More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5197 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5197  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 211 aa  420  1e-117  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128867  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0320  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 206 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4838  transcriptional regulator, TetR family  39.91 
 
 		 217 aa  132  3e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3152  transcriptional regulator, TetR family  38.5 
 
 		 248 aa  129  3e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.262017  normal  0.121031 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3166  transcriptional regulator, TetR family  39.5 
 
 		 234 aa  112  5e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.335744  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1169  TetR family transcriptional regulator  34.16 
 
 		 202 aa  111  7.000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4572  transcriptional regulator, TetR family  39.66 
 
 		 200 aa  105  7e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.209013  normal  0.793533 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5172  TetR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 201 aa  103  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.369972  normal  0.335335 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1840  transcriptional regulator, TetR family  34.09 
 
 		 213 aa  92  5e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0700993  normal  0.104485 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5790  transcriptional regulator, TetR family  33.5 
 
 		 220 aa  90.1  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0399068 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2521  TetR family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 200 aa  90.1  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3167  transcriptional regulator, TetR family  37.57 
 
 		 213 aa  89.7  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3153  transcriptional regulator, TetR family  33.51 
 
 		 243 aa  88.2  8e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.12439 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5977  transcriptional regulator, TetR family  31.75 
 
 		 271 aa  87.4  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.414781  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2355  transcriptional regulator, TetR family  31.69 
 
 		 204 aa  87.8  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.284642  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1914  TetR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 212 aa  80.1  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.183306 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0353  transcriptional regulator, TetR family  33.7 
 
 		 228 aa  80.1  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0616658  normal  0.0838621 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4885  putative transcriptional regulator, TetR family  30.85 
 
 		 202 aa  75.9  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0329972  normal  0.0964504 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2639  transcriptional regulator, TetR family  34.86 
 
 		 196 aa  68.2  0.00000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.302097  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1674  TetR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 192 aa  68.2  0.00000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.344236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10136  transcriptional regulator  33.99 
 
 		 201 aa  66.2  0.0000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.984674 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1013  TetR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 209 aa  65.9  0.0000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.421012  normal  0.993866 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4936  TetR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 211 aa  65.1  0.0000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5713  TetR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 198 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5079  TetR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 190 aa  62.4  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9154  putative transcriptional regulator, TetR family  33.15 
 
 		 226 aa  62  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.231214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4215  TetR family transcriptional regulator  25.7 
 
 		 269 aa  61.2  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.261755 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3363  regulatory protein TetR  54.17 
 
 		 213 aa  61.2  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.268151  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1550  transcriptional regulator, TetR family  29.53 
 
 		 201 aa  60.8  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4507  TetR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 224 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.916577  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4594  TetR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 224 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.60513  normal  0.70435 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4890  TetR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 206 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.218482 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0919  TetR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 215 aa  59.3  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4680  transcriptional regulator, TetR family  34.34 
 
 		 236 aa  58.9  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0027  TetR family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 209 aa  58.2  0.00000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790094 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0969  TetR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 216 aa  57.4  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.19098 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1103  TetR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 185 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.716955  normal  0.719209 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0557  regulatory protein TetR  32.61 
 
 		 251 aa  57.4  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0994  transcriptional regulator, TetR family  30.19 
 
 		 214 aa  57.4  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.146386  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0908  TetR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 200 aa  55.8  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.376971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2592  transcriptional regulator, TetR family  29.55 
 
 		 192 aa  56.2  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.119823  normal  0.0690788 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3806  TetR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 238 aa  55.8  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65239  normal  0.316965 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0515  transcriptional regulator, TetR family  29.87 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2367  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 202 aa  55.5  0.0000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.445055  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5407  transcriptional regulator, TetR family  27.67 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.924589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0358  regulatory protein, TetR  32.37 
 
 		 240 aa  55.1  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000667156 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5094  TetR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 201 aa  55.1  0.0000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0170525  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5182  TetR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 193 aa  54.7  0.0000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5473  TetR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 193 aa  55.1  0.0000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.906106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1515  putative transcriptional regulator, TetR family  31.85 
 
