More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_0973 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_0973  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 198 aa  389  1e-107  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0620  TetR family transcriptional regulator  76.47 
 
 		 193 aa  281  5.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0633  TetR family transcriptional regulator  76.47 
 
 		 193 aa  281  5.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0611  TetR family transcriptional regulator  76.47 
 
 		 193 aa  281  5.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0170  TetR family transcriptional regulator  49.44 
 
 		 192 aa  164  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.652591  normal  0.659974 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10920  transcriptional regulator  40.51 
 
 		 201 aa  123  1e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0917166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0589  TetR family transcriptional regulator  37.3 
 
 		 191 aa  114  6.9999999999999995e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1681  TetR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 217 aa  109  3e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.371055  normal  0.828695 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4115  transcriptional regulator, TetR family  36.92 
 
 		 194 aa  108  4.0000000000000004e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.1417 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1613  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 189 aa  93.6  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.066311 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26800  transcriptional regulator  36.14 
 
 		 184 aa  89  4e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.463482  normal  0.288316 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3798  TetR family transcriptional regulator  33.53 
 
 		 191 aa  84  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.164802  normal  0.867379 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3794  TetR family transcriptional regulator  33.53 
 
 		 191 aa  82.4  0.000000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.549336  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3867  TetR family transcriptional regulator  33.53 
 
 		 191 aa  82.4  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0211824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4249  TetR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 191 aa  73.9  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.399807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0309  transcriptional regulator, TetR family  30.67 
 
 		 213 aa  70.5  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.302465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  31.93 
 
 		 203 aa  69.3  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8152  putative transcriptional regulator, TetR family  31.79 
 
 		 174 aa  68.6  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.687421 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 291 aa  67.4  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0817  TetR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 332 aa  67  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4604  transcriptional regulator, TetR family  28.8 
 
 		 255 aa  65.5  0.0000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2104  TetR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 191 aa  62  0.000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.230608 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0068  transcriptional regulator, TetR family  32.68 
 
 		 185 aa  61.6  0.000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.139926 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3944  putative transcriptional regulator, TetR family  38.27 
 
 		 183 aa  61.6  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000137534  hitchhiker  0.00939559 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0410  TetR family transcriptional regulator  38.32 
 
 		 245 aa  60.5  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.560758  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3004  transcriptional regulator, TetR family  35.51 
 
 		 186 aa  61.2  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.519568  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0421  transcriptional regulator, TetR family  35.35 
 
 		 198 aa  60.1  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0140  TetR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 176 aa  59.7  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4091  TetR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 222 aa  59.3  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0267897 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0042  TetR family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 219 aa  58.5  0.00000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.664551  normal  0.814156 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2497  TetR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.55388 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3710  regulatory protein, TetR  38.03 
 
 		 230 aa  56.6  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1590  transcriptional regulator, TetR family  37.88 
 
 		 231 aa  57  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.299217  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63880  putative transcriptional regulator  29.28 
 
 		 186 aa  57  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 217 aa  56.2  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  23.03 
 
 		 190 aa  55.5  0.0000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0051  transcriptional regulator, TetR family  43.55 
 
 		 250 aa  55.1  0.0000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1044  TetR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 180 aa  55.5  0.0000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0206033 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  23.35 
 
 		 190 aa  55.5  0.0000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0054  transcriptional regulator, TetR family  43.55 
 
 		 250 aa  55.1  0.0000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3170  TetR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 202 aa  54.7  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.148676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4432  TetR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 208 aa  55.1  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.21103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1101  TetR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 188 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.205673  normal  0.0164026 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1170  transcriptional regulator, TetR family  36.47 
 
 		 184 aa  53.9  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1393  TetR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 205 aa  53.9  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2645  TetR family transcriptional regulator  25.73 
 
 		 194 aa  53.5  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.154552  normal  0.491764 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3892  regulatory protein TetR  30.34 
 
 		 214 aa  53.5  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1005  transcriptional regulator, TetR family  38.37 
 
