More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0301 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0301  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 199 aa  392  1e-108  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0864199  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2314  transcriptional regulator, TetR family  72.16 
 
 		 213 aa  279  2e-74  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.251224 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3410  TetR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 196 aa  125  5e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000655293  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0520  transcriptional regulator, TetR family  30.3 
 
 		 197 aa  117  9e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.711752  normal  0.521102 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0223  transcriptional regulator, TetR family  31.18 
 
 		 195 aa  112  3e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000853805  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1325  transcriptional regulator, TetR family  30.57 
 
 		 203 aa  112  5e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.161657  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1909  transcriptional regulator, TetR family  30.48 
 
 		 197 aa  111  6e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0832  transcriptional regulator, TetR family  30.11 
 
 		 196 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0951  TetR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 196 aa  108  5e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1307  transcriptional regulator, TetR family  35.76 
 
 		 202 aa  108  7.000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3302  TetR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 215 aa  107  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.696216 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2178  TetR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 181 aa  105  3e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000638624  hitchhiker  0.00000363527 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3709  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 205 aa  106  3e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3704  TetR family transcriptional regulator  34.73 
 
 		 202 aa  104  7e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1833  TetR family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 202 aa  104  8e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.150168  normal  0.286062 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1684  transcriptional regulator, TetR family  33.54 
 
 		 202 aa  103  2e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2878  TetR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 202 aa  99  4e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1022  transcriptional regulator, TetR family  37.58 
 
 		 202 aa  98.6  5e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1059  TetR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 212 aa  97.8  9e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.659814 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0144  TetR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 202 aa  97.1  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1240  TetR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 201 aa  95.5  4e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1903  TetR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 197 aa  95.1  6e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000201758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3835  TetR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 202 aa  94.7  8e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3852  TetR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 202 aa  94.7  8e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1920  TetR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 202 aa  94.7  8e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2686  TetR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 202 aa  94.4  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0616794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1250  TetR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 202 aa  94  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1283  transcriptional regulator, TetR family  28.8 
 
 		 199 aa  93.2  2e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.255686  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1046  TetR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 201 aa  92.4  3e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1915  transcriptional regulator, TetR family  32.93 
 
 		 200 aa  92.8  3e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0196  transcriptional regulator, TetR family  24.48 
 
 		 200 aa  92.4  4e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3466  TetR family transcriptional regulator  25.65 
 
 		 200 aa  91.3  9e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1926  transcriptional regulator, TetR family  32.12 
 
 		 202 aa  90.5  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.930045  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3254  TetR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 199 aa  88.6  6e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1674  TetR family transcriptional regulator  31.74 
 
 		 201 aa  84.7  8e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.997457 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1045  transcriptional regulator, TetR family  27.98 
 
 		 203 aa  84.3  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00830488  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3094  TetR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 212 aa  84  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3149  TetR family transcriptional regulator  33.92 
 
 		 205 aa  80.9  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001824  transcriptional regulator  28.04 
 
 		 196 aa  77  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000410739  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4280  transcriptional regulator, TetR family  31.18 
 
 		 203 aa  75.5  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.409841  normal  0.686522 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00651  nucleoid occlusion protein  27.89 
 
 		 196 aa  75.9  0.0000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2593  nucleoid occlusion protein  27.37 
 
 		 210 aa  75.1  0.0000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000323733  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4542  transcriptional regulator, TetR family  21.14 
 
 		 201 aa  75.1  0.0000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.204937  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3622  TetR family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 236 aa  74.3  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.311842  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  28.72 
 
 		 218 aa  73.2  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2109  TetR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 206 aa  73.9  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.901149 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3225  TetR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 195 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4652  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 195 aa  71.6  0.000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4353  TetR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 195 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4421  TetR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 195 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4260  transcriptional regulator  25.64 
 
 		 195 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4272  transcriptional regulator  25.64 
 
 		 195 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4762  TetR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 195 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4637  transcriptional regulator, TetR family  25.64 
 
 		 195 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4653  transcriptional regulator, TetR family  25.64 
 
 		 195 aa  68.6  0.00000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4633  transcriptional regulator, TetR family  25.64 
 
