213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_4594 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_4507  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 224 aa  454  1e-127  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.916577  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4594  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 224 aa  454  1e-127  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.60513  normal  0.70435 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4890  TetR family transcriptional regulator  99.51 
 
 		 206 aa  417  1e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.218482 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1674  TetR family transcriptional regulator  77.42 
 
 		 192 aa  294  8e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.344236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5079  TetR family transcriptional regulator  77.42 
 
 		 190 aa  292  2e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2639  transcriptional regulator, TetR family  55.14 
 
 		 196 aa  191  6e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.302097  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10136  transcriptional regulator  50.53 
 
 		 201 aa  183  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.984674 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5094  TetR family transcriptional regulator  47.89 
 
 		 201 aa  167  1e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0170525  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5182  TetR family transcriptional regulator  47.89 
 
 		 193 aa  167  1e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5473  TetR family transcriptional regulator  47.89 
 
 		 193 aa  167  1e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.906106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1103  TetR family transcriptional regulator  49.17 
 
 		 185 aa  157  1e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.716955  normal  0.719209 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3363  regulatory protein TetR  42.5 
 
 		 213 aa  155  7e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.268151  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5713  TetR family transcriptional regulator  43.02 
 
 		 198 aa  144  1e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0353  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 228 aa  120  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0616658  normal  0.0838621 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1840  transcriptional regulator, TetR family  32.98 
 
 		 213 aa  102  5e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0700993  normal  0.104485 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2355  transcriptional regulator, TetR family  32.26 
 
 		 204 aa  93.6  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.284642  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2521  TetR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 200 aa  90.1  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4572  transcriptional regulator, TetR family  32.79 
 
 		 200 aa  88.2  8e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.209013  normal  0.793533 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3152  transcriptional regulator, TetR family  38.64 
 
 		 248 aa  80.5  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.262017  normal  0.121031 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1914  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 212 aa  79  0.00000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.183306 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3167  transcriptional regulator, TetR family  30.65 
 
 		 213 aa  77  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4838  transcriptional regulator, TetR family  42.99 
 
 		 217 aa  72  0.000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4885  putative transcriptional regulator, TetR family  27.22 
 
 		 202 aa  61.2  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0329972  normal  0.0964504 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5197  transcriptional regulator, TetR family  35.42 
 
 		 211 aa  59.7  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128867  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3153  transcriptional regulator, TetR family  43.94 
 
 		 243 aa  57.8  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.12439 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5172  TetR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.369972  normal  0.335335 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1169  TetR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 202 aa  55.8  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2739  transcriptional regulator, TetR family  38.75 
 
 		 225 aa  55.5  0.0000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000589766  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1941  hypothetical protein  35.87 
 
 		 200 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000561308 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11567  transcriptional regulator  32.12 
 
 		 225 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3755  TetR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 239 aa  51.6  0.000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3828  TetR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 239 aa  51.6  0.000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3767  TetR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 239 aa  51.6  0.000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0320  transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 		 206 aa  51.2  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5977  transcriptional regulator, TetR family  44.9 
 
 		 271 aa  51.2  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.414781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4220  TetR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 239 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3117  TetR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 248 aa  50.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3995  transcriptional regulator, TetR family  40.91 
 
 		 197 aa  50.4  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.200757  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2432  TetR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 239 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.625789 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0515  transcriptional regulator, TetR family  35.8 
 
 		 211 aa  49.7  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2816  hypothetical protein  43.75 
 
 		 222 aa  49.3  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0366008  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3166  transcriptional regulator, TetR family  35.8 
 
 		 234 aa  49.3  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.335744  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0908  TetR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 200 aa  49.3  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.376971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0303  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 228 aa  48.9  0.00006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.402109  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4802  TetR family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 199 aa  48.9  0.00006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.386552  normal  0.120275 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0184  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 335 aa  48.9  0.00006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000505732  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1034  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 204 aa  48.5  0.00008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3223  TetR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 228 aa  48.5  0.00008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3285  TetR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 228 aa  48.5  0.00008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.678887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3234  TetR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 228 aa  48.5  0.00008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.20483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5925  transcriptional regulator, TetR family  27.33 
 
 		 211 aa  47.8  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0406  transcriptional regulator, TetR family  45.1 
 
 		 206 aa  47.8  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0181245  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0313  TetR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 202 aa  48.1  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.121906  hitchhiker  0.00929139 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5987  transcriptional regulator, TetR family  44.9 
 
 		 204 aa  47.8  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1381  transcriptional regulator, TetR family  24.71 
 
 		 184 aa  47.4  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.419771  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5790  transcriptional regulator, TetR family  41.82 
 
 		 220 aa  47  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0399068 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0705  regulatory protein, TetR  45.1 
 
 		 211 aa  47.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5319  TetR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 208 aa  47  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0228  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 205 aa  47  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.728602  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3024  TetR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 197 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.101312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3373  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 193 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.946701  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4588  transcriptional regulator, TetR family  28.1 
 
 		 206 aa  46.6  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112472 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3435  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 193 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0970833  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2917  TetR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 218 aa  46.6  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.761743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1794  TetR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 218 aa  46.6  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3384  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 193 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0675  transcriptional regulator, TetR family  36.67 
 
 		 271 aa  47  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.886772  normal  0.300779 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1104  AcrR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 243 aa  46.2  0.0004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3938  transcriptional regulator, TetR family  27.17 
 
 		 231 aa  45.8  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00284915  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1522  regulatory protein TetR  41.07 
 
 		 207 aa  45.8  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.855326  normal  0.485337 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3146  TetR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 203 aa  45.8  0.0005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.303801  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3432  TetR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 211 aa  45.8  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0339823  normal  0.853068 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1801  transcriptional regulator, TetR family  41.07 
 
 		 207 aa  45.8  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0882167  normal  0.119004 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2373  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 205 aa  45.8  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0167  transcriptional regulator, TetR family  37.29 
 
 		 200 aa  45.8  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30610  transcriptional regulator  35.29 
 
 		 201 aa  45.8  0.0006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1225  TetR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 208 aa  45.1  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.657492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1848  TetR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 210 aa  45.1  0.0008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1520  transcriptional regulator, TetR family  37.88 
 
 		 208 aa  45.1  0.0009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.431113 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1028  transcriptional regulator, TetR family  40.98 
 
 		 200 aa  45.1  0.0009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0479484  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0355  transcriptional regulator, TetR family  22.9 
 
 		 195 aa  44.7  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1116  TetR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 209 aa  44.7  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.863597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0097  TetR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 207 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0750  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 236 aa  44.7  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0322855 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0358  regulatory protein, TetR  27.27 
 
 		 240 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000667156 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4585  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 220 aa  44.7  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.448621  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  24.58 
 
 		 310 aa  44.7  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0414  TetR family transcriptional regulator  25.78 
 
 		 215 aa  45.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.462572  normal  0.0664832 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3637  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 228 aa  44.7  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2216  TetR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 203 aa  45.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0817319 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1142  transcriptional regulator, TetR family  35.62 
 
 		 236 aa  44.7  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.627372  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2565  transcriptional regulator, TetR family  28.44 
 
 		 248 aa  45.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000672076  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6146  transcriptional regulator, TetR family  37.14 
 
 		 195 aa  44.3  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1755  TetR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 209 aa  44.3  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1669  TetR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 225 aa  44.3  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0413702  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1016  TetR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 210 aa  43.5  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00988275  normal  0.688061 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0483  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 226 aa  43.5  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0464  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 211 aa  43.9  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.128175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1792  TetR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 216 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.651799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0116  transcriptional regulator, TetR family  34.48 
 
 		 218 aa  44.3  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>