 		 219 aa  54.3  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254086  hitchhiker  0.00363064 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1682  putative transcriptional regulator, TetR family  27.53 
 
 		 201 aa  53.9  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.546444 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4304  TetR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 202 aa  53.9  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148025  normal  0.676238 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1287  regulatory protein, TetR  32.5 
 
 		 234 aa  53.1  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13232  TetR family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 228 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.414971 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2628  transcriptional regulator, TetR family  24.2 
 
 		 194 aa  52.4  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0324  TetR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 203 aa  52.4  0.000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.720161 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2080  TetR family transcriptional regulator  24.39 
 
 		 219 aa  52  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.740876  hitchhiker  0.00831587 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2426  TetR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 205 aa  52  0.000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0436  TetR/AcrR family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 193 aa  52  0.000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00014648  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1451  TetR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 224 aa  52  0.000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1397  TetR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 224 aa  51.6  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.515474  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1415  TetR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 224 aa  51.6  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1922  transcriptional regulator, TetR family  31.34 
 
 		 201 aa  51.6  0.000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 216 aa  50.8  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3995  transcriptional regulator, TetR family  43.08 
 
 		 197 aa  51.2  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.200757  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0251  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 212 aa  51.2  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.714148  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22630  transcriptional regulator  27.61 
 
 		 202 aa  51.2  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3227  transcriptional regulator, TetR family  47.46 
 
 		 204 aa  50.8  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1473  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 195 aa  50.8  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0552  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 208 aa  50.8  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3357  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 211 aa  50.4  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0594456 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10440  transcriptional regulator  29.46 
 
 		 211 aa  50.4  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0189255  normal  0.0235057 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1142  transcriptional regulator, TetR family  28.06 
 
 		 236 aa  50.1  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.627372  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1335  transcriptional regulator, TetR family  30.85 
 
 		 194 aa  50.4  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.293374 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3016  transcriptional regulator, TetR family  25.47 
 
 		 209 aa  50.4  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150997  normal  0.125451 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2134  transcriptional regulator, TetR family  30.39 
 
 		 219 aa  50.4  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00399747  normal  0.0273951 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0828  transcriptional regulator, TetR family  27 
 
 		 195 aa  50.4  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3512  regulatory protein TetR  27.53 
 
 		 237 aa  50.4  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37010  transcriptional regulator  40 
 
 		 195 aa  49.7  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.545642 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0502  TetR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 221 aa  49.7  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2000  TetR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 234 aa  49.7  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.920156  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1866  transcriptional regulator, TetR family  41.94 
 
 		 207 aa  49.7  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1807  transcriptional regulator, TetR family  28.82 
 
 		 199 aa  49.7  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.366594 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3834  TetR family transcriptional regulator  25.51 
 
 		 216 aa  49.7  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000963392 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2610  TetR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 234 aa  49.7  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.341012  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2226  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 210 aa  50.1  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0548  transcriptional regulator, TetR family  28.12 
 
 		 208 aa  49.3  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06720  transcriptional regulator, TetR family  30.71 
 
 		 221 aa  49.3  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  34.29 
 
 		 222 aa  48.9  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 224 aa  49.3  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4743  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 212 aa  48.9  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0594  TetR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 208 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1795  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 224 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3172  TetR family transcriptional regulator  25.52 
 
 		 216 aa  48.9  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.547125 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2993  TetR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 206 aa  48.9  0.00006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2497  transcriptional regulator, TetR family  27.91 
 
 		 221 aa  48.9  0.00006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000693939 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2901  TetR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 218 aa  48.9  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.781877  normal  0.0527686 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2537  transcriptional regulator, TetR family  29.69 
 
 		 231 aa  48.9  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0203  regulatory protein TetR  40 
 
 		 186 aa  48.5  0.00007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.041689  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2304  transcriptional regulator, TetR family  36.47 
 
 		 201 aa  48.5  0.00007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>