285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_2377 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_2377  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 211 aa  433  1e-121  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.081674 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34880  transcriptional regulator, tetR family  66.67 
 
 		 218 aa  273  2.0000000000000002e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2936  transcriptional regulator, TetR family  56.28 
 
 		 266 aa  214  5.9999999999999996e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.273782 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3112  transcriptional regulator, TetR family  53.85 
 
 		 238 aa  177  7e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.151742  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3569  transcriptional regulator, TetR family  46.48 
 
 		 226 aa  169  2e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.467129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2143  TetR family transcriptional regulator  43.78 
 
 		 249 aa  168  6e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.101921  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1890  transcriptional regulator, TetR family  45.18 
 
 		 253 aa  167  9e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00021201 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11710  transcriptional regulator, tetR family  44.17 
 
 		 237 aa  139  3.9999999999999997e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.010685  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23490  transcriptional regulator, tetR family  39.64 
 
 		 223 aa  110  1.0000000000000001e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.411786  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3020  transcriptional regulator, TetR family  33 
 
 		 213 aa  109  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000370253  normal  0.25528 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0305  transcriptional regulator, TetR family  36 
 
 		 215 aa  104  8e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.437849  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4029  transcriptional regulator, TetR family  33.5 
 
 		 217 aa  100  1e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.697639  normal  0.116148 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06690  transcriptional regulator  30.39 
 
 		 256 aa  98.6  6e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0828  transcriptional regulator, TetR family  32.02 
 
 		 275 aa  97.8  9e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21260  transcriptional regulator, tetR family  41.59 
 
 		 251 aa  89.7  3e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.646658  normal  0.296128 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0771  regulatory protein TetR  27.06 
 
 		 246 aa  85.9  4e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1827  TetR family transcriptional regulator  36.75 
 
 		 246 aa  78.6  0.00000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1874  TetR family transcriptional regulator  36.75 
 
 		 246 aa  78.6  0.00000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0418563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1808  TetR family transcriptional regulator  36.75 
 
 		 246 aa  78.6  0.00000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.229482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0103  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 234 aa  77.8  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.257993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0640  TetR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 235 aa  77  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.346756  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0653  TetR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 235 aa  77  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.553642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0805  TetR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 227 aa  77  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3962  putative transcriptional regulator, TetR family  32.92 
 
 		 194 aa  76.6  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.545183  normal  0.218359 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0633  TetR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 235 aa  77  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0416702 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1434  transcriptional regulator, TetR family  34.94 
 
 		 225 aa  75.9  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.185065  normal  0.789444 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4626  transcriptional regulator, TetR family  31.85 
 
 		 211 aa  74.7  0.0000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.110176  hitchhiker  0.00755279 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10480  TetR family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 234 aa  73.6  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4290  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 246 aa  72.4  0.000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.362272  normal  0.446856 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13066  AsnC family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 246 aa  72  0.000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.117427 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2056  TetR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 253 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.391496 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2486  transcriptional regulator, TetR family  33.14 
 
 		 200 aa  70.5  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00165208  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1383  putative transcriptional regulatory protein  32.18 
 
 		 212 aa  67.4  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1683  TetR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 197 aa  63.9  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.947535  normal  0.202583 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0908  transcriptional regulator, TetR family  27.23 
 
 		 207 aa  63.2  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469028  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13360  transcriptional regulator, TetR family  27.18 
 
 		 215 aa  62.4  0.000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0417905  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2692  TetR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 195 aa  62  0.000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.728372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32320  transcriptional regulator, TetR family  27.42 
 
 		 200 aa  62  0.000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.247928 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0166  transcriptional regulator, TetR family  29.19 
 
 		 221 aa  61.6  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0611363  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0872  transcriptional regulator, TetR family  26.51 
 
 		 211 aa  61.2  0.000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.678947 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0787  regulatory protein, TetR  28.22 
 
 		 226 aa  60.8  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0731  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 227 aa  60.5  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250469 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1050  transcriptional regulator, TetR family  27.57 
 
 		 225 aa  60.5  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.549541 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  27.03 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0994  transcriptional regulator, TetR family  30.36 
 
