197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_0805 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_0805  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 227 aa  468  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0103  TetR family transcriptional regulator  88.99 
 
 		 234 aa  429  1e-119  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.257993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0640  TetR family transcriptional regulator  89.87 
 
 		 235 aa  426  1e-118  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.346756  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0653  TetR family transcriptional regulator  89.87 
 
 		 235 aa  426  1e-118  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.553642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0633  TetR family transcriptional regulator  89.87 
 
 		 235 aa  426  1e-118  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0416702 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10480  TetR family transcriptional regulator  84.02 
 
 		 234 aa  392  1e-108  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0771  regulatory protein TetR  49.31 
 
 		 246 aa  217  1e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0828  transcriptional regulator, TetR family  38.05 
 
 		 275 aa  135  4e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3020  transcriptional regulator, TetR family  36.92 
 
 		 213 aa  120  3e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000370253  normal  0.25528 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06690  transcriptional regulator  32.84 
 
 		 256 aa  114  1.0000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0305  transcriptional regulator, TetR family  32.82 
 
 		 215 aa  107  1e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.437849  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4029  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 217 aa  101  1e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.697639  normal  0.116148 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3569  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 226 aa  95.1  9e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.467129  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11710  transcriptional regulator, tetR family  34.44 
 
 		 237 aa  92.8  3e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.010685  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2056  TetR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 253 aa  85.5  6e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.391496 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4290  TetR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 246 aa  85.5  6e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.362272  normal  0.446856 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23490  transcriptional regulator, tetR family  32.79 
 
 		 223 aa  84.7  0.000000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.411786  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1827  TetR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 246 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1874  TetR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 246 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0418563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1808  TetR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 246 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.229482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13066  AsnC family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 246 aa  81.6  0.000000000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.117427 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2143  TetR family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 249 aa  79.7  0.00000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.101921  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3112  transcriptional regulator, TetR family  39.02 
 
 		 238 aa  79.3  0.00000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.151742  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34880  transcriptional regulator, tetR family  30.73 
 
 		 218 aa  78.2  0.00000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1890  transcriptional regulator, TetR family  29.61 
 
 		 253 aa  77  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00021201 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1434  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 225 aa  73.9  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.185065  normal  0.789444 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4588  transcriptional regulator, TetR family  29.95 
 
 		 206 aa  73.9  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112472 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2936  transcriptional regulator, TetR family  30.13 
 
 		 266 aa  73.6  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.273782 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21260  transcriptional regulator, tetR family  28.22 
 
 		 251 aa  71.2  0.00000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.646658  normal  0.296128 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1473  TetR family transcriptional regulator  29.26 
 
 		 195 aa  68.6  0.00000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06720  transcriptional regulator, TetR family  28.37 
 
 		 221 aa  68.2  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4590  regulatory protein TetR  25.95 
 
 		 206 aa  66.2  0.0000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1683  TetR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 197 aa  65.9  0.0000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.947535  normal  0.202583 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2377  transcriptional regulator, TetR family  29.08 
 
 		 211 aa  65.5  0.0000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.081674 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4626  transcriptional regulator, TetR family  29.78 
 
 		 211 aa  65.1  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.110176  hitchhiker  0.00755279 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1204  transcriptional regulator, TetR family  29.11 
 
 		 206 aa  64.7  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.260768  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3962  putative transcriptional regulator, TetR family  32.39 
 
 		 194 aa  64.7  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.545183  normal  0.218359 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1944  transcriptional regulator, TetR family  28.93 
 
 		 205 aa  62.4  0.000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00538978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4602  TetR family transcriptional regulator  24.75 
 
 		 219 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.904797 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3360  TetR family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 209 aa  59.7  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0120997  normal  0.690483 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0919  TetR family transcriptional regulator  25.67 
 
 		 215 aa  58.2  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0381  TetR family transcriptional regulator  26 
 
 		 212 aa  57  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30200  transcriptional regulator, TetR family  25.38 
 
 		 231 aa  57  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.296423  normal  0.124528 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3512  regulatory protein TetR  25 
 
 		 237 aa  57  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0452  TetR family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.681881  decreased coverage  0.00000297509 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0518  TetR family transcriptional regulator  25.12 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290772  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0830  transcriptional regulator, TetR family  25.15 
 
 		 214 aa  56.6  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4456  regulatory protein TetR  25.65 
 
