More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_2609 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_2609  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 194 aa  395  1e-109  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000163063  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2560  transcriptional regulator, TetR family  50.29 
 
 		 196 aa  169  3e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.199189  normal  0.158626 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5351  TetR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 195 aa  168  4e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0124857 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1464  TetR family transcriptional regulator  43.81 
 
 		 210 aa  168  6e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.856721  normal  0.959808 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5814  transcriptional regulator, TetR family  44.56 
 
 		 195 aa  167  7e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0513  transcriptional regulator, TetR family  37.7 
 
 		 193 aa  149  4e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.826847 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2324  transcriptional regulator, TetR family  43.39 
 
 		 195 aa  139  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3517  trancscriptional regulator MtrR, putative  28.65 
 
 		 197 aa  108  6e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.178393  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2160  TetR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 242 aa  90.5  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.308493 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1122  transcriptional regulator, TetR family  35.9 
 
 		 242 aa  90.1  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0273535  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1507  TetR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 224 aa  89.4  3e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0289697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1588  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 243 aa  89  4e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.556176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1924  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 243 aa  88.6  5e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.436993 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1642  regulatory protein TetR  33.33 
 
 		 243 aa  88.6  5e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.906249  normal  0.298485 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0918  TetR family transcriptional regulator  35.22 
 
 		 191 aa  88.6  6e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.141078 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5473  TetR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 201 aa  84.3  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.968436  normal  0.0284284 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1780  transcriptional regulator, TetR family  29.12 
 
 		 200 aa  82.8  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2750  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 205 aa  80.1  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.172363  normal  0.153941 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4377  transcriptional regulator, TetR family  30.65 
 
 		 205 aa  73.6  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.314155  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2216  TetR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 203 aa  73.2  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0817319 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1358  TetR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 211 aa  71.6  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.824963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3603  TetR family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 205 aa  70.1  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.162578  normal  0.242533 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3745  transcriptional regulator, TetR family  27.16 
 
 		 201 aa  69.3  0.00000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0045  transcriptional regulator  26.2 
 
 		 181 aa  69.7  0.00000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0375278  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4072  TetR family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 204 aa  68.2  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.404237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0359  TetR family transcriptional regulator  27.65 
 
 		 193 aa  68.2  0.00000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.717722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0144  TetR family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 181 aa  66.6  0.0000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6030  transcriptional regulator TetR family  32.52 
 
 		 222 aa  66.2  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3471  transcriptional regulator, TetR family  26.74 
 
 		 202 aa  65.5  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1083  TetR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 203 aa  65.1  0.0000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.243709  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1755  TetR family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 209 aa  64.7  0.0000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3759  transcriptional regulator, TetR family  26.74 
 
 		 202 aa  64.7  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.341264  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4900  transcriptional regulator, TetR family  29.45 
 
 		 204 aa  64.7  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.909356  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0096  transcriptional regulator, TetR family  27.23 
 
 		 196 aa  64.3  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4220  TetR family transcriptional regulator  26.38 
 
 		 204 aa  62  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.267151 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0822  transcriptional regulator, TetR family  25.47 
 
 		 205 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.752802  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2825  TetR family transcriptional regulator  25.52 
 
 		 204 aa  59.7  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0304388 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1522  regulatory protein TetR  28.98 
 
 		 207 aa  59.3  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.855326  normal  0.485337 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1801  transcriptional regulator, TetR family  28.98 
 
 		 207 aa  59.3  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0882167  normal  0.119004 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1520  transcriptional regulator, TetR family  27.38 
 
 		 208 aa  58.5  0.00000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.431113 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0679  TetR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 211 aa  58.2  0.00000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2516  transcriptional regulator, TetR family  33.73 
 
 		 188 aa  58.2  0.00000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000113352  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0314  TetR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1017  repressor protein  29.94 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1344  TetR family transcriptional regulator  23.44 
 