 		 271 aa  59.3  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 216 aa  58.9  0.00000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3157  TetR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 330 aa  57.8  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0931  transcriptional regulator, TetR family  27.51 
 
 		 215 aa  57.4  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.588864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1204  transcriptional regulator, TetR family  27.23 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.260768  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2134  transcriptional regulator, TetR family  24.21 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00399747  normal  0.0273951 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1216  TetR family transcriptional regulator  26.2 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3360  TetR family transcriptional regulator  25.84 
 
 		 209 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0120997  normal  0.690483 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3992  transcriptional regulator, TetR family  27.94 
 
 		 218 aa  55.5  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3512  regulatory protein TetR  25.85 
 
 		 237 aa  54.7  0.0000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5928  transcriptional regulator, TetR family  31.47 
 
 		 215 aa  53.9  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.511087  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06720  transcriptional regulator, TetR family  26.14 
 
 		 221 aa  53.9  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0882  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 233 aa  53.9  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4602  TetR family transcriptional regulator  25.26 
 
 		 219 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.904797 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4654  transcriptional regulator, TetR family  32.73 
 
 		 199 aa  53.1  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.416931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1286  transcriptional regulator, TetR family  24.86 
 
 		 199 aa  52.4  0.000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000123202 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11037  TetR family transcriptional regulator  26.49 
 
 		 197 aa  52  0.000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.102388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2845  TetR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 197 aa  51.6  0.000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.735257  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28930  transcriptional regulator  35.23 
 
 		 205 aa  51.6  0.000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.218384 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1397  TetR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 224 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.515474  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10241  TetR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 204 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000764085  normal  0.925652 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0984  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 245 aa  51.2  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.50937  hitchhiker  0.00233885 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1415  TetR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 224 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1795  TetR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 224 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1833  TetR family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 202 aa  50.8  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.150168  normal  0.286062 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1451  TetR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 224 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0452  TetR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 212 aa  50.4  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.681881  decreased coverage  0.00000297509 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3240  putative transcriptional regulator, TetR family  34.44 
 
 		 201 aa  50.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00194759  normal  0.442697 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1684  transcriptional regulator, TetR family  25.9 
 
 		 202 aa  50.1  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 190 aa  50.4  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 224 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2497  transcriptional regulator, TetR family  24.19 
 
 		 221 aa  49.7  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000693939 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2846  regulatory protein, TetR  33.94 
 
 		 227 aa  49.7  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5327  TetR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 219 aa  49.7  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10078  transcriptional regulator  34.23 
 
 		 201 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.105796 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3806  TetR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 238 aa  49.3  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65239  normal  0.316965 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0636  TetR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 250 aa  49.3  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0304513 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 190 aa  49.7  0.00004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4247  TetR family transcriptional regulator  24.32 
 
 		 212 aa  49.3  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15250  transcriptional regulator, tetR family  27.22 
 
 		 218 aa  49.3  0.00005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.110377  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4333  TetR family transcriptional regulator  24.32 
 
 		 212 aa  49.3  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.771402  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0876  TetR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 226 aa  49.3  0.00005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.140831 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4626  TetR family transcriptional regulator  24.32 
 
 		 212 aa  49.3  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  22.63 
 
 		 222 aa  48.9  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1238  AcrR family transcriptional regulator  26.2 
 
 		 273 aa  48.5  0.00007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13232  TetR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 228 aa  48.5  0.00008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.414971 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2993  TetR family transcriptional regulator  22.58 
 
 		 206 aa  48.5  0.00008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46570  putative transcriptional regulator  27.06 
 
 		 205 aa  48.5  0.00008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000161907  hitchhiker  0.00000116969 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1353  regulatory protein TetR  24.37 
 
 		 210 aa  48.1  0.00009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.273808  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3783  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 197 aa  48.1  0.00009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.539516 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4251  transcriptional regulator, TetR family  23.66 
 
 		 216 aa  47.8  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22701  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1290  AcrR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 199 aa  47.8  0.0001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6345  transcriptional regulator, TetR family  29.63 
 
 		 241 aa  47.8  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0919  TetR family transcriptional regulator  24.71 
 
 		 215 aa  47.8  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4128  TetR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 241 aa  47.8  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.860792 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0381  TetR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 212 aa  48.1  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>