132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3329 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_3329  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 
197 aa  390  1e-108  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0147538 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3055  TetR family transcriptional regulator  72.08 
 
 
197 aa  288  4e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.170203  normal  0.155543 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2767  TetR family transcriptional regulator  56.15 
 
 
186 aa  167  1e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2811  TetR family transcriptional regulator  56.15 
 
 
186 aa  167  1e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.548519  normal  0.159647 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2794  TetR family transcriptional regulator  56.15 
 
 
186 aa  167  1e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.630327  normal  0.795605 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6632  transcriptional regulator, TetR family  34.15 
 
 
226 aa  67.4  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.000455029  decreased coverage  0.000000500161 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06720  transcriptional regulator, tetR family  33.53 
 
 
204 aa  58.9  0.00000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.172688  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1193  TetR family transcriptional regulator  22.49 
 
 
210 aa  55.8  0.0000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000366279  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0874  TetR family transcriptional regulator  23.9 
 
 
188 aa  55.1  0.0000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0483  transcriptional regulator  26.04 
 
 
172 aa  53.9  0.000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000428437  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4295  hypothetical protein  23.3 
 
 
188 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0888  TetR family transcriptional regulator  23.95 
 
 
188 aa  52.8  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.845655  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0869  TetR family transcriptional regulator  23.95 
 
 
188 aa  52.8  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2544  transcriptional regulator, TetR family  22.94 
 
 
194 aa  52.8  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.49291 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2667  transcriptional regulator, TetR family  27.75 
 
 
200 aa  52.8  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1053  hypothetical protein  23.95 
 
 
188 aa  52.4  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00146188  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0906  hypothetical protein  23.95 
 
 
188 aa  52.4  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0964  hypothetical protein  23.95 
 
 
188 aa  52.4  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1007  hypothetical protein  23.95 
 
 
188 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.374839  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2683  transcriptional regulator, TetR family  40.62 
 
 
219 aa  52  0.000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0774408  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1751  TetR family transcriptional regulator  24.07 
 
 
182 aa  52  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000821157  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3735  TetR family transcriptional regulator  30.95 
 
 
202 aa  51.2  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1133  hypothetical protein  23.27 
 
 
188 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2615  TetR family transcriptional regulator  21.91 
 
 
195 aa  50.4  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2669  hypothetical protein  21.91 
 
 
195 aa  50.4  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0158  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 
228 aa  50.4  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04830  transcriptional regulator  39.66 
 
 
228 aa  50.4  0.00002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.764774  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1514  AcrR family transcriptional regulator  25.81 
 
 
189 aa  50.1  0.00002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0987  transcriptional regulator, TetR-related family  20.12 
 
 
191 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0015  TetR family transcriptional regulator  26.53 
 
 
189 aa  49.7  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2357  transcriptional regulator, TetR family  24.02 
 
 
190 aa  49.7  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0067585  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4929  putative transcriptional regulator, TetR family  29.07 
 
 
205 aa  49.3  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.182818  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1114  transcriptional regulator, TetR-related family  20.36 
 
 
191 aa  49.3  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0403  TetR family transcriptional regulator  24.86 
 
 
195 aa  48.9  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0905  putative transcriptional regulator, TetR family  32.93 
 
 
183 aa  48.5  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3662  TetR family transcriptional regulator  20.38 
 
 
178 aa  48.1  0.00007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4326  transcriptional regulator, TetR-related family  19.76 
 
 
191 aa  48.5  0.00007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1792  TetR family transcriptional regulator  33.65 
 
 
198 aa  48.1  0.00008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0956  transcriptional regulator  26.89 
 
 
177 aa  48.1  0.00008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0752812  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2392  transcriptional regulator, TetR family  37.97 
 
 
184 aa  48.1  0.00009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.255301 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0247  transcriptional regulator, putative  23.81 
 
 
189 aa  47.8  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3663  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
201 aa  47.8  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.579152  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07230  transcriptional regulator  31.94 
 
 
205 aa  47.4  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.350601  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0813  transcriptional regulator  21.47 
 
 
181 aa  47.4  0.0001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000037914  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1094  transcriptional regulator, TetR family  28.24 
 
 
199 aa  47.8  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.877312 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1710  hypothetical protein  26.57 
 
 
289 aa  47.8  0.0001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3983  transcriptional regulator, TetR family  42.62 
 
 
200 aa  47.4  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4701  TetR family transcriptional regulator  39.62 
 
 
205 aa  47  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000742649  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0887  TetR family transcriptional regulator  21.47 
 
 
191 aa  47.4  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2898  TetR family transcriptional regulator  34.55 
 
