More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2656 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2656  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 212 aa  427  1e-119  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000478919  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2778  TetR family transcriptional regulator  52.48 
 
 		 205 aa  227  1e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1848  TetR family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 210 aa  142  4e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2592  transcriptional regulator, TetR family  28.06 
 
 		 192 aa  67  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.119823  normal  0.0690788 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4215  TetR family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 269 aa  61.6  0.000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.261755 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0027  TetR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 209 aa  60.8  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790094 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1320  transcriptional regulator, TetR family  26.64 
 
 		 224 aa  59.3  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1061  transcriptional regulator, TetR family  30.72 
 
 		 196 aa  58.9  0.00000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0250707  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2367  TetR family transcriptional regulator  24.1 
 
 		 202 aa  55.1  0.0000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.445055  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0651  TetR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 218 aa  54.7  0.0000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0025795  normal  0.249536 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1381  transcriptional regulator, TetR family  27.88 
 
 		 184 aa  53.9  0.000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.419771  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6871  TetR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 224 aa  53.5  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.405099  normal  0.0580493 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0828  transcriptional regulator, TetR family  25.29 
 
 		 195 aa  53.5  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1941  transcriptional regulator, TetR family  24.42 
 
 		 194 aa  52.4  0.000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000874649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1709  transcriptional regulator, TetR family  34.18 
 
 		 207 aa  52.4  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17641  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1794  TetR family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 218 aa  52.4  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6487  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 195 aa  52.4  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2518  transcriptional regulator, TetR family  35.48 
 
 		 191 aa  52  0.000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0208752  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1592  transcriptional regulator, TetR family  26.5 
 
 		 198 aa  52.4  0.000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2583  TetR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 226 aa  52  0.000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.176518 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10279  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 241 aa  51.6  0.000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000004651  normal  0.205699 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3581  TetR family transcriptional regulator  24.53 
 
 		 209 aa  51.6  0.000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3038  transcriptional regulator  27.2 
 
 		 230 aa  51.2  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1826  TetR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 250 aa  51.6  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0995188  normal  0.24055 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4737  TetR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 224 aa  51.2  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  27.51 
 
 		 218 aa  51.6  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4031  DNA-binding transcriptional repressor FabR  26.88 
 
 		 199 aa  51.2  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8200  putative transcriptional regulator, TetR family  29.5 
 
 		 237 aa  51.2  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.53611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2128  transcriptional regulator, TetR family  42.65 
 
 		 202 aa  51.2  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.190242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2132  TetR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 231 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.273159  normal  0.36697 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0455  TetR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 224 aa  50.4  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366206  normal  0.106872 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4652  TetR family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 195 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1537  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 257 aa  50.4  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4533  transcriptional regulator, TetR family  25.15 
 
 		 197 aa  50.1  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0585795  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6397  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 218 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.467706 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1018  transcriptional regulator, TetR family  25.23 
 
 		 205 aa  50.1  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3432  TetR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 211 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0339823  normal  0.853068 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3645  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 199 aa  49.7  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.529358  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0782  transcriptional regulator, TetR family  31.76 
 
 		 295 aa  50.1  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.876045  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2118  transcriptional regulator, TetR family  31.91 
 
 		 201 aa  49.7  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000195115  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2628  transcriptional regulator, TetR family  23.7 
 
 		 194 aa  50.1  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3361  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 238 aa  49.7  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.752589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2726  transcriptional regulator, TetR family  25.69 
 
 		 203 aa  49.7  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544157 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2214  transcriptional regulator, TetR family  28.07 
 
 		 201 aa  49.3  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000301704  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5792  transcriptional regulator, TetR family  29.1 
 
 		 216 aa  49.3  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4572  TetR family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 234 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224675 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03580  DNA-binding transcriptional repressor FabR  27.5 
 
 		 197 aa  48.9  0.00005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.163329  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1392  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 205 aa  48.9  0.00006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6189  TetR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 210 aa  48.9  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.304814  normal  0.805788 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3517  transcriptional regulator protein  26.58 
 
 		 208 aa  48.5  0.00007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.873146  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4353  TetR family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 195 aa  48.5  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3806  TetR family transcriptional regulator  20.73 
 
