164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_5182 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_5094  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 201 aa  385  1e-106  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0170525  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5182  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 193 aa  385  1e-106  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5473  TetR family transcriptional regulator  99.48 
 
 		 193 aa  384  1e-106  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.906106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10136  transcriptional regulator  64.92 
 
 		 201 aa  251  3e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.984674 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1103  TetR family transcriptional regulator  69.44 
 
 		 185 aa  244  6e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.716955  normal  0.719209 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5713  TetR family transcriptional regulator  67.07 
 
 		 198 aa  231  6e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1674  TetR family transcriptional regulator  49.48 
 
 		 192 aa  177  1e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.344236  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3363  regulatory protein TetR  49.74 
 
 		 213 aa  172  2.9999999999999996e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.268151  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5079  TetR family transcriptional regulator  50.82 
 
 		 190 aa  171  6.999999999999999e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4507  TetR family transcriptional regulator  47.89 
 
 		 224 aa  167  1e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.916577  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4594  TetR family transcriptional regulator  47.89 
 
 		 224 aa  167  1e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.60513  normal  0.70435 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4890  TetR family transcriptional regulator  47.89 
 
 		 206 aa  167  1e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.218482 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2639  transcriptional regulator, TetR family  50.27 
 
 		 196 aa  161  7e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.302097  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0353  transcriptional regulator, TetR family  46.91 
 
 		 228 aa  151  7e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0616658  normal  0.0838621 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2521  TetR family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 200 aa  114  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2355  transcriptional regulator, TetR family  35.76 
 
 		 204 aa  100  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.284642  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4572  transcriptional regulator, TetR family  36.26 
 
 		 200 aa  99  4e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.209013  normal  0.793533 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1914  TetR family transcriptional regulator  35.15 
 
 		 212 aa  97.8  8e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.183306 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1840  transcriptional regulator, TetR family  35.5 
 
 		 213 aa  92.8  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0700993  normal  0.104485 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4838  transcriptional regulator, TetR family  33.89 
 
 		 217 aa  83.6  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4885  putative transcriptional regulator, TetR family  29.7 
 
 		 202 aa  72  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0329972  normal  0.0964504 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3152  transcriptional regulator, TetR family  35.48 
 
 		 248 aa  72  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.262017  normal  0.121031 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3167  transcriptional regulator, TetR family  35.44 
 
 		 213 aa  70.5  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0320  transcriptional regulator, TetR family  30.89 
 
 		 206 aa  64.7  0.0000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4588  transcriptional regulator, TetR family  28.03 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112472 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1169  TetR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 202 aa  55.5  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5977  transcriptional regulator, TetR family  29.03 
 
 		 271 aa  55.5  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.414781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3153  transcriptional regulator, TetR family  29.03 
 
 		 243 aa  55.5  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.12439 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5197  transcriptional regulator, TetR family  29.25 
 
 		 211 aa  54.7  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128867  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2161  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 204 aa  53.1  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0452  TetR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 212 aa  52.4  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.681881  decreased coverage  0.00000297509 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5790  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 220 aa  52  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0399068 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5172  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 201 aa  51.6  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.369972  normal  0.335335 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3512  regulatory protein TetR  32.18 
 
 		 237 aa  51.2  0.000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1264  TetR family transcriptional regulator  26.59 
 
 		 206 aa  50.8  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.599329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0662  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 205 aa  50.1  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1922  transcriptional regulator, TetR family  29.92 
 
 		 201 aa  50.4  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13590  TetR family transcriptional regulator  46.48 
 
 		 200 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.332381  normal  0.0844747 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1381  transcriptional regulator, TetR family  22.94 
 
 		 184 aa  50.1  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.419771  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1969  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 205 aa  49.3  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0320964 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5045  TetR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 206 aa  48.9  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.906168  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5815  TetR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 206 aa  48.9  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3910  TetR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 242 aa  48.9  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.104674 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 222 aa  49.3  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0381  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 212 aa  48.9  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2846  regulatory protein, TetR  35 
 
 		 227 aa  48.5  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1955  transcriptional regulator, TetR family  32.79 
 
 		 202 aa  47.8  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.22623  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3833  transcriptional regulator, TetR family  37.36 
 
 		 204 aa  47.4  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1827  regulatory protein, TetR  32.56 
 
 		 196 aa  47.4  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7816  transcriptional regulator, TetR family  31.03 
 
 		 216 aa  47.4  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4691  TetR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 205 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.771858  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4777  TetR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 205 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.681727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 224 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4931  TetR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 497 aa  47  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.475051  normal  0.080695 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2291  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 205 aa  47  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.857741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0406  transcriptional regulator, TetR family  41.07 
 
 		 206 aa  47  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0181245  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0955  TetR family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 212 aa  46.2  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2294  TetR family regulatory protein  25.95 
 
 		 206 aa  46.2  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2102  TetR family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 206 aa  46.2  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.526616  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2161  TetR family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 206 aa  46.2  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.720901  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5076  TetR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 215 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.175697 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0085  TetR family transcriptional regulator  24.82 
 
 		 195 aa  45.8  0.0003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.0016021  decreased coverage  0.0000722764 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1957  transcriptional regulator, TetR family  31.68 
 
 		 194 aa  46.2  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.292651 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3016  transcriptional regulator, TetR family  24.84 
 
 		 209 aa  45.8  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150997  normal  0.125451 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1851  transcriptional regulator, TetR family  31.03 
 
 		 201 aa  45.8  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.144681  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1795  TetR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 224 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4182  TetR family transcriptional regulator  25.22 
 
 		 201 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.368627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0138  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 218 aa  45.8  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2883  TetR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 211 aa  45.4  0.0005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15250  transcriptional regulator, tetR family  33.33 
 
 		 218 aa  45.4  0.0005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.110377  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4364  TetR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 206 aa  45.4  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0810  transcriptional regulator, TetR family  41.79 
 
 		 268 aa  45.1  0.0007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2712  TetR family transcriptional regulator  26.5 
 
 		 227 aa  44.7  0.0007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.188355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3170  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 216 aa  44.7  0.0008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2089  transcriptional regulator, TetR family  32.71 
 
 		 220 aa  44.3  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0021127  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2444  TetR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 217 aa  43.9  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  21.37 
 
 		 310 aa  44.3  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0684  TetR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 213 aa  44.3  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.974708 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1397  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 224 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.515474  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2300  TetR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 208 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2108  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 207 aa  44.3  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2775  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 228 aa  44.3  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0212844  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1415  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 224 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2347  TetR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 208 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0682211  normal  0.43856 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1451  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 224 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5925  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 211 aa  43.9  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3166  transcriptional regulator, TetR family  34.18 
 
 		 234 aa  44.3  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.335744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0144  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 224 aa  44.7  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.522541  decreased coverage  0.0000264507 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3438  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 190 aa  44.3  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.547681  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1745  TetR family transcriptional regulator  24.73 
 
 		 195 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0399082  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4251  transcriptional regulator, TetR family  31.46 
 
 		 216 aa  43.1  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22701  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2332  TetR family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 202 aa  43.5  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5283  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 208 aa  43.1  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.261053 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2339  TetR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 208 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00249237 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05020  transcriptional regulator, TetR family  23.66 
 
 		 194 aa  43.1  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0414  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 215 aa  43.1  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.462572  normal  0.0664832 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3299  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 307 aa  43.1  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5280  TetR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 175 aa  43.5  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6268  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 182 aa  43.1  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.700387  normal  0.409486 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1936  transcriptional regulator, TetR family  30.91 
 
 		 193 aa  43.5  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>