94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0771 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0771  regulatory protein TetR  100 
 
 		 246 aa  501  1e-141  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0653  TetR family transcriptional regulator  48.88 
 
 		 235 aa  220  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.553642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0640  TetR family transcriptional regulator  48.88 
 
 		 235 aa  220  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.346756  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0633  TetR family transcriptional regulator  48.88 
 
 		 235 aa  220  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0416702 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0805  TetR family transcriptional regulator  49.31 
 
 		 227 aa  217  2e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10480  TetR family transcriptional regulator  48.2 
 
 		 234 aa  213  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0103  TetR family transcriptional regulator  48.86 
 
 		 234 aa  213  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.257993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0828  transcriptional regulator, TetR family  37.98 
 
 		 275 aa  130  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06690  transcriptional regulator  33.96 
 
 		 256 aa  118  7e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11710  transcriptional regulator, tetR family  35.16 
 
 		 237 aa  105  9e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.010685  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0305  transcriptional regulator, TetR family  31.44 
 
 		 215 aa  104  1e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.437849  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34880  transcriptional regulator, tetR family  29.78 
 
 		 218 aa  97.8  1e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3020  transcriptional regulator, TetR family  28.35 
 
 		 213 aa  92.8  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000370253  normal  0.25528 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3569  transcriptional regulator, TetR family  30.3 
 
 		 226 aa  89.4  5e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.467129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4029  transcriptional regulator, TetR family  30.69 
 
 		 217 aa  89.4  5e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.697639  normal  0.116148 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23490  transcriptional regulator, tetR family  31.28 
 
 		 223 aa  83.6  0.000000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.411786  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2936  transcriptional regulator, TetR family  30.6 
 
 		 266 aa  80.5  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.273782 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1890  transcriptional regulator, TetR family  35.14 
 
 		 253 aa  76.6  0.0000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00021201 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2056  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 253 aa  76.6  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.391496 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1874  TetR family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 246 aa  75.9  0.0000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0418563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1808  TetR family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 246 aa  75.9  0.0000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.229482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1827  TetR family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 246 aa  75.9  0.0000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4290  TetR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 246 aa  75.5  0.0000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.362272  normal  0.446856 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2377  transcriptional regulator, TetR family  27.06 
 
 		 211 aa  74.3  0.000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.081674 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1434  transcriptional regulator, TetR family  26.7 
 
 		 225 aa  71.6  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.185065  normal  0.789444 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2143  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 249 aa  70.9  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.101921  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3112  transcriptional regulator, TetR family  32.12 
 
 		 238 aa  69.3  0.00000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.151742  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13066  AsnC family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 246 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.117427 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4590  regulatory protein TetR  28.8 
 
 		 206 aa  64.3  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3962  putative transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 194 aa  63.9  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.545183  normal  0.218359 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4626  transcriptional regulator, TetR family  29.38 
 
 		 211 aa  63.5  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.110176  hitchhiker  0.00755279 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21260  transcriptional regulator, tetR family  46.43 
 
 		 251 aa  62.4  0.000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.646658  normal  0.296128 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1683  TetR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 197 aa  58.9  0.00000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.947535  normal  0.202583 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1383  putative transcriptional regulatory protein  23.98 
 
 		 212 aa  57  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4251  transcriptional regulator, TetR family  26.29 
 
 		 216 aa  53.9  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22701  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3360  TetR family transcriptional regulator  26.49 
 
 		 209 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0120997  normal  0.690483 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3060  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 203 aa  51.6  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0420  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 215 aa  50.4  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1451  TetR family transcriptional regulator  23.83 
 
 		 224 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4602  TetR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 219 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.904797 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0919  TetR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 215 aa  50.1  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1204  transcriptional regulator, TetR family  25.87 
 
 		 206 aa  50.1  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.260768  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1397  TetR family transcriptional regulator  23.83 
 
 		 224 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.515474  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1473  TetR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 195 aa  49.7  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1415  TetR family transcriptional regulator  23.83 
 
 		 224 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2486  transcriptional regulator, TetR family  25.89 
 
 		 200 aa  49.7  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00165208  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  23.24 
 
