169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3641 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_3641  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 197 aa  393  1e-108  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.334684 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35780  TetR family regulatory protein  56.91 
 
 		 205 aa  218  3e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3067  TetR family transcriptional regulator  57.51 
 
 		 199 aa  212  2.9999999999999995e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2442  transcriptional regulator, TetR family  54.87 
 
 		 223 aa  203  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3073  TetR family transcriptional regulator  55.56 
 
 		 198 aa  199  3e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0121  regulatory protein, TetR  50 
 
 		 209 aa  193  1e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.602969 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4161  putative transcriptional regulator  54.87 
 
 		 202 aa  190  1e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.674844  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4995  transcriptional regulator, TetR family  53.3 
 
 		 198 aa  186  2e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2069  TetR family transcriptional regulator  51.83 
 
 		 198 aa  185  4e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0836  transcriptional regulator, TetR family  46.94 
 
 		 199 aa  183  1.0000000000000001e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3535  TetR family transcriptional regulator  51.79 
 
 		 210 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.926686  normal  0.288543 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48420  putative transcriptional regulator  52.82 
 
 		 202 aa  182  3e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0011363  normal  0.230392 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3539  TetR family transcriptional regulator  48.89 
 
 		 203 aa  164  5.9999999999999996e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.318561 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19560  transcriptional regulator, tetR family  39.25 
 
 		 205 aa  129  4.0000000000000003e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.186862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3389  transcriptional regulator, TetR family  39.34 
 
 		 187 aa  120  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0771  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 204 aa  94.4  1e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5284  TetR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 208 aa  66.6  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0597036  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  35.58 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3256  transcriptional regulator, TetR family  46.38 
 
 		 220 aa  56.6  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.757999  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3836  transcriptional regulator, TetR family  30.91 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0908  transcriptional regulator, TetR family  34.29 
 
 		 207 aa  54.7  0.0000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469028  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3157  TetR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 330 aa  54.3  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1537  TetR family transcriptional regulator  25.5 
 
 		 257 aa  54.3  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0710  transcriptional regulator, TetR family  40.91 
 
 		 248 aa  53.9  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32320  transcriptional regulator, TetR family  31.33 
 
 		 200 aa  53.5  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.247928 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3992  transcriptional regulator, TetR family  39.34 
 
 		 218 aa  53.1  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1903  transcriptional regulator, TetR family  27.57 
 
 		 192 aa  52.8  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0461172  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0872  transcriptional regulator, TetR family  39.13 
 
 		 211 aa  52.4  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.678947 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4247  TetR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 212 aa  52  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4333  TetR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 212 aa  52  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.771402  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4626  TetR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 212 aa  52  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28930  transcriptional regulator  37.93 
 
 		 205 aa  51.6  0.000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.218384 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0994  transcriptional regulator, TetR family  28.8 
 
 		 271 aa  51.6  0.000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0518  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 206 aa  51.2  0.000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290772  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1597  putative transcriptional regulator, TetR family  48.94 
 
 		 174 aa  51.2  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4944  TetR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 199 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.869277  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5032  TetR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 199 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4778  TetR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 217 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5325  TetR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 199 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.586018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11037  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 197 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.102388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1558  regulatory protein TetR  39.34 
 
 		 220 aa  50.8  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3183  transcriptional regulator, TetR family  36.26 
 
 		 220 aa  51.2  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2993  TetR family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 206 aa  50.8  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  34.82 
 
 		 222 aa  50.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0340  transcriptional regulator, TetR family  31.63 
 
 		 388 aa  50.4  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5866  TetR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 236 aa  50.1  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1216  TetR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 204 aa  49.7  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1436  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 125 aa  49.3  0.00004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000772402  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11350  transcriptional regulator  37.68 
 
 		 220 aa  49.3  0.00004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30200  transcriptional regulator, TetR family  37.7 
 
 		 231 aa  49.3  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.296423  normal  0.124528 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1050  transcriptional regulator, TetR family  38.71 
 