 		 218 aa  53.9  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0351  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 230 aa  53.9  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  36.62 
 
 		 201 aa  53.5  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5186  transcriptional regulator, TetR family  24.68 
 
 		 185 aa  53.1  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.225373  normal  0.188797 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02513  transcriptional regulator, TetR family protein  35 
 
 		 214 aa  52.8  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0162  transcription regulator protein  41.94 
 
 		 233 aa  52.8  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.1146  normal  0.445023 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6913  putative transcriptional regulator, TetR family  27.96 
 
 		 183 aa  52.8  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0402  transcriptional regulator, TetR family  45.16 
 
 		 219 aa  52.4  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.67084  normal  0.0771341 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2327  transcriptional regulator, TetR family  39.39 
 
 		 192 aa  52.4  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.215572  normal  0.48242 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4041  TetR family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 182 aa  52  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.449289  normal  0.0505107 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4830  transcriptional regulator, TetR family  46.43 
 
 		 226 aa  52.4  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.456248  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2499  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 208 aa  52  0.000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0659  transcriptional regulator TetR family  35.82 
 
 		 196 aa  52  0.000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1287  regulatory protein, TetR  32.17 
 
 		 234 aa  52  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5550  TetR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 190 aa  51.6  0.000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3665  TetR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 228 aa  51.6  0.000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2110  transcriptional regulator, TetR family  34.62 
 
 		 200 aa  51.6  0.000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0942807  normal  0.362877 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 231 aa  51.6  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4094  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 204 aa  51.2  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0325183  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0527  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  34.38 
 
 		 217 aa  50.1  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0518  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  34.38 
 
 		 217 aa  50.1  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.35266  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3720  transcriptional regulator, TetR family  41.07 
 
 		 200 aa  50.4  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.91394  normal  0.0177543 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3089  TetR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 204 aa  50.1  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0537  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  34.38 
 
 		 217 aa  50.1  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.355505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2034  TetR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 228 aa  50.4  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.743283  decreased coverage  0.000716409 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1380  transcriptional regulator, TetR family  31.53 
 
 		 214 aa  50.1  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000685689  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0312  TetR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 182 aa  50.1  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4581  TetR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 453 aa  50.4  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0520678  hitchhiker  0.00576912 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  30.3 
 
 		 207 aa  50.4  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0580  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  34.38 
 
 		 217 aa  50.1  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0809226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3232  TetR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 204 aa  50.1  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0521  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  34.38 
 
 		 217 aa  50.1  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0327711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4218  TetR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 202 aa  50.1  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.135159  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1305  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 181 aa  49.7  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20320  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 203 aa  49.7  0.00003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0408  transcriptional regulator, TetR family  32.32 
 
 		 212 aa  49.7  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2556  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 208 aa  49.7  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000000489141  normal  0.182844 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0944  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  34.38 
 
 		 217 aa  49.7  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0349  transcriptional regulator, TetR family  29.85 
 
 		 237 aa  49.3  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1844  transcriptional regulator, TetR family  24.41 
 
 		 214 aa  49.7  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17710  transcriptional regulator  38.33 
 
 		 203 aa  49.7  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0632938  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3149  TetR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 205 aa  49.7  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2481  TetR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 231 aa  49.7  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2723  transcriptional regulator, TetR family  37.1 
 
 		 224 aa  49.7  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0252111  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5798  putative transcriptional regulator  34.29 
 
 		 205 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3496  TetR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 223 aa  49.7  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.591625 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0825  TetR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 222 aa  49.7  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5257  transcriptional regulator, TetR family  37.04 
 
 		 194 aa  49.7  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.570583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1924  TetR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 189 aa  49.3  0.00004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.147097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0370  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 223 aa  49.3  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0234884  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0594  TetR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 208 aa  48.9  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1710  transcriptional regulator, TetR family  27.01 
 
 		 200 aa  49.3  0.00004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000037358  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1166  TetR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 278 aa  48.9  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0604682  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>