More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_0097 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



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Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_0097  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 207 aa  410  1e-114  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0406  transcriptional regulator, TetR family  76.33 
 
 		 206 aa  309  2e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0181245  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0705  regulatory protein, TetR  74.26 
 
 		 211 aa  300  9e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2875  TetR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 219 aa  87.8  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3066  transcriptional regulator, TetR family  36.24 
 
 		 229 aa  80.9  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1963  TetR family transcriptional regulator  29.48 
 
 		 215 aa  76.3  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.538053  normal  0.517781 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2443  transcriptional regulator, TetR family  33.68 
 
 		 237 aa  75.9  0.0000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0506357 
 
 
-
 
NC_004310  BR1381  TetR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 213 aa  71.6  0.000000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.637245  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1812  TetR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 213 aa  70.9  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.436202  n/a   
 
 
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NC_011989  Avi_2780  transcriptional regulator TetR family  30.05 
 
 		 212 aa  71.2  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1495  TetR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 219 aa  70.9  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.12027  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2962  transcriptional regulator, TetR family  34.38 
 
 		 229 aa  70.9  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16280  putative transcriptional regulator  38.89 
 
 		 213 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.450776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1400  putative transcriptional regulator  38.89 
 
 		 213 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3347  regulatory protein, TetR  32.09 
 
 		 205 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.235212  normal  0.0210246 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 234 aa  69.3  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1019  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 200 aa  69.3  0.00000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1338  TetR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 213 aa  68.6  0.00000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00412049  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2750  transcriptional regulator, TetR family  27.6 
 
 		 216 aa  67.4  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.622504 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3994  TetR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 225 aa  68.2  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75286  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3576  TetR-like virulence regulator  29.73 
 
 		 207 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011369  Rleg2_2493  transcriptional regulator, TetR family  27.6 
 
 		 221 aa  66.6  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.464185 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2798  TetR family transcriptional regulator  35.26 
 
 		 251 aa  66.2  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.358212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1142  TetR family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 210 aa  64.3  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.282615  normal  0.594609 
 
 
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NC_013595  Sros_8267  putative transcriptional regulator, TetR family  28.88 
 
 		 209 aa  64.3  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.124724 
 
 
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NC_003296  RS01892  transcription regulator protein  29.26 
 
 		 207 aa  63.5  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00576188  normal  0.449964 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5326  TetR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 218 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.256565  normal  1 
 
 
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NC_012850  Rleg_2636  transcriptional regulator, TetR family  30.95 
 
 		 222 aa  63.5  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00902  transcription regulator protein  34.17 
 
 		 209 aa  63.2  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.806346  normal  0.603909 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2177  transcriptional regulator, TetR family  36.55 
 
 		 210 aa  63.2  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.480454  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2113  transcriptional regulator, TetR family  33.05 
 
 		 207 aa  63.2  0.000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.918403  n/a   
 
 
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NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  33.03 
 
 		 218 aa  62.4  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
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NC_009714  CHAB381_0566  transcription regulator protein  29.41 
 
 		 207 aa  62  0.000000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.000000411686  n/a   
 
 
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NC_008228  Patl_0743  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 216 aa  62  0.000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0548  transcriptional regulator, TetR family  29.19 
 
 		 208 aa  61.6  0.000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1447  TetR family transcriptional regulator  29.24 
 
 		 214 aa  60.5  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.268108  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1443  transcriptional regulator, TetR family  33.9 
 
 		 204 aa  60.5  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.79888  n/a   
 
 
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NC_008599  CFF8240_0120  transcription regulator protein  22.84 
 
 		 209 aa  60.5  0.00000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2740  TetR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 257 aa  59.7  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.933804 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0328  transcriptional regulator, TetR family  25.75 
 
 		 215 aa  59.7  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.478904  normal  0.0897822 
 
 
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NC_011666  Msil_1456  transcriptional regulator, TetR family  29.03 
 
 		 211 aa  59.7  0.00000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0552  transcriptional regulator, TetR family  29.9 
 
 		 208 aa  59.7  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0093  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 229 aa  60.1  0.00000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.247373  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3352  TetR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 211 aa  59.3  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal  1 
 
 
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NC_010172  Mext_0284  regulatory protein TetR  25.75 
 
 		 215 aa  59.3  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007494  RSP_3317  TetR family transcriptional regulator  35.12 
 
 		 214 aa  58.9  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.305506  n/a   
 
 
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NC_010511  M446_6397  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 218 aa  59.3  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.467706 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1544  TetR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 219 aa  59.3  0.00000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4044  TetR family transcriptional regulator  35.12 
 
