248 aa  108  6e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.143154  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1965  transcriptional regulator, TetR family  32.5 
 
 		 234 aa  107  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.66981  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4066  putative transcriptional regulator, TetR family  31.84 
 
 		 253 aa  103  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.546263  normal  0.272387 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5853  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 258 aa  102  7e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.389129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2497  putative transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 315 aa  99  7e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.182047 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1460  transcriptional regulator, TetR family  31.22 
 
 		 249 aa  97.4  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6279  transcriptional regulator, TetR family  30.96 
 
 		 235 aa  97.8  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.993212 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4362  regulatory protein, TetR  30 
 
 		 256 aa  96.7  3e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5716  transcriptional regulator, TetR family  32.48 
 
 		 255 aa  91.3  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.831325 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0672  transcriptional regulator, TetR family  31.36 
 
 		 257 aa  90.5  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.607833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0056  transcriptional regulator, TetR family  30.99 
 
 		 289 aa  89.4  5e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5556  transcriptional regulator, GntR family  30.3 
 
 		 311 aa  89.4  6e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3268  putative transcriptional regulator, GntR family  33.61 
 
 		 293 aa  87  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3400  transcriptional regulator, TetR family  32.34 
 
 		 248 aa  87.4  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.160802  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0279  transcriptional regulator, TetR family  32.05 
 
 		 268 aa  85.1  9e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8156  putative transcriptional regulator, TetR family  29 
 
 		 272 aa  85.1  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5652  transcriptional regulator, TetR family  30.5 
 
 		 283 aa  84.7  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0092  GntR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 330 aa  84.3  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2404  transcriptional regulator, TetR family  28.75 
 
 		 247 aa  84  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0783886 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3346  regulatory protein, TetR  31.15 
 
 		 262 aa  82.8  0.000000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.213794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0730  TetR family transcriptional regulator  35.27 
 
 		 242 aa  81.3  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00296779  normal  0.0851548 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1370  transcriptional regulator, TetR family  37.66 
 
 		 223 aa  80.5  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.705116 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7747  putative transcriptional regulator  31.22 
 
 		 342 aa  80.9  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.117612  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4687  transcriptional regulator, TetR family  30.67 
 
 		 259 aa  78.2  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.717984  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3884  transcriptional regulator, TetR family  27.31 
 
 		 304 aa  77  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.162563 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2911  TetR family transcriptional regulator  27.9 
 
 		 248 aa  77  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.109038 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1574  transcriptional regulator, TetR family  31.54 
 
 		 258 aa  76.3  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1243  TetR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 229 aa  75.9  0.0000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.176443 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4137  putative transcriptional regulator, TetR family  33.83 
 
 		 263 aa  75.9  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0181128  normal  0.0240758 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2060  transcriptional regulator, TetR family  30.7 
 
 		 266 aa  74.7  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.582496  normal  0.158127 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5933  regulatory protein TetR  33.62 
 
 		 250 aa  74.7  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.164219 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4294  transcriptional regulator, GntR family  29.79 
 
 		 343 aa  73.9  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.806766 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0897  transcriptional regulator, TetR family  29.96 
 
 		 265 aa  72.8  0.000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0683  transcriptional regulator, TetR family  35.82 
 
 		 233 aa  73.2  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.124954 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0801  transcriptional regulator, TetR family  31.42 
 
 		 226 aa  71.6  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0716  transcriptional regulator, TetR family  38.98 
 
 		 231 aa  70.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0221174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0460  regulatory protein TetR  34.19 
 
 		 227 aa  70.5  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.266812  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0638  TetR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 250 aa  70.1  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3568  TetR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 253 aa  69.3  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1945  putative transcriptional regulator, TetR family  28.95 
 
 		 268 aa  68.9  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.951149  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2357  transcriptional regulator, TetR family  29.6 
 
 		 218 aa  68.9  0.00000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2596  TetR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 257 aa  68.6  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.476942 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4140  transcriptional regulator, TetR family  31.14 
 