 
205 aa  46.6  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4466  TetR family transcriptional regulator  39.62 
 
 
205 aa  47  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00176628  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4301  TetR family transcriptional regulator  39.62 
 
 
205 aa  47  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000465082  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4312  TetR family transcriptional regulator  39.62 
 
 
205 aa  47  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0243746  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6804  TetR family transcriptional regulator  37.14 
 
 
209 aa  46.6  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.758559 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0943  TetR family transcriptional regulator  21.47 
 
 
191 aa  47.4  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3115  TetR family transcriptional regulator  34.55 
 
 
205 aa  46.6  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4814  TetR family transcriptional regulator  39.62 
 
 
205 aa  47  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00735833  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2594  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
195 aa  47  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2648  regulatory protein TetR  37.5 
 
 
195 aa  47  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4401  TetR family transcriptional regulator  21.76 
 
 
205 aa  47  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00379703  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4694  transcriptional regulator, TetR family  39.62 
 
 
205 aa  47  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000803209  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4678  transcriptional regulator, TetR family  39.62 
 
 
205 aa  47  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000014554  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0559  transcriptional regulator, TetR family  39.62 
 
 
205 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000271654  hitchhiker  2.35635e-17 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1027  transcriptional regulator, TetR-related family  21.47 
 
 
191 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.34456e-23 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3118  transcriptional regulator, TetR family  34.55 
 
 
205 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4685  transcriptional regulator, TetR family  39.62 
 
 
205 aa  47  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.17076e-49 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00570  transcriptional regulator, tetR family  25.14 
 
 
218 aa  46.2  0.0003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3152  transcriptional regulator, TetR family  31.36 
 
 
248 aa  46.2  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.262017  normal  0.121031 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3200  TetR family transcriptional regulator  26.53 
 
 
224 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.415485  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0215  transcriptional regulator  31.37 
 
 
191 aa  46.2  0.0003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.532306  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3262  TetR family transcriptional regulator  26.53 
 
 
224 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.376016  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3209  TetR family transcriptional regulator  26.53 
 
 
224 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1367  TetR family transcriptional regulator  23.17 
 
 
181 aa  46.6  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2893  TetR family transcriptional regulator  34.55 
 
 
205 aa  46.2  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0699347  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3106  transcriptional regulator, TetR family  34.55 
 
 
205 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2824  TetR family transcriptional regulator  34.55 
 
 
211 aa  45.8  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.551621  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0421  TetR family transcriptional regulator  22.84 
 
 
182 aa  45.8  0.0004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2131  transcriptional regulator, TetR family  34.55 
 
 
205 aa  45.8  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3136  TetR family transcriptional regulator  34.55 
 
 
205 aa  45.4  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.495546  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2867  TetR family transcriptional regulator  34.55 
 
 
211 aa  45.4  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.451195  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5054  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 
207 aa  45.4  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.817621 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3256  TetR family transcriptional regulator  36.54 
 
 
205 aa  45.1  0.0006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.20288  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05640  transcriptional regulator  31.62 
 
 
223 aa  45.4  0.0006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.950785  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3111  transcriptional regulator, TetR family  28.5 
 
 
203 aa  45.1  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.268901  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0605  transcriptional regulator, TetR family  26.47 
 
 
204 aa  45.1  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0842361  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3249  transcriptional regulator, putative  21.02 
 
 
210 aa  44.7  0.0008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00603591  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0367  TetR family transcriptional regulator  25.77 
 
 
205 aa  43.9  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.526712  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3919  transcriptional regulator, TetR family  39.08 
 
 
209 aa  44.3  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.738583 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7136  transcriptional regulator, TetR family  34.07 
 
 
237 aa  44.3  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00720754  normal  0.217815 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0377  TetR family transcriptional regulator  25.77 
 
 
205 aa  43.9  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0356  TetR family transcriptional regulator  25.77 
 
 
205 aa  43.9  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1669  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 
225 aa  44.7  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0413702  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0610  TetR family transcriptional regulator  19.75 
 
 
189 aa  44.3  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.442155  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0844  TetR family transcriptional regulator  19.16 
 
 
191 aa  43.9  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2738  TetR family transcriptional regulator  33.96 
 
 
181 aa  44.7  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000104447  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3806  transcriptional regulator, TetR family  39.08 
 
 
209 aa  44.3  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.238661 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1009  transcriptional regulator, TetR family  19.77 
 
 
184 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.874383  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3139  transcriptional regulator, TetR family  32.73 
 
 
205 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.145779  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1310  TetR family transcriptional regulator  22.46 
 
 
182 aa  43.9  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000104064  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2401  TetR family transcriptional regulator  34 
 
 
207 aa  43.9  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.148693  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>