 		 205 aa  48.5  0.00009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3992  transcriptional regulator, TetR family  26.85 
 
 		 218 aa  48.1  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1795  TetR family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 224 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3512  regulatory protein TetR  24.35 
 
 		 237 aa  47.8  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06720  transcriptional regulator, TetR family  26.04 
 
 		 221 aa  47.8  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4304  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 202 aa  47.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148025  normal  0.676238 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  21.95 
 
 		 224 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0830  transcriptional regulator, TetR family  27.11 
 
 		 214 aa  47  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1062  TetR family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 215 aa  47  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.453034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3806  TetR family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 238 aa  47  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65239  normal  0.316965 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0764  TetR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 203 aa  47  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0005262  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0726  transcriptional regulator, TetR family  36.14 
 
 		 203 aa  46.6  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13232  TetR family transcriptional regulator  24.24 
 
 		 228 aa  47  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.414971 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1286  transcriptional regulator, TetR family  26.29 
 
 		 199 aa  46.6  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000123202 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6979  transcriptional regulator, TetR family  27.96 
 
 		 220 aa  46.2  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.941023  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1216  TetR family transcriptional regulator  25.26 
 
 		 204 aa  46.2  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4588  transcriptional regulator, TetR family  23.78 
 
 		 206 aa  46.2  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112472 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  22.39 
 
 		 222 aa  46.2  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0518  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 206 aa  45.4  0.0008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290772  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32320  transcriptional regulator, TetR family  24.06 
 
 		 200 aa  45.1  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.247928 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4171  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 203 aa  44.7  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0201849  hitchhiker  0.000462956 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0119  TetR family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 201 aa  45.1  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.00000000566826  decreased coverage  0.00000000000241144 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1957  transcriptional regulator, TetR family  38.67 
 
 		 194 aa  44.3  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.292651 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0955  TetR family transcriptional regulator  21.76 
 
 		 218 aa  44.3  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3240  putative transcriptional regulator, TetR family  38.98 
 
 		 201 aa  43.9  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00194759  normal  0.442697 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0117  TetR family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 222 aa  44.3  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6095  regulatory protein, TetR  36.36 
 
 		 204 aa  43.5  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.584059  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0452  TetR family transcriptional regulator  23.17 
 
 		 212 aa  43.9  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.681881  decreased coverage  0.00000297509 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0118  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 222 aa  43.5  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3660  resolvase domain-containing protein  36.54 
 
 		 203 aa  43.1  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0931  transcriptional regulator, TetR family  24.26 
 
 		 215 aa  43.1  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.588864  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3827  transcriptional regulator, TetR family  26.59 
 
 		 212 aa  42.7  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.31638 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2708  TetR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 266 aa  42.7  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4395  transcriptional regulator, TetR family  35.62 
 
 		 196 aa  43.1  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.724029  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0908  transcriptional regulator, TetR family  22.7 
 
 		 207 aa  42.7  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469028  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5374  TetR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 469 aa  43.1  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00219714 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4062  transcriptional regulator, TetR family  48.94 
 
 		 216 aa  42.7  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2134  transcriptional regulator, TetR family  24.19 
 
 		 219 aa  42.4  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00399747  normal  0.0273951 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2441  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 217 aa  42.4  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.429129  normal  0.59735 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28930  transcriptional regulator  40.3 
 
 		 205 aa  42.4  0.007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.218384 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00264  DNA-binding transcriptional repressor FabR  28.33 
 
 		 213 aa  42.4  0.007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0519  TetR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 220 aa  42  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1430  regulatory protein TetR  39.68 
 
 		 236 aa  42  0.008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0872  transcriptional regulator, TetR family  24.09 
 
 		 211 aa  42  0.009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.678947 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4782  transcriptional regulator, TetR family  31.18 
 
 		 205 aa  42  0.009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.682663 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0356  transcriptional regulator, TetR family  33.87 
 
 		 235 aa  42  0.009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00145185  hitchhiker  0.0000223354 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3699  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 204 aa  42  0.01  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.158617  normal  0.554277 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0381  TetR family transcriptional regulator  23.04 
 
 		 212 aa  42  0.01  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>