145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_1103 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_1103  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 185 aa  375  1e-103  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.716955  normal  0.719209 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5713  TetR family transcriptional regulator  75.6 
 
 		 198 aa  262  2e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5473  TetR family transcriptional regulator  69.44 
 
 		 193 aa  253  9e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.906106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5094  TetR family transcriptional regulator  69.44 
 
 		 201 aa  253  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0170525  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5182  TetR family transcriptional regulator  69.44 
 
 		 193 aa  253  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10136  transcriptional regulator  61.88 
 
 		 201 aa  228  4e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.984674 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1674  TetR family transcriptional regulator  51.1 
 
 		 192 aa  185  3e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.344236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5079  TetR family transcriptional regulator  50.8 
 
 		 190 aa  179  2e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4507  TetR family transcriptional regulator  49.17 
 
 		 224 aa  166  2e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.916577  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4594  TetR family transcriptional regulator  49.17 
 
 		 224 aa  166  2e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.60513  normal  0.70435 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4890  TetR family transcriptional regulator  49.17 
 
 		 206 aa  166  2e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.218482 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2639  transcriptional regulator, TetR family  49.19 
 
 		 196 aa  164  6.9999999999999995e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.302097  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3363  regulatory protein TetR  44.32 
 
 		 213 aa  152  2e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.268151  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0353  transcriptional regulator, TetR family  37.16 
 
 		 228 aa  138  4.999999999999999e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0616658  normal  0.0838621 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1840  transcriptional regulator, TetR family  35.93 
 
 		 213 aa  102  4e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0700993  normal  0.104485 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2521  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 200 aa  99.8  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1914  TetR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 212 aa  91.7  5e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.183306 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4572  transcriptional regulator, TetR family  31.55 
 
 		 200 aa  90.5  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.209013  normal  0.793533 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2355  transcriptional regulator, TetR family  30.17 
 
 		 204 aa  88.6  5e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.284642  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4885  putative transcriptional regulator, TetR family  29.95 
 
 		 202 aa  77  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0329972  normal  0.0964504 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3152  transcriptional regulator, TetR family  29.94 
 
 		 248 aa  73.9  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.262017  normal  0.121031 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4838  transcriptional regulator, TetR family  28.74 
 
 		 217 aa  73.2  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3167  transcriptional regulator, TetR family  35.8 
 
 		 213 aa  66.2  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5197  transcriptional regulator, TetR family  28.95 
 
 		 211 aa  58.5  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128867  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3016  transcriptional regulator, TetR family  29.14 
 
 		 209 aa  57  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150997  normal  0.125451 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0320  transcriptional regulator, TetR family  26.83 
 
 		 206 aa  57  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5172  TetR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.369972  normal  0.335335 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5977  transcriptional regulator, TetR family  38.57 
 
 		 271 aa  55.8  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.414781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3153  transcriptional regulator, TetR family  27.74 
 
 		 243 aa  55.1  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.12439 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1169  TetR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 202 aa  54.7  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1381  transcriptional regulator, TetR family  24.11 
 
 		 184 aa  52  0.000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.419771  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1225  TetR family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 208 aa  51.6  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.657492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4588  transcriptional regulator, TetR family  26.92 
 
 		 206 aa  51.2  0.000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112472 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3512  regulatory protein TetR  31.76 
 
 		 237 aa  50.8  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1264  TetR family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 206 aa  50.8  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.599329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0097  TetR family transcriptional regulator  48.94 
 
 		 207 aa  49.3  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0406  transcriptional regulator, TetR family  41.82 
 
 		 206 aa  49.3  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0181245  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  24.32 
 
 		 310 aa  48.9  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0353  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 		 191 aa  48.5  0.00005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000439096  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3299  transcriptional regulator, TetR family  25.75 
 
 		 307 aa  48.9  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0705  regulatory protein, TetR  40 
 
 		 211 aa  47.8  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1969  TetR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 205 aa  47.4  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0320964 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6268  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 182 aa  47  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.700387  normal  0.409486 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0564  transcriptional regulator, TetR family  21.99 
 
