211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_1890 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_1890  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 253 aa  518  1e-146  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00021201 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2143  TetR family transcriptional regulator  77.03 
 
 		 249 aa  328  4e-89  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.101921  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11710  transcriptional regulator, tetR family  46.31 
 
 		 237 aa  170  2e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.010685  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2936  transcriptional regulator, TetR family  45.93 
 
 		 266 aa  169  4e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.273782 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3569  transcriptional regulator, TetR family  48 
 
 		 226 aa  166  2.9999999999999998e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.467129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34880  transcriptional regulator, tetR family  44.78 
 
 		 218 aa  156  3e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2377  transcriptional regulator, TetR family  45.69 
 
 		 211 aa  149  6e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.081674 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23490  transcriptional regulator, tetR family  43.09 
 
 		 223 aa  133  3e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.411786  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3112  transcriptional regulator, TetR family  46.63 
 
 		 238 aa  130  2.0000000000000002e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.151742  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3020  transcriptional regulator, TetR family  33.68 
 
 		 213 aa  115  8.999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000370253  normal  0.25528 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4029  transcriptional regulator, TetR family  34.95 
 
 		 217 aa  105  8e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.697639  normal  0.116148 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0828  transcriptional regulator, TetR family  36.07 
 
 		 275 aa  95.5  8e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0305  transcriptional regulator, TetR family  32.66 
 
 		 215 aa  87.4  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.437849  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1434  transcriptional regulator, TetR family  36.2 
 
 		 225 aa  87.8  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.185065  normal  0.789444 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0805  TetR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 227 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0103  TetR family transcriptional regulator  31.32 
 
 		 234 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.257993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0640  TetR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 235 aa  82.4  0.000000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.346756  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0653  TetR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 235 aa  82.4  0.000000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.553642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0633  TetR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 235 aa  82.4  0.000000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0416702 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21260  transcriptional regulator, tetR family  39.67 
 
 		 251 aa  81.6  0.000000000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.646658  normal  0.296128 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06690  transcriptional regulator  30.11 
 
 		 256 aa  80.5  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1827  TetR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 246 aa  79  0.00000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1874  TetR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 246 aa  79  0.00000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0418563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1808  TetR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 246 aa  79  0.00000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.229482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0771  regulatory protein TetR  27.64 
 
 		 246 aa  79  0.00000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2056  TetR family transcriptional regulator  34.06 
 
 		 253 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.391496 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4290  TetR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 246 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.362272  normal  0.446856 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2486  transcriptional regulator, TetR family  34.04 
 
 		 200 aa  76.3  0.0000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00165208  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1383  putative transcriptional regulatory protein  33.7 
 
 		 212 aa  75.5  0.0000000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4626  transcriptional regulator, TetR family  30.86 
 
 		 211 aa  73.9  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.110176  hitchhiker  0.00755279 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10480  TetR family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 234 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13066  AsnC family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 246 aa  72.4  0.000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.117427 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3962  putative transcriptional regulator, TetR family  31.79 
 
 		 194 aa  70.9  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.545183  normal  0.218359 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1683  TetR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 197 aa  68.6  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.947535  normal  0.202583 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2508  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 195 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0332011  normal  0.924216 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2692  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 195 aa  65.5  0.0000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.728372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2788  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 201 aa  64.3  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0994  transcriptional regulator, TetR family  28.08 
 
 		 271 aa  64.3  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2970  putative transcriptional regulator  39.62 
 
 		 196 aa  62.8  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0889426  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4654  transcriptional regulator, TetR family  36.63 
 
 		 199 aa  60.8  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.416931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  26.92 
 
 		 205 aa  60.5  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13360  transcriptional regulator, TetR family  27.57 
 
 		 215 aa  59.3  0.00000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0417905  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2482  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 196 aa  58.9  0.00000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0931  transcriptional regulator, TetR family  27.35 
 
