212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2143 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_2143  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 249 aa  508  1e-143  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.101921  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1890  transcriptional regulator, TetR family  71.37 
 
 		 253 aa  322  4e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00021201 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2936  transcriptional regulator, TetR family  44.65 
 
 		 266 aa  169  3e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.273782 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11710  transcriptional regulator, tetR family  45.79 
 
 		 237 aa  165  8e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.010685  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3569  transcriptional regulator, TetR family  43.48 
 
 		 226 aa  158  9e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.467129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34880  transcriptional regulator, tetR family  42.08 
 
 		 218 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2377  transcriptional regulator, TetR family  43.11 
 
 		 211 aa  146  4.0000000000000006e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.081674 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3112  transcriptional regulator, TetR family  45.89 
 
 		 238 aa  135  6.0000000000000005e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.151742  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23490  transcriptional regulator, tetR family  39.69 
 
 		 223 aa  125  6e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.411786  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3020  transcriptional regulator, TetR family  30.52 
 
 		 213 aa  110  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000370253  normal  0.25528 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4029  transcriptional regulator, TetR family  35.48 
 
 		 217 aa  107  1e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.697639  normal  0.116148 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0828  transcriptional regulator, TetR family  31.33 
 
 		 275 aa  91.3  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21260  transcriptional regulator, tetR family  30.96 
 
 		 251 aa  90.9  2e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.646658  normal  0.296128 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0103  TetR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 234 aa  85.9  6e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.257993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0305  transcriptional regulator, TetR family  34.29 
 
 		 215 aa  84.7  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.437849  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06690  transcriptional regulator  28.44 
 
 		 256 aa  83.2  0.000000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1434  transcriptional regulator, TetR family  32.54 
 
 		 225 aa  80.5  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.185065  normal  0.789444 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13066  AsnC family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 246 aa  80.1  0.00000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.117427 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0805  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 227 aa  79.7  0.00000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0640  TetR family transcriptional regulator  29.26 
 
 		 235 aa  77.8  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.346756  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0653  TetR family transcriptional regulator  29.26 
 
 		 235 aa  77.8  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.553642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0633  TetR family transcriptional regulator  29.26 
 
 		 235 aa  77.8  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0416702 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1827  TetR family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 246 aa  77  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1874  TetR family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 246 aa  77  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0418563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1808  TetR family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 246 aa  77  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.229482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4290  TetR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 246 aa  77  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.362272  normal  0.446856 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0771  regulatory protein TetR  33.61 
 
 		 246 aa  73.9  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2056  TetR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 253 aa  72.8  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.391496 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2486  transcriptional regulator, TetR family  32.47 
 
 		 200 aa  72.8  0.000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00165208  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4626  transcriptional regulator, TetR family  31.79 
 
 		 211 aa  72  0.000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.110176  hitchhiker  0.00755279 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10480  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 234 aa  72  0.000000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3962  putative transcriptional regulator, TetR family  32.22 
 
 		 194 aa  71.6  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.545183  normal  0.218359 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1383  putative transcriptional regulatory protein  30.56 
 
 		 212 aa  69.7  0.00000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2508  TetR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 195 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0332011  normal  0.924216 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4654  transcriptional regulator, TetR family  38.3 
 
 		 199 aa  63.5  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.416931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0994  transcriptional regulator, TetR family  31.03 
 
 		 271 aa  63.2  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1683  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 197 aa  63.2  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.947535  normal  0.202583 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2692  TetR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 195 aa  62  0.000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.728372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2788  transcriptional regulator, TetR family  30.07 
 
 		 201 aa  62  0.000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3783  TetR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 197 aa  59.7  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.539516 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0781  transcriptional regulator, TetR family  39.39 
 
 		 197 aa  58.5  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2482  transcriptional regulator, TetR family  29.37 
 
 		 196 aa  57.4  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2845  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 197 aa  57.8  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.735257  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3578  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 198 aa  55.8  0.0000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00935563  normal  0.0256006 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0787  regulatory protein, TetR  28.3 
 
 		 226 aa  55.5  0.0000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1736  transcriptional regulator TetR family  40.4 
 
 		 197 aa  55.5  0.0000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1173  TetR family transcriptional regulator  24.16 
 
