More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2807 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_2807  regulatory protein TetR  100 
 
 		 202 aa  391  1e-108  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00102447  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4608  TetR family transcriptional regulator  42.08 
 
 		 206 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.198377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2097  TetR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 186 aa  137  1e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.191848  normal  0.237667 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4631  TetR family transcriptional regulator  36.6 
 
 		 230 aa  70.5  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4117  TetR family transcriptional regulator  38.74 
 
 		 210 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4838  transcriptional regulator, TetR family  34.53 
 
 		 217 aa  62  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3240  putative transcriptional regulator, TetR family  31.18 
 
 		 201 aa  61.6  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00194759  normal  0.442697 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3493  TetR family transcriptional regulator  31 
 
 		 211 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.729173  normal  0.75311 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0743  TetR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 216 aa  58.2  0.00000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5977  transcriptional regulator, TetR family  40.85 
 
 		 271 aa  57.8  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.414781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1780  transcriptional regulator, TetR family  30.36 
 
 		 200 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1244  TetR family transcriptional regulator  32.49 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218846 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5473  TetR family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 201 aa  55.5  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.968436  normal  0.0284284 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2367  TetR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 202 aa  55.1  0.0000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.445055  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5197  transcriptional regulator, TetR family  28.27 
 
 		 211 aa  54.7  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3963  TetR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 193 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1156  transcriptional regulator, TetR family  31.21 
 
 		 227 aa  54.3  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4037  TetR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 193 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1666  transcriptional regulator, TetR family  32.22 
 
 		 209 aa  54.7  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.40268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3977  TetR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 193 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.698976  normal  0.0354344 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0477  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 211 aa  54.3  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178939  normal  0.0289146 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3581  TetR family transcriptional regulator  24.64 
 
 		 209 aa  52.8  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2508  TetR family transcriptional regulator  29.88 
 
 		 195 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0332011  normal  0.924216 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0908  TetR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 200 aa  52.4  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.376971  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 310 aa  52  0.000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1844  TetR family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 242 aa  51.6  0.000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000808903 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2669  transcriptional regulator, TetR family  30.92 
 
 		 226 aa  51.6  0.000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00411812  normal  0.199475 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3299  transcriptional regulator, TetR family  38.71 
 
 		 307 aa  51.6  0.000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3195  transcriptional regulator, TetR family  27.46 
 
 		 200 aa  50.8  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0707  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 219 aa  50.8  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0873  TetR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 196 aa  51.2  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.682179 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3960  TetR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 201 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110455  normal  0.471806 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 212 aa  50.4  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1173  TetR family transcriptional regulator  24.18 
 
 		 189 aa  50.1  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2248  TetR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 222 aa  50.4  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0660336  normal  0.0152181 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10308  TetR/AcrR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 210 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000336223  normal  0.125099 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6231  transcriptional regulator, TetR family  35.04 
 
 		 197 aa  50.4  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6345  transcriptional regulator, TetR family  29.65 
 
 		 241 aa  50.4  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3791  TetR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 213 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.353737  normal  0.906979 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1541  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 179 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.932149  normal  0.0804871 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6228  transcriptional regulator, TetR family  39.19 
 
 		 194 aa  49.7  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.301912  normal  0.923303 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2521  TetR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 200 aa  49.7  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0452  regulatory protein TetR  30.15 
 
 		 221 aa  49.7  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1509  TetR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 179 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0671702  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1978  TetR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 179 aa  48.9  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0203016  normal  0.0208763 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2732  TetR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 179 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.748169 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1100  TetR family transcriptional regulator  27.11 
 
 		 194 aa  49.3  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0669836  normal  0.61487 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5273  TetR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 241 aa  48.9  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0264263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4599  TetR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 220 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2036  regulatory protein, TetR  25.81 
 
 		 206 aa  49.3  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.284785 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4029  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 217 aa  49.3  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.697639  normal  0.116148 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2444  transcriptional regulator, TetR family  26.78 
 
 		 211 aa  49.3  0.00004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0505938 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3782  TetR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 179 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.59056  normal  0.419733 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1734  TetR family transcriptional regulator  29.26 
 
 		 210 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.657322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3259  transcriptional regulator, TetR family  34.26 
 
 		 219 aa  48.9  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.147915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5109  TetR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 201 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.313188  normal  0.176776 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5527  transcriptional regulator, TetR family  32.97 
 
 		 203 aa  48.9  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2339  TetR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 208 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00249237 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11281  transcriptional regulator  34.48 
 
 		 202 aa  48.5  0.00006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.786647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6487  transcriptional regulator, TetR family  29.61 
 
 		 195 aa  48.5  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6268  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 182 aa  48.9  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.700387  normal  0.409486 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2739  transcriptional regulator, TetR family  29.21 
 
 		 225 aa  48.5  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000589766  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16700  transcriptional regulator  29.56 
 
 		 211 aa  48.5  0.00007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4046  TetR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 212 aa  48.5  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0961065 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2970  putative transcriptional regulator  33.04 
 
 		 196 aa  48.5  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0889426  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00759  transcriptional regulator, TetR family protein  25.44 
 
 		 224 aa  48.1  0.00008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0353  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 191 aa  48.1  0.00008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000439096  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2350  transcriptional regulator, TetR family  29.06 
 
 		 230 aa  48.1  0.00009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000443807  hitchhiker  0.00368666 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  28.7 
 
 		 242 aa  48.1  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3833  transcriptional regulator, TetR family  29.07 
 
 		 204 aa  48.1  0.00009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4440  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 220 aa  48.1  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6435  TetR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 262 aa  47.4  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.253012  normal  0.0353997 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3227  transcriptional regulator, TetR family  38.14 
 
 		 204 aa  47.4  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3998  transcriptional regulator, TetR family  32.34 
 
 		 205 aa  47.8  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0825494  normal  0.0160725 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3457  TetR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 238 aa  47.4  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3134  TetR family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 220 aa  48.1  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.471149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2689  TetR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 230 aa  47.8  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35560  transcriptional regulator  29.38 
 
 		 200 aa  48.1  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4191  TetR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 236 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.513173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1483  TetR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 197 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1689  transcriptional regulator, TetR family  29.61 
 
 		 199 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.403978 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3704  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 202 aa  47  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2995  TetR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 205 aa  47  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0523811 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1890  transcriptional regulator, TetR family  38.57 
 
 		 253 aa  47.4  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00021201 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1843  transcriptional regulatory protein  31.79 
 
 		 201 aa  46.6  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.677238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1999  putative transcriptional regulator  39.06 
 
 		 180 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5376  putative transcriptional regulator, TetR family  32.35 
 
 		 207 aa  47  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0545475 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5559  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 		 289 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1747  TetR family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 221 aa  46.6  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23590  putative transcriptional regulator  39.06 
 
 		 180 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0142024 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2800  transcriptional regulator, TetR family  30.06 
 
 		 206 aa  46.6  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2546  TetR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 223 aa  47.4  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.275318  decreased coverage  0.00000294801 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5533  transcriptional regulator, TetR family  34.91 
 
 		 222 aa  47.4  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3533  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 237 aa  47  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0909277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1827  regulatory protein, TetR  37.35 
 
 		 196 aa  47.4  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2692  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 195 aa  47  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.728372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1493  transcriptional regulator, TetR family  31.31 
 
 		 198 aa  47  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.127102 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0913  TetR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 195 aa  47.4  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.269174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1950  TetR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 240 aa  47  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.663338  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1866  TetR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 201 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.115406 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>