 		 238 aa  48.5  0.00007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65239  normal  0.316965 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0512  TetR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 201 aa  48.5  0.00007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4633  transcriptional regulator, TetR family  24.31 
 
 		 195 aa  48.5  0.00008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.169287  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4653  transcriptional regulator, TetR family  24.31 
 
 		 195 aa  48.5  0.00008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1458  TetR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 209 aa  48.1  0.00008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121951 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4421  TetR family transcriptional regulator  24.71 
 
 		 195 aa  48.1  0.00009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4260  transcriptional regulator  24.71 
 
 		 195 aa  48.1  0.00009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4272  transcriptional regulator  24.71 
 
 		 195 aa  48.1  0.00009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4762  TetR family transcriptional regulator  24.71 
 
 		 195 aa  48.1  0.00009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1133  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 206 aa  48.1  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.660169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3225  TetR family transcriptional regulator  24.31 
 
 		 195 aa  48.1  0.00009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4637  transcriptional regulator, TetR family  24.71 
 
 		 195 aa  48.1  0.00009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4687  transcriptional regulator, TetR family  23.91 
 
 		 259 aa  47.8  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.717984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3407  TetR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 218 aa  48.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0155576  normal  0.84746 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4404  TetR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 199 aa  47.8  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0114676  normal  0.191291 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2080  TetR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 219 aa  47.8  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.740876  hitchhiker  0.00831587 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6801  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 217 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.142519  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2786  regulatory protein TetR  28.74 
 
 		 243 aa  48.1  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2871  TetR family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 213 aa  47.8  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3267  TetR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 188 aa  47.8  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21730  transcriptional regulator  19.37 
 
 		 179 aa  47.8  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000276333  normal  0.440212 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01587  DNA-binding transcriptional repressor  26.52 
 
 		 196 aa  47  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2024  transcriptional regulator, TetR family  27.87 
 
 		 192 aa  47  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.180766  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2817  transcriptional regulator, TetR family  26.09 
 
 		 210 aa  47  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.318929  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8965  putative transcriptional regulator, TetR family  28.35 
 
 		 173 aa  47  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0602  transcriptional regulator, TetR family  23.76 
 
 		 195 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01577  hypothetical protein  26.52 
 
 		 196 aa  47  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.98021  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1805  transcriptional regulator UidR  26.52 
 
 		 196 aa  47  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.947665  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1290  AcrR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 199 aa  47.4  0.0002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2226  TetR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 210 aa  46.6  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1826  transcriptional regulator UidR  26.52 
 
 		 196 aa  47  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1094  transcriptional regulator, TetR family  26.4 
 
 		 199 aa  47  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.877312 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2330  transcriptional regulator UidR  26.52 
 
 		 195 aa  47  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3943  transcriptional regulator, TetR family  39.47 
 
 		 218 aa  47.4  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.938406  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2012  TetR family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 196 aa  47  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.952906  normal  0.615913 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2856  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 194 aa  46.6  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.661308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0081  transcriptional regulator, TetR family  29.63 
 
 		 202 aa  47  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3474  transcriptional regulator of TetR family protein  37.1 
 
 		 191 aa  47  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.486624 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1581  transcriptional regulator UidR  27.87 
 
 		 192 aa  47  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2032  TetR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 213 aa  47  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.44645  normal  0.684987 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1693  transcriptional regulator UidR  26.52 
 
 		 196 aa  47  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00269  transcriptional regulator BetI  36.36 
 
 		 195 aa  46.6  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.547366  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0372  transcriptional regulator BetI  36.36 
 
 		 195 aa  46.6  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2510  TetR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 209 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00262483  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0375  transcriptional regulator BetI  36.36 
 
 		 195 aa  46.6  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0868398 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3310  transcriptional regulator BetI  36.36 
 
 		 195 aa  46.6  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3806  transcriptional regulator, TetR family  27.42 
 
 		 209 aa  46.6  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.238661 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0344  transcriptional regulator BetI  36.36 
 
 		 195 aa  46.6  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2115  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 213 aa  46.6  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00202765  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>