 		 189 aa  54.7  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2970  putative transcriptional regulator  36.36 
 
 		 196 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0889426  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1050  transcriptional regulator, TetR family  31.12 
 
 		 225 aa  54.7  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.549541 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0235  transcriptional regulator, TetR family  32.32 
 
 		 199 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0309861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4165  TetR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 198 aa  53.5  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.774051  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3960  TetR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 201 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110455  normal  0.471806 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0166  transcriptional regulator, TetR family  31.65 
 
 		 221 aa  53.1  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0611363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5717  transcriptional regulator, TetR family  38.38 
 
 		 197 aa  52.8  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.985195 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1866  TetR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 201 aa  52.8  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.115406 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0731  TetR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 227 aa  52.4  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250469 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35210  TetR family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 196 aa  52  0.000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0420  TetR family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 215 aa  50.8  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0908  transcriptional regulator, TetR family  28.41 
 
 		 207 aa  50.8  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469028  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4602  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 219 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.904797 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0931  transcriptional regulator, TetR family  29.76 
 
 		 215 aa  50.1  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.588864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0293  transcriptional regulator, TetR family  25.52 
 
 		 230 aa  50.1  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5318  transcriptional regulator, TetR family  26.85 
 
 		 197 aa  49.7  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8998  putative transcriptional regulator, TetR family  26.2 
 
 		 229 aa  49.7  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.115445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0381  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 212 aa  49.3  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5083  regulatory protein TetR  28.07 
 
 		 184 aa  49.3  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.749425  normal  0.163121 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3836  transcriptional regulator, TetR family  29.7 
 
 		 211 aa  49.3  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0425  transcriptional regulator, TetR family  32.08 
 
 		 195 aa  49.3  0.00006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.752712  normal  0.122961 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0252  transcriptional regulator  30.97 
 
 		 224 aa  49.3  0.00006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  25.65 
 
 		 205 aa  48.9  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0870  transcriptional regulator, TetR family  35.62 
 
 		 186 aa  48.5  0.00009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.65823  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0330  transcriptional regulator, TetR family  31.78 
 
 		 233 aa  48.5  0.00009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2647  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 217 aa  48.5  0.00009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0882  transcriptional regulator, TetR family  30.36 
 
 		 233 aa  48.1  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1331  transcriptional regulator, TetR family  34.48 
 
 		 201 aa  48.1  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3520  TetR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 198 aa  48.5  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.140443 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6189  TetR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 210 aa  48.1  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.304814  normal  0.805788 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3060  TetR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 203 aa  47.8  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32400  transcriptional regulator, tetR family  39.71 
 
 		 216 aa  47.4  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3157  TetR family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 330 aa  47.8  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0452  TetR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 212 aa  47.8  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.681881  decreased coverage  0.00000297509 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 216 aa  47  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5374  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 469 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00219714 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0573  TetR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 232 aa  46.6  0.0004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0810713  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0685  TetR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 232 aa  46.6  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2087  TetR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 232 aa  46.6  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.390005  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1991  TetR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 232 aa  46.6  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1638  TetR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 232 aa  46.6  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0832  transcriptional regulator, TetR family  36.7 
 
 		 211 aa  46.2  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.933061 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 193 aa  46.2  0.0004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1538  TetR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 222 aa  46.6  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.891192  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0698  putative transcription regulator protein  37.5 
 
 		 264 aa  46.2  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00682473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0555  transcriptional regulator BetI  29.73 
 
 		 201 aa  46.2  0.0005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3992  transcriptional regulator, TetR family  30.17 
 
 		 218 aa  45.8  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2807  regulatory protein TetR  34.09 
 
 		 202 aa  45.8  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00102447  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0607  transcriptional regulator, TetR family  36.11 
 
 		 255 aa  45.8  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.118397  normal  0.590685 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4596  regulatory protein TetR  37.65 
 
 		 196 aa  45.4  0.0007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3349  TetR family transcriptional regulator  25.29 
 
 		 209 aa  45.8  0.0007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.545743 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2564  TetR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 214 aa  45.4  0.0008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.454515 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1747  TetR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 221 aa  45.4  0.0008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>