109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_2432 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



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Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_2432  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 
239 aa  484  1e-136  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.625789 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4220  TetR family transcriptional regulator  93.28 
 
 
239 aa  450  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3755  TetR family transcriptional regulator  85.65 
 
 
239 aa  414  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3828  TetR family transcriptional regulator  85.65 
 
 
239 aa  414  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3767  TetR family transcriptional regulator  85.65 
 
 
239 aa  414  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2739  transcriptional regulator, TetR family  69.95 
 
 
225 aa  315  3e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000589766  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4300  TetR family transcriptional regulator  67.44 
 
 
236 aa  296  1e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.459951  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3278  TetR family transcriptional regulator  45.54 
 
 
219 aa  186  3e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2339  TetR family transcriptional regulator  36.08 
 
 
208 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00249237 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2300  TetR family transcriptional regulator  35.05 
 
 
208 aa  98.6  7e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2347  TetR family transcriptional regulator  35.05 
 
 
208 aa  98.6  7e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0682211  normal  0.43856 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2603  TetR family transcriptional regulator  37.13 
 
 
208 aa  96.7  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3791  TetR family transcriptional regulator  37.31 
 
 
213 aa  95.9  5e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.353737  normal  0.906979 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5230  TetR family transcriptional regulator  27.67 
 
 
228 aa  71.6  0.000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1984  TetR family transcriptional regulator  26.47 
 
 
196 aa  58.5  0.00000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0828  transcriptional regulator, TetR family  24.87 
 
 
195 aa  56.2  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2521  TetR family transcriptional regulator  30.91 
 
 
200 aa  55.1  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0451  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
224 aa  53.5  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00762729  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4652  TetR family transcriptional regulator  23.47 
 
 
195 aa  52  0.000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4251  transcriptional regulator, TetR family  32.04 
 
 
216 aa  51.6  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22701  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0626  TetR family transcriptional regulator  26.23 
 
 
244 aa  51.6  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.852372 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2226  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 
210 aa  51.2  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4507  TetR family transcriptional regulator  41.54 
 
 
224 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.916577  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4594  TetR family transcriptional regulator  41.54 
 
 
224 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.60513  normal  0.70435 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3225  TetR family transcriptional regulator  21.93 
 
 
195 aa  50.4  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1116  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 
209 aa  50.4  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.863597  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4890  TetR family transcriptional regulator  42.19 
 
 
206 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.218482 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1674  TetR family transcriptional regulator  43.55 
 
 
192 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.344236  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4421  TetR family transcriptional regulator  23.2 
 
 
195 aa  49.7  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4260  transcriptional regulator  23.2 
 
 
195 aa  49.7  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4272  transcriptional regulator  23.2 
 
 
195 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4762  TetR family transcriptional regulator  23.2 
 
 
195 aa  49.7  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4653  transcriptional regulator, TetR family  23.2 
 
 
195 aa  50.1  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4633  transcriptional regulator, TetR family  23.2 
 
 
195 aa  50.1  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.169287  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4637  transcriptional regulator, TetR family  23.2 
 
 
195 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5079  TetR family transcriptional regulator  41.54 
 
 
190 aa  49.3  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0602  transcriptional regulator, TetR family  23.2 
 
 
195 aa  49.3  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2628  transcriptional regulator, TetR family  21.69 
 
 
194 aa  49.3  0.00005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5804  TetR family transcriptional regulator  27.91 
 
 
254 aa  48.9  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000000100556  hitchhiker  0.000892453 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6345  transcriptional regulator, TetR family  23.12 
 
 
241 aa  48.9  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1045  transcriptional regulator, TetR family  29.31 
 
 
203 aa  48.1  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00830488  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3256  transcriptional regulator, TetR family  35.56 
 
 
220 aa  48.1  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.757999  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1473  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 
207 aa  48.1  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.245471  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4353  TetR family transcriptional regulator  22.68 
 
 
195 aa  47  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0500  transcriptional regulator, TetR family  23.6 
 
 
241 aa  47.4  0.0002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2990  TetR family transcriptional regulator  26.55 
 
 
288 aa  46.6  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.989251  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  23.6 
 
 
212 aa  47  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1397  TetR family transcriptional regulator  25.13 
 
 
224 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.515474  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1415  TetR family transcriptional regulator  25.13 
 
 
224 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1451  TetR family transcriptional regulator  25.13 
 
 
224 aa  46.6  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3910  TetR family transcriptional regulator  37.08 
 
 
242 aa  46.2  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.104674 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1914  TetR family transcriptional regulator  26 
 
 
212 aa  46.6  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.183306 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2558  TetR family transcriptional regulator  23.84 
 
