More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_2564 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007947  Mfla_2564  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 214 aa  440  1e-123  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.454515 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1639  TetR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 215 aa  118  6e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0626  TetR family transcriptional regulator  23.78 
 
 		 199 aa  67  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1339  transcriptional regulator, TetR family  27.89 
 
 		 308 aa  62.4  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.752137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2441  TetR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 217 aa  61.6  0.000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.429129  normal  0.59735 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1419  TetR family transcriptional regulator  24.29 
 
 		 232 aa  60.8  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2834  transcriptional regulator, TetR family  24.74 
 
 		 233 aa  60.1  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.170846  normal  0.770206 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1512  TetR family transcriptional regulator  25.12 
 
 		 233 aa  60.1  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2576  TetR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 233 aa  59.7