 		 215 aa  58.2  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.588864  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3960  TetR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 201 aa  57  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110455  normal  0.471806 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1866  TetR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 201 aa  57  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.115406 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35210  TetR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 196 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0235  transcriptional regulator, TetR family  29.63 
 
 		 199 aa  56.2  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0309861  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  26.88 
 
 		 222 aa  56.2  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3783  TetR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 197 aa  56.2  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.539516 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0787  regulatory protein, TetR  27.1 
 
 		 226 aa  55.5  0.0000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4602  TetR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 219 aa  55.5  0.0000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.904797 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 216 aa  54.7  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2993  TetR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 206 aa  53.9  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1173  TetR family transcriptional regulator  25.17 
 
 		 189 aa  54.3  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3578  TetR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 198 aa  54.7  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00935563  normal  0.0256006 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1736  transcriptional regulator TetR family  38 
 
 		 197 aa  53.9  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2845  TetR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 197 aa  53.5  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.735257  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1473  TetR family transcriptional regulator  25.99 
 
 		 195 aa  53.1  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0425  transcriptional regulator, TetR family  34.82 
 
 		 195 aa  53.1  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.752712  normal  0.122961 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0908  transcriptional regulator, TetR family  24.87 
 
 		 207 aa  52.8  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469028  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32320  transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 		 200 aa  53.1  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.247928 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0573  TetR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 232 aa  52.8  0.000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0810713  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0685  TetR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 232 aa  52.8  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2087  TetR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 232 aa  52.8  0.000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.390005  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1991  TetR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 232 aa  52.8  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1638  TetR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 232 aa  52.8  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0781  transcriptional regulator, TetR family  36 
 
 		 197 aa  52.8  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4165  TetR family transcriptional regulator  37 
 
 		 198 aa  52.8  0.000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.774051  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0773  TetR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 224 aa  52.4  0.000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0502  TetR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 224 aa  52.4  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2089  transcriptional regulator, TetR family  30.84 
 
 		 220 aa  51.6  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0021127  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1451  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 224 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5717  transcriptional regulator, TetR family  36 
 
 		 197 aa  52  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.985195 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1397  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 224 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.515474  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1415  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 224 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0870  transcriptional regulator, TetR family  31.78 
 
 		 186 aa  50.8  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.65823  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0731  TetR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 227 aa  51.2  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250469 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3157  TetR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 330 aa  50.1  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1050  transcriptional regulator, TetR family  27.04 
 
 		 225 aa  50.1  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.549541 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0452  TetR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 212 aa  50.1  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.681881  decreased coverage  0.00000297509 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1795  TetR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 224 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3314  TetR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 214 aa  49.7  0.00005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 224 aa  49.7  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1600  TetR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 213 aa  48.9  0.00007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1286  transcriptional regulator, TetR family  23.88 
 
 		 199 aa  48.9  0.00008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000123202 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0166  transcriptional regulator, TetR family  29.71 
 
 		 221 aa  48.9  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0611363  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3992  transcriptional regulator, TetR family  26.8 
 
 		 218 aa  48.5  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1944  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 205 aa  48.1  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00538978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0381  TetR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 212 aa  48.1  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0872  transcriptional regulator, TetR family  24.88 
 
 		 211 aa  48.5  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.678947 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0698  putative transcription regulator protein  40 
 
 		 264 aa  47.8  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00682473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0832  transcriptional regulator, TetR family  31.2 
 
 		 211 aa  47.4  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.933061 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2807  regulatory protein TetR  38.57 
 
 		 202 aa  47.4  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00102447  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2134  transcriptional regulator, TetR family  30.53 
 
 		 219 aa  47.4  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00399747  normal  0.0273951 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1216  TetR family transcriptional regulator  27 
 
 		 204 aa  47.8  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3520  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 198 aa  47.8  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.140443 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6189  TetR family transcriptional regulator  49.06 
 
 		 210 aa  47.4  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.304814  normal  0.805788 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5559  transcriptional regulator, TetR family  31.65 
 
 		 289 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2647  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 217 aa  47.4  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>