123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_5713 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_5713  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 198 aa  394  1e-109  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1103  TetR family transcriptional regulator  74.71 
 
 		 185 aa  263  2e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.716955  normal  0.719209 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5473  TetR family transcriptional regulator  66.48 
 
 		 193 aa  244  8e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.906106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5182  TetR family transcriptional regulator  66.48 
 
 		 193 aa  243  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5094  TetR family transcriptional regulator  66.48 
 
 		 201 aa  243  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0170525  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10136  transcriptional regulator  58.1 
 
 		 201 aa  211  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.984674 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1674  TetR family transcriptional regulator  46.11 
 
 		 192 aa  159  3e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.344236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5079  TetR family transcriptional regulator  45.56 
 
 		 190 aa  150  8.999999999999999e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4507  TetR family transcriptional regulator  42.41 
 
 		 224 aa  150  2e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.916577  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4594  TetR family transcriptional regulator  42.41 
 
 		 224 aa  150  2e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.60513  normal  0.70435 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4890  TetR family transcriptional regulator  42.41 
 
 		 206 aa  149  2e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.218482 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3363  regulatory protein TetR  43.72 
 
 		 213 aa  148  5e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.268151  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2639  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 196 aa  146  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.302097  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0353  transcriptional regulator, TetR family  39.89 
 
 		 228 aa  140  9.999999999999999e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0616658  normal  0.0838621 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2355  transcriptional regulator, TetR family  33.74 
 
 		 204 aa  103  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.284642  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1840  transcriptional regulator, TetR family  38.06 
 
 		 213 aa  99.8  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0700993  normal  0.104485 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2521  TetR family transcriptional regulator  35.95 
 
 		 200 aa  95.5  5e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4572  transcriptional regulator, TetR family  35.93 
 
 		 200 aa  89  4e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.209013  normal  0.793533 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1914  TetR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 212 aa  87.8  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.183306 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3152  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 248 aa  81.3  0.000000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.262017  normal  0.121031 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4885  putative transcriptional regulator, TetR family  28.74 
 
 		 202 aa  68.2  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0329972  normal  0.0964504 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4838  transcriptional regulator, TetR family  30.23 
 
 		 217 aa  67  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5197  transcriptional regulator, TetR family  31.91 
 
 		 211 aa  62.8  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128867  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3167  transcriptional regulator, TetR family  55.32 
 
 		 213 aa  61.2  0.000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0320  transcriptional regulator, TetR family  27.91 
 
 		 206 aa  58.5  0.00000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1381  transcriptional regulator, TetR family  21.38 
 
 		 184 aa  56.2  0.0000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.419771  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1169  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 202 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0872  transcriptional regulator, TetR family  25.93 
 
 		 211 aa  52.8  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.678947 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1969  TetR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 205 aa  52  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0320964 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5790  transcriptional regulator, TetR family  30.08 
 
 		 220 aa  51.6  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0399068 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1944  transcriptional regulator, TetR family  25.16 
 
 		 205 aa  51.6  0.000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00538978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5977  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 271 aa  51.6  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.414781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2291  transcriptional regulator, TetR family  29.17 
 
 		 205 aa  51.2  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.857741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0406  transcriptional regulator, TetR family  46.94 
 
 		 206 aa  50.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0181245  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3016  transcriptional regulator, TetR family  25.17 
 
 		 209 aa  50.1  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150997  normal  0.125451 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4247  TetR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 212 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4333  TetR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 212 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.771402  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4626  TetR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 212 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6912  TetR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 236 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.830717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1264  TetR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 206 aa  50.1  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.599329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3153  transcriptional regulator, TetR family  43.48 
 
 		 243 aa  50.1  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.12439 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  28.12 
 
 		 230 aa  49.3  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0984  transcriptional regulator, TetR family  24.84 
 
 		 245 aa  48.9  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.50937  hitchhiker  0.00233885 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11037  TetR family transcriptional regulator  26.75 
 
 		 197 aa  48.1  0.00008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.102388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0705  regulatory protein, TetR  42.86 
 
 		 211 aa  48.1  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5172  TetR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 201 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.369972  normal  0.335335 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0955  TetR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 212 aa  47  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2294  TetR family regulatory protein  30.21 
 
 		 206 aa  47  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0097  TetR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 207 aa  46.6  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2102  TetR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 206 aa  47  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.526616  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2161  TetR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 206 aa  47  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.720901  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 224 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1397  TetR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 224 aa  45.1  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.515474  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1415  TetR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 224 aa  45.1  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1451  TetR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 224 aa  45.1  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13232  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 228 aa  45.4  0.0006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.414971 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3512  regulatory protein TetR  28.24 
 
 		 237 aa  45.1  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4220  TetR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 239 aa  45.1  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1947  TetR family transcriptional regulator  25.17 
 
 		 197 aa  45.1  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30200  transcriptional regulator, TetR family  23.26 
 
 		 231 aa  45.1  0.0007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.296423  normal  0.124528 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  28.42 
 
 		 222 aa  45.1  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4588  transcriptional regulator, TetR family  25.26 
 
 		 206 aa  45.1  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112472 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0662  TetR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 205 aa  44.3  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1216  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 204 aa  44.7  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4182  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 201 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.368627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2710  transcriptional regulator, TetR family  24.39 
 
 		 218 aa  44.3  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.448517  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2739  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 225 aa  44.3  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000589766  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1045  transcriptional regulator, TetR family  39.34 
 
 		 222 aa  44.3  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4251  transcriptional regulator, TetR family  28.74 
 
 		 216 aa  44.3  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22701  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3095  transcriptional regulator, TetR family  36.21 
 
 		 192 aa  44.3  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000942813  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1984  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 196 aa  43.5  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5045  TetR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 206 aa  43.5  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.906168  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6341  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 206 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0497044  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4691  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 205 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.771858  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1738  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 206 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5815  TetR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 206 aa  43.5  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2846  regulatory protein, TetR  30.12 
 
 		 227 aa  43.9  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4777  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 205 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.681727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5076  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 215 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.175697 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1751  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 206 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6268  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 182 aa  43.9  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.700387  normal  0.409486 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4533  transcriptional regulator, TetR family  28.26 
 
 		 197 aa  43.5  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0585795  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2816  hypothetical protein  27.89 
 
 		 222 aa  43.1  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0366008  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3755  TetR family transcriptional regulator  42 
 
 		 239 aa  43.1  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3828  TetR family transcriptional regulator  42 
 
 		 239 aa  43.1  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2603  TetR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 208 aa  43.1  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3767  TetR family transcriptional regulator  42 
 
 		 239 aa  43.1  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5812  TetR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 188 aa  43.1  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0159111 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3907  regulatory protein TetR  40 
 
 		 212 aa  43.1  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3524  TetR family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 187 aa  43.1  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1137  transcriptional regulator, TetR family  37.7 
 
 		 209 aa  43.1  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.13929  normal  0.961099 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7816  transcriptional regulator, TetR family  23.91 
 
 		 216 aa  42.7  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0855  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 196 aa  42.7  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.179371  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3760  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 192 aa  42.7  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.348424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4778  TetR family transcriptional regulator  24.5 
 
 		 217 aa  42.7  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2432  TetR family transcriptional regulator  42 
 
 		 239 aa  42.4  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.625789 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4064  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 203 aa  42.7  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0805  TetR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 204 aa  42.4  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1372  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 212 aa  42.4  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00027491 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4364  TetR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 206 aa  42.7  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>