 		 214 aa  58.9  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0360  transcriptional regulator, TetR family  26.19 
 
 		 215 aa  58.9  0.00000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1313  TetR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 203 aa  58.9  0.00000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5253  transcriptional regulator, TetR family  33.93 
 
 		 215 aa  58.2  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3113  TetR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 214 aa  58.2  0.00000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.527228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5306  TetR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 219 aa  57.8  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.190126 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0299  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 202 aa  57.8  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2341  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 206 aa  57.8  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.554096 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1461  putative transcriptional regulator  26.67 
 
 		 212 aa  57  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0519  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 220 aa  56.6  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3443  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.61751 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3185  TetR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 208 aa  57  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5949  transcriptional regulator TetR family  32.26 
 
 		 250 aa  56.2  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4190  transcriptional regulator, TetR family  25.93 
 
 		 200 aa  56.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.378174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0533  TetR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 208 aa  56.2  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0518509 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4150  transcriptional regulator, TetR family  25.93 
 
 		 200 aa  56.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0450  TetR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2029  TetR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 220 aa  56.6  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0056  transcriptional regulator, TetR family  36.19 
 
 		 198 aa  55.8  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1511  TetR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 225 aa  55.8  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3299  transcriptional regulator, TetR family  42.62 
 
 		 307 aa  55.8  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3953  TetR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 232 aa  55.8  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0396138  normal  0.024229 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2436  TetR family transcriptional regulator  49.06 
 
 		 243 aa  55.8  0.0000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.747053 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3111  TetR family transcriptional regulator  25.99 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6801  transcriptional regulator, TetR family  28.49 
 
 		 217 aa  55.5  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.142519  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1550  transcriptional regulator, TetR family  43.06 
 
 		 201 aa  55.5  0.0000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1709  TetR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 224 aa  55.1  0.0000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.400859  normal  0.0301663 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1807  TetR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 218 aa  55.1  0.0000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.237257  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4585  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 220 aa  55.1  0.0000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.448621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0257  TetR family transcriptional regulator  30.24 
 
 		 201 aa  55.1  0.0000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.837987 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1838  transcriptional regulator, TetR family  27.49 
 
 		 221 aa  54.7  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.834516  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00486  transcriptional regulator, TetR family protein  24.04 
 
 		 224 aa  54.7  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013160  Cyan8802_4516  transcriptional regulator, TetR family  29.32 
 
 		 207 aa  54.3  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_011721  PCC8801_4487  transcriptional regulator, TetR family  29.32 
 
 		 207 aa  54.3  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_008043  TM1040_3451  TetR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 216 aa  54.7  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.6413 
 
 
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NC_014210  Ndas_4478  transcriptional regulator, TetR family  28.28 
 
 		 211 aa  54.3  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010511  M446_6562  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 210 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.67895  normal  0.0476005 
 
 
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NC_008825  Mpe_A1045  TetR family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 226 aa  54.7  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.446098  normal  1 
 
 
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NC_010172  Mext_4103  regulatory protein TetR  30.63 
 
 		 220 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.557347 
 
 
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NC_009972  Haur_2434  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 188 aa  53.1  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011004  Rpal_2169  transcriptional regulator, TetR family  27.32 
 
 		 207 aa  53.9  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.821962  n/a   
 
 
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NC_007802  Jann_0509  TetR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 191 aa  53.5  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013739  Cwoe_1493  transcriptional regulator, TetR family  49.3 
 
 		 198 aa  53.9  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.127102 
 
 
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NC_007958  RPD_2036  regulatory protein, TetR  29.66 
 
 		 206 aa  53.9  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.284785 
 
 
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NC_008321  Shewmr4_1247  TetR family transcriptional regulator  24.14 
 
 		 206 aa  53.5  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008463  PA14_16790  TetR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 212 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297454  normal  1 
 
 
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NC_008752  Aave_2815  TetR family transcriptional regulator  24.88 
 
 		 242 aa  53.5  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.106176  normal  0.623336 
 
 
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NC_011757  Mchl_4471  transcriptional regulator, TetR family  31.53 
 
 		 220 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007778  RPB_2237  TetR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 228 aa  53.1  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008322  Shewmr7_1317  TetR family transcriptional regulator  24.68 
 
 		 206 aa  53.1  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.237455  normal  1 
 
 
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NC_011989  Avi_3517  transcriptional regulator protein  35.25 
 
 		 208 aa  53.1  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.873146  n/a   
 
 
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NC_009674  Bcer98_3198  TetR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 215 aa  52.8  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00193732  n/a   
 
 
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