 
190 aa  46.2  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3995  transcriptional regulator, TetR family  38.96 
 
 
197 aa  45.8  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.200757  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0403  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 
204 aa  45.4  0.0008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.101074  normal  0.152412 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3540  TetR family transcriptional regulator  29.79 
 
 
250 aa  45.4  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8486  putative transcriptional regulator, TetR family  36.17 
 
 
201 aa  45.4  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.251281  normal  0.72211 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0794  TetR family transcriptional regulator  21.51 
 
 
192 aa  44.7  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0156861  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0743  TetR family transcriptional regulator  21.51 
 
 
192 aa  45.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.019038  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3466  TetR family transcriptional regulator  25.79 
 
 
200 aa  44.7  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0834  TetR family transcriptional regulator  21.51 
 
 
191 aa  44.7  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00423826  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5245  transcriptional regulator, TetR family  27.85 
 
 
251 aa  44.7  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0929  transcriptional regulator, TetR family  21.51 
 
 
192 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.1215099999999997e-45 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5271  transcriptional regulator, TetR family  31.87 
 
 
223 aa  45.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1840  transcriptional regulator, TetR family  30.37 
 
 
213 aa  44.7  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0700993  normal  0.104485 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4863  transcriptional regulator, TetR family  34.83 
 
 
209 aa  45.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0987  regulatory protein TetR  29.67 
 
 
192 aa  45.1  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.383045  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2807  regulatory protein TetR  29.67 
 
 
202 aa  44.7  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00102447  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0730  TetR family transcriptional regulator  21.51 
 
 
192 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.110462  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2695  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 
204 aa  43.9  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.945572  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4734  TetR family transcriptional regulator  27.91 
 
 
242 aa  44.3  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4678  transcriptional regulator, TetR family  31.37 
 
 
205 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000014554  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3038  transcriptional regulator, TetR family  23.84 
 
 
209 aa  44.3  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.051717 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0559  transcriptional regulator, TetR family  31.37 
 
 
205 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000271654  hitchhiker  2.35635e-17 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22630  transcriptional regulator  38.98 
 
 
202 aa  43.9  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4466  TetR family transcriptional regulator  30.1 
 
 
205 aa  43.5  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00176628  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4301  TetR family transcriptional regulator  30.1 
 
 
205 aa  43.5  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000465082  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4312  TetR family transcriptional regulator  30.1 
 
 
205 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0243746  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4814  TetR family transcriptional regulator  30.1 
 
 
205 aa  43.5  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00735833  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  34.38 
 
 
218 aa  43.5  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1079  TetR family transcriptional regulator  27.5 
 
 
215 aa  43.5  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4694  transcriptional regulator, TetR family  30.1 
 
 
205 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000803209  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0889  transcriptional regulator, TetR family  20.97 
 
 
192 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.760524  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4685  transcriptional regulator, TetR family  30.1 
 
 
205 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.17076e-49 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0626  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 
215 aa  43.1  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5790  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 
220 aa  43.1  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0399068 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5281  TetR family transcriptional regulator  26.72 
 
 
257 aa  43.1  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2917  TetR family transcriptional regulator  26.71 
 
 
218 aa  43.1  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.761743  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03730  transcriptional regulator, TetR family  25.57 
 
 
215 aa  43.1  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2355  transcriptional regulator, TetR family  28.28 
 
 
204 aa  42.7  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.284642  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3833  transcriptional regulator, TetR family  32.91 
 
 
212 aa  42.7  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0433  TetR family transcriptional regulator  21.26 
 
 
204 aa  42.7  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.376909  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3533  TetR family transcriptional regulator  25.51 
 
 
237 aa  42.7  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0909277  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0832  transcriptional regulator, TetR family  21.26 
 
 
196 aa  42.7  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
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NC_014165  Tbis_3071  TetR family transcriptional regulator  36.14 
 
 
210 aa  42.4  0.006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_008726  Mvan_1244  TetR family transcriptional regulator  29.25 
 
 
206 aa  42.4  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.218846 
 
 
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NC_013739  Cwoe_0870  transcriptional regulator, TetR family  31.51 
 
 
186 aa  42.4  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.65823  normal  0.649746 
 
 
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NC_014165  Tbis_1516  TetR family transcriptional regulator  38.78 
 
 
218 aa  42  0.008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.875223  normal 
 
 
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NC_008705  Mkms_3260  TetR family transcriptional regulator  25.4 
 
 
245 aa  42  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_008726  Mvan_5713  TetR family transcriptional regulator  42 
 
 
198 aa  42  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
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