 		 208 aa  57.4  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000662672 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0609  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  29.94 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.780096  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2443  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  29.94 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0852  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  29.94 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0857  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  29.94 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0057  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  29.94 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3444  TetR family transcriptional regulator  24.84 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.349562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0090  transcriptional regulator, TetR family  35.92 
 
 		 216 aa  56.2  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5392  transcriptional regulator, TetR family protein  25.14 
 
 		 190 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01975  hypothetical protein  29.36 
 
 		 204 aa  55.1  0.0000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.10817  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1456  transcriptional regulator, TetR family  36.96 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1293  TetR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 199 aa  54.7  0.0000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46570  putative transcriptional regulator  24.22 
 
 		 205 aa  54.7  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000161907  hitchhiker  0.00000116969 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3772  TetR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 201 aa  54.3  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.392718  normal  0.705056 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3444  transcriptional regulator, TetR family  24.44 
 
 		 200 aa  54.3  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.700957 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6521  putative transcriptional regulator, TetR family  43.08 
 
 		 210 aa  53.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.177383 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0741  regulatory protein, TetR  44.07 
 
 		 211 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3548  TetR family transcriptional regulator  24.22 
 
 		 207 aa  53.1  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.842454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4820  transcriptional regulator, TetR family  30.1 
 
 		 203 aa  53.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.353068 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0035  TetR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 206 aa  53.1  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00656395  normal  0.0912126 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2132  TetR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 231 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.273159  normal  0.36697 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1926  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 224 aa  52.8  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.857726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1984  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 196 aa  53.1  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0187  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 202 aa  52.8  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.458714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1452  transcriptional regulator, TetR family  28.04 
 
 		 199 aa  52.8  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2000  TetR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 234 aa  53.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.920156  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6577  TetR family transcriptional regulator  24.22 
 
 		 205 aa  53.1  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2105  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 202 aa  52.8  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.143952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2610  TetR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 234 aa  53.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.341012  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2639  TetR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 213 aa  53.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3207  putative transcription regulator protein  24.22 
 
 		 204 aa  52.4  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00713158  normal  0.0476395 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0578  TetR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 204 aa  52.4  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.209309 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1079  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 215 aa  52.4  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6291  TetR family transcriptional regulator  23.6 
 
 		 205 aa  52  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.170422  normal  0.0225355 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47610  putative transcriptional regulator  29.41 
 
 		 186 aa  52.4  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3459  TetR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 324 aa  52.4  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3319  transcriptional regulator, TetR family  23.6 
 
 		 205 aa  52  0.000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2556  transcriptional regulator, TetR family  34.07 
 
 		 208 aa  52  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000000489141  normal  0.182844 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6204  transcriptional regulator, TetR family  44.23 
 
 		 199 aa  51.6  0.000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.308886  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2010  TetR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 184 aa  51.6  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5366  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 210 aa  51.6  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00158369  normal  0.823764 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2056  TetR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 184 aa  51.6  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1991  TetR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 184 aa  51.6  0.000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.645683  normal  0.738548 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4107  transcriptional regulator  29.41 
 
 		 187 aa  51.2  0.000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.198218  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2450  TetR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 213 aa  51.2  0.000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2153  transcriptional regulator PsrA  27.42 
 
 		 233 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.64739  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3038  transcriptional regulator  26.79 
 
 		 230 aa  50.4  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2816  hypothetical protein  37.93 
 
 		 222 aa  50.8  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0366008  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0939  TetR family transcriptional regulator  25.61 
 
 		 205 aa  50.4  0.00001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0303  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 228 aa  50.4  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.402109  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5086  transcriptional regulator, TetR family  24.04 
 
 		 210 aa  50.4  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.423561  normal  0.0707297 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3457  TetR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 238 aa  50.8  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1909  transcriptional regulator, TetR family  23.78 
 
 		 197 aa  50.8  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3108  TetR family transcriptional regulator  24.1 
 
 		 185 aa  49.7  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3354  TetR family transcriptional regulator  24.1 
 
 		 185 aa  49.7  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0100  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 219 aa  50.1  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>