 		 240 aa  67.8  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3892  transcriptional regulator, TetR family  29.5 
 
 		 211 aa  67.4  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0017  transcriptional regulator, TetR family  35.25 
 
 		 224 aa  67.4  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2273  transcriptional regulator, TetR family  29.17 
 
 		 224 aa  67.8  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0437  TetR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 239 aa  66.6  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5781  TetR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 235 aa  65.5  0.0000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3980  TetR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 268 aa  65.5  0.0000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3530  transcriptional regulator, TetR family  26.53 
 
 		 267 aa  65.1  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0209016  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1119  transcriptional regulator, TetR family  40.43 
 
 		 211 aa  65.1  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.335801 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1898  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 225 aa  65.1  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00182667  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9231  tetR-family regulatory protein  27.66 
 
 		 247 aa  64.7  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.484933  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3445  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 230 aa  64.7  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5582  transcriptional regulator, TetR family  34.35 
 
 		 250 aa  64.3  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0252  transcriptional regulator, TetR family  33.97 
 
 		 221 aa  63.9  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0664  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 235 aa  63.9  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.773977  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3932  putative transcriptional regulator, TetR family  29 
 
 		 228 aa  64.3  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199219  normal  0.0173794 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3300  transcriptional regulator, TetR family  31.98 
 
 		 214 aa  62.8  0.000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.513465  hitchhiker  0.00580905 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1997  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 250 aa  62.4  0.000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.354177  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5576  transcriptional regulator, TetR family  27.63 
 
 		 234 aa  62  0.000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2560  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 272 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.283011  normal  0.208167 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1468  transcriptional regulator, TetR family  28.34 
 
 		 283 aa  60.8  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3927  transcriptional regulator, TetR family  27.84 
 
 		 218 aa  60.1  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0408  transcriptional regulator, TetR family  38.2 
 
 		 212 aa  60.5  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8893  transcriptional regulator, TetR family  27.73 
 
 		 272 aa  59.7  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2453  transcriptional regulator, TetR family  39.78 
 
 		 223 aa  59.3  0.00000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.106386  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2646  transcriptional regulator, TetR family  27.48 
 
 		 236 aa  58.5  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00299352  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6464  putative transcriptional regulator, TetR family  32.23 
 
 		 245 aa  58.2  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0682753 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4078  TetR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 269 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.152777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4845  putative transcriptional regulator, TetR family  28.94 
 
 		 230 aa  58.5  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4689  transcriptional regulator, TetR family  27.75 
 
 		 259 aa  57.4  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4284  transcriptional regulator, TetR family  35.4 
 
 		 223 aa  57  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.620259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0036  putative transcriptional regulator, TetR family  32.98 
 
 		 234 aa  57  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.940738 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2797  TetR family transcriptional regulator  27.02 
 
 		 242 aa  57  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139894  normal  0.287212 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1711  regulatory protein TetR  34.65 
 
 		 226 aa  56.6  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.539832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3718  transcriptional regulator, TetR family  27.23 
 
 		 223 aa  56.2  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000868131  normal  0.31083 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1690  transcriptional regulator, TetR family  33.98 
 
 		 222 aa  55.8  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.072365  hitchhiker  0.0000000604778 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2698  Tetracyclin repressor domain protein  33 
 
 		 239 aa  55.8  0.0000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2430  transcriptional regulator, TetR family  27.81 
 
 		 252 aa  55.8  0.0000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.522174  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0837  transcriptional regulator, TetR family  32.2 
 
 		 238 aa  55.5  0.0000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.895795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1989  TetR family transcriptional regulator  23.55 
 
 		 250 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7234  putative transcriptional regulator, TetR family  34.96 
 
 		 249 aa  54.7  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4098  TetR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 315 aa  55.1  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5638  TetR family transcriptional regulator  23.55 
 
 		 238 aa  55.1  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.491763  normal  0.336395 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>