 		 203 aa  47.4  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5790  transcriptional regulator, TetR family  34.29 
 
 		 220 aa  46.6  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0399068 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2883  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 211 aa  46.6  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0515  transcriptional regulator, TetR family  26.42 
 
 		 211 aa  47  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1314  transcriptional regulator, TetR family  29.03 
 
 		 201 aa  46.6  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.2142  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6912  TetR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 236 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.830717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2291  transcriptional regulator, TetR family  28.12 
 
 		 205 aa  46.6  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.857741  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3833  transcriptional regulator, TetR family  33.96 
 
 		 204 aa  46.6  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3862  regulatory protein, TetR  37.14 
 
 		 202 aa  45.8  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.07928  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5812  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 188 aa  45.8  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0159111 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3524  TetR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 187 aa  46.2  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2816  hypothetical protein  36.23 
 
 		 222 aa  45.8  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0366008  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0421  transcriptional regulator, TetR family  27.15 
 
 		 198 aa  45.4  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2161  transcriptional regulator, TetR family  32.5 
 
 		 204 aa  45.8  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5045  TetR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 206 aa  45.4  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.906168  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5815  TetR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 206 aa  45.4  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1851  transcriptional regulator, TetR family  28.31 
 
 		 201 aa  45.1  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.144681  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  26.53 
 
 		 207 aa  45.1  0.0006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0662  TetR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 205 aa  44.7  0.0008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4364  TetR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 206 aa  44.7  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0955  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 212 aa  44.3  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2294  TetR family regulatory protein  28.12 
 
 		 206 aa  44.3  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4691  TetR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 205 aa  43.9  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.771858  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1216  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 204 aa  43.9  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4777  TetR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 205 aa  43.9  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.681727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2739  transcriptional regulator, TetR family  31.65 
 
 		 225 aa  44.3  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000589766  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2102  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 206 aa  44.3  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.526616  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2161  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 206 aa  44.3  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.720901  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5076  TetR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 215 aa  43.9  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.175697 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1470  transcriptional regulator, TetR family  29.55 
 
 		 213 aa  43.9  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.772741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11037  TetR family transcriptional regulator  25.15 
 
 		 197 aa  43.9  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.102388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1369  transcriptional regulator, TetR family  35.56 
 
 		 197 aa  43.9  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.859804 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0908  TetR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 200 aa  43.5  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.376971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3755  TetR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 239 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8756  transcriptional regulator, TetR family  34.94 
 
 		 217 aa  43.5  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.387077  normal  0.0874834 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3828  TetR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 239 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3767  TetR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 239 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3750  TetR family transcriptional regulator  52.78 
 
 		 230 aa  43.5  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2499  transcriptional regulator, TetR family  28.3 
 
 		 208 aa  43.1  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5280  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 175 aa  43.5  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1745  TetR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 195 aa  42.4  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0399082  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2388  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 206 aa  42.4  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6341  TetR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 206 aa  42.4  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0497044  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1738  TetR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 206 aa  42.4  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1955  transcriptional regulator, TetR family  28.92 
 
 		 202 aa  42.7  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.22623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1941  transcriptional regulator, TetR family  22.96 
 
 		 189 aa  42.4  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.842083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 224 aa  42.4  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5045  TetR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 197 aa  42.7  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.820553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2373  TetR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 205 aa  42.7  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0144  TetR family transcriptional regulator  25.84 
 
 		 224 aa  42.7  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.522541  decreased coverage  0.0000264507 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1751  TetR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 206 aa  42.4  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2156  transcriptional regulator, TetR family  30.6 
 
 		 207 aa  42.7  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.362049 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4936  TetR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 211 aa  42.4  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3090  TetR family transcriptional regulator  25.49 
 
 		 218 aa  42.4  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.595832  hitchhiker  0.000923351 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0170  transcriptional regulator, TetR family  27.88 
 
 		 201 aa  42.4  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.307357  hitchhiker  0.00190078 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7950  putative transcriptional regulator, TetR family  26.27 
 
 		 218 aa  42.4  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1045  transcriptional regulator, TetR family  23.97 
 
 		 222 aa  42.4  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>