 		 195 aa  68.6  0.00000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.169287  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0602  transcriptional regulator, TetR family  25.64 
 
 		 195 aa  68.2  0.00000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0355  transcriptional regulator, TetR family  24.72 
 
 		 195 aa  68.2  0.00000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0104  transcriptional regulator, TetR family  27.89 
 
 		 198 aa  67  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3170  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 202 aa  67  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.148676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3521  nucleoid occlusion protein  24.24 
 
 		 240 aa  67  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1324  nucleoid occlusion protein  25.42 
 
 		 231 aa  67  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.892359 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0620  nucleoid occlusion protein  21.67 
 
 		 197 aa  67  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000140669 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0141  nucleoid occlusion protein  26.42 
 
 		 219 aa  66.2  0.0000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.102052  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4304  TetR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 202 aa  66.2  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148025  normal  0.676238 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1710  transcriptional regulator, TetR family  24.71 
 
 		 200 aa  65.9  0.0000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000037358  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4915  transcriptional regulator, TetR family  30.81 
 
 		 206 aa  65.9  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.259096  normal  0.574827 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2628  transcriptional regulator, TetR family  22.78 
 
 		 194 aa  65.9  0.0000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2367  TetR family transcriptional regulator  24.87 
 
 		 202 aa  64.3  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.445055  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3979  nucleoid occlusion protein  25.29 
 
 		 216 aa  63.9  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.56213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1334  TetR family transcriptional regulator  20.11 
 
 		 241 aa  64.3  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0777  nucleoid occlusion protein  24.12 
 
 		 217 aa  64.7  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0194  nucleoid occlusion protein  25.4 
 
 		 196 aa  64.3  0.000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000213488  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0111  transcriptional regulator, TetR family  26.01 
 
 		 205 aa  63.2  0.000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00780937  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2645  TetR family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 194 aa  63.5  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.154552  normal  0.491764 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2558  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 190 aa  63.5  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3502  nucleoid occlusion protein  25.39 
 
 		 195 aa  63.9  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.284468  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0855  transcriptional regulator, TetR family  30.05 
 
 		 223 aa  63.2  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.835032 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 217 aa  62.8  0.000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1117  nucleoid occlusion protein  21.89 
 
 		 200 aa  62.8  0.000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.862438  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0117  TetR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 208 aa  62.4  0.000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.966538  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1756  transcriptional regulator, TetR family  31.07 
 
 		 205 aa  62  0.000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000229906 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2065  transcriptional regulator, TetR family  25.81 
 
 		 188 aa  62  0.000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31350  hypothetical protein  32.76 
 
 		 203 aa  60.8  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.112877  normal  0.357558 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0501  nucleoid occlusion protein  21.18 
 
 		 220 aa  60.8  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.957497  normal  0.22516 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3979  transcriptional regulator, TetR family  26 
 
 		 222 aa  60.8  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.318215  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0828  transcriptional regulator, TetR family  24.04 
 
 		 195 aa  60.8  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2389  nucleoid occlusion protein  25.29 
 
 		 204 aa  60.5  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.102395  normal  0.522775 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3049  transcriptional regulator, TetR family  26.58 
 
 		 214 aa  59.7  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1592  transcriptional regulator, TetR family  27.53 
 
 		 198 aa  60.1  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0450  transcriptional regulator, TetR family  27.85 
 
 		 349 aa  59.7  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0035112 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0863  TetR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 181 aa  59.3  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4824  TetR family transcriptional regulator  25.36 
 
 		 228 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0665  TetR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 195 aa  59.3  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0373  nucleoid occlusion protein  22.87 
 
 		 197 aa  59.3  0.00000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0485263  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0385  nucleoid occlusion protein  22.87 
 
 		 197 aa  59.3  0.00000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000224895  hitchhiker  0.00861349 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1283  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 194 aa  59.3  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000248972  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4171  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 203 aa  58.9  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0201849  hitchhiker  0.000462956 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0374  nucleoid occlusion protein  22.87 
 
 		 197 aa  59.3  0.00000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000212742  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0399  nucleoid occlusion protein  22.87 
 
 		 197 aa  59.3  0.00000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0627309  hitchhiker  0.000000000130483 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>