 		 202 aa  56.2  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0166479  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1795  TetR family transcriptional regulator  23.15 
 
 		 224 aa  55.8  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0955  TetR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 218 aa  55.8  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  23 
 
 		 224 aa  55.8  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0764  TetR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 203 aa  55.5  0.0000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0005262  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3806  TetR family transcriptional regulator  25.87 
 
 		 238 aa  55.1  0.0000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65239  normal  0.316965 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1451  TetR family transcriptional regulator  22.58 
 
 		 224 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13232  TetR family transcriptional regulator  23.16 
 
 		 228 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.414971 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1397  TetR family transcriptional regulator  22.04 
 
 		 224 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.515474  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1415  TetR family transcriptional regulator  22.04 
 
 		 224 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  24.4 
 
 		 222 aa  52.8  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0607  transcriptional regulator, TetR family  30.07 
 
 		 255 aa  52.4  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.118397  normal  0.590685 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2486  transcriptional regulator, TetR family  27.68 
 
 		 200 aa  52.8  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00165208  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0908  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 207 aa  52.4  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469028  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0994  transcriptional regulator, TetR family  26.9 
 
 		 271 aa  52  0.000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2134  transcriptional regulator, TetR family  24.32 
 
 		 219 aa  51.6  0.000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00399747  normal  0.0273951 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8610  putative transcriptional regulator, TetR family  28.64 
 
 		 317 aa  51.2  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5318  transcriptional regulator, TetR family  24.02 
 
 		 197 aa  50.8  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1383  putative transcriptional regulatory protein  26.26 
 
 		 212 aa  50.8  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0648  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 247 aa  50.8  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0672593 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2993  TetR family transcriptional regulator  22.82 
 
 		 206 aa  49.7  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1120  transcriptional regulator, TetR family  26.2 
 
 		 223 aa  49.3  0.00005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.917457  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3459  TetR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 324 aa  49.3  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4251  transcriptional regulator, TetR family  25.25 
 
 		 216 aa  49.3  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22701  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4778  TetR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 217 aa  49.3  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0872  transcriptional regulator, TetR family  22.66 
 
 		 211 aa  49.3  0.00005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.678947 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2508  TetR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 195 aa  48.9  0.00006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0332011  normal  0.924216 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1957  transcriptional regulator, TetR family  30.63 
 
 		 194 aa  48.5  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.292651 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 216 aa  48.5  0.00009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  24.21 
 
 		 205 aa  48.5  0.00009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1286  transcriptional regulator, TetR family  27.08 
 
 		 199 aa  48.1  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000123202 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3992  transcriptional regulator, TetR family  27.62 
 
 		 218 aa  48.1  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2708  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 266 aa  47.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2775  TetR family transcriptional regulator  24.08 
 
 		 228 aa  47.4  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0212844  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4171  TetR family transcriptional regulator  25.39 
 
 		 203 aa  47.4  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0201849  hitchhiker  0.000462956 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2497  transcriptional regulator, TetR family  28.24 
 
 		 221 aa  47  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000693939 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2970  putative transcriptional regulator  29.68 
 
 		 196 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0889426  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1238  AcrR family transcriptional regulator  25.51 
 
 		 273 aa  46.6  0.0003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4666  TetR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 214 aa  46.6  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.441468  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4455  transcriptional regulator, TetR family  37.84 
 
 		 215 aa  46.2  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0390638 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3212  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 213 aa  46.2  0.0004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.402928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1947  TetR family transcriptional regulator  25.4 
 
 		 197 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1045  transcriptional regulator, TetR family  24.31 
 
 		 203 aa  46.2  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00830488  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  25.5 
 
 		 256 aa  46.2  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3060  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 203 aa  46.2  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0420  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 215 aa  45.8  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1050  transcriptional regulator, TetR family  23.96 
 
 		 225 aa  46.2  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.549541 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0698  putative transcription regulator protein  32.08 
 
 		 264 aa  45.8  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00682473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0166  transcriptional regulator, TetR family  24.87 
 
 		 221 aa  45.8  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0611363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6095  regulatory protein, TetR  36.36 
 
 		 204 aa  45.4  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.584059  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0754  TetR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 273 aa  45.8  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4247  TetR family transcriptional regulator  25.79 
 
 		 212 aa  45.8  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4333  TetR family transcriptional regulator  25.79 
 
 		 212 aa  45.8  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.771402  normal  0.443044 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>