 		 225 aa  48.9  0.00005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.549541 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0166  transcriptional regulator, TetR family  28.4 
 
 		 221 aa  48.5  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0611363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3962  putative transcriptional regulator, TetR family  33.71 
 
 		 194 aa  48.5  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.545183  normal  0.218359 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6545  TetR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 227 aa  48.5  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.129926 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0731  TetR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 227 aa  48.1  0.00007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250469 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6061  TetR family transcriptional regulator  43.16 
 
 		 191 aa  48.1  0.00008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.660328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1947  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 197 aa  48.1  0.00008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1286  transcriptional regulator, TetR family  41.38 
 
 		 199 aa  48.1  0.00008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000123202 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2710  transcriptional regulator, TetR family  37.7 
 
 		 218 aa  47.4  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.448517  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1137  transcriptional regulator, TetR family  21.8 
 
 		 193 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0982  TetR family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 193 aa  46.6  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0971  TetR family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 193 aa  46.6  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0971  TetR family transcriptional regulator  21.05 
 
 		 193 aa  47  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 216 aa  46.6  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1052  TetR family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 193 aa  46.6  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3806  TetR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 238 aa  46.6  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65239  normal  0.316965 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1265  transcriptional regulator, TetR family  35.82 
 
 		 249 aa  46.6  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0071426 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13232  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 228 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.414971 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5991  TetR family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 244 aa  47  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0553876 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0522  TetR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 219 aa  47  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1204  transcriptional regulator, TetR family  41.18 
 
 		 206 aa  47  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.260768  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5697  TetR family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 227 aa  46.6  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.949992  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0194  transcriptional regulator, TetR family  40.98 
 
 		 225 aa  46.2  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5607  transcriptional regulator, TetR family  38.6 
 
 		 209 aa  46.2  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.897418  normal  0.557491 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1217  transcriptional regulator, TetR family  23.53 
 
 		 193 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1156  TetR family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 193 aa  45.8  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.813518  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6105  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 201 aa  45.8  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.93473  normal  0.666323 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13360  transcriptional regulator, TetR family  32.41 
 
 		 215 aa  45.8  0.0004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0417905  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0381  TetR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 212 aa  45.8  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0787  regulatory protein, TetR  39.34 
 
 		 226 aa  45.8  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8610  putative transcriptional regulator, TetR family  32.76 
 
 		 317 aa  45.8  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0452  TetR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 212 aa  45.8  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.681881  decreased coverage  0.00000297509 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1238  AcrR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 273 aa  45.8  0.0004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3795  transcriptional regulator, TetR family  40.58 
 
 		 202 aa  45.8  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.277058  hitchhiker  0.000257317 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2260  regulatory protein TetR  28.72 
 
 		 199 aa  45.4  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.535255  normal  0.350629 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0984  transcriptional regulator, TetR family  44.64 
 
 		 245 aa  45.4  0.0005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.50937  hitchhiker  0.00233885 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2497  transcriptional regulator, TetR family  29.55 
 
 		 221 aa  45.4  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000693939 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2950  TetR family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 217 aa  45.4  0.0006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000171699 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0584  transcriptional regulator, TetR family  38.24 
 
 		 207 aa  45.4  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2620  TetR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 194 aa  45.1  0.0007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.727172  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2290  transcriptional regulator, TetR family  39.29 
 
 		 208 aa  45.1  0.0007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0794358  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1331  transcriptional regulator, TetR family  29.37 
 
 		 201 aa  45.1  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1795  TetR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 224 aa  44.7  0.0009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1244  TetR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 206 aa  44.7  0.0009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2329  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 186 aa  44.7  0.0009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.148714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1640  TetR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 226 aa  44.7  0.0009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0974  TetR family transcriptional regulator  22.14 
 
 		 194 aa  44.7  0.0009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0868  transcriptional regulator, TetR family  46.94 
 
 		 230 aa  43.9  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.200185 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1496  transcriptional regulator, TetR family  32.79 
 
 		 206 aa  44.3  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0138  TetR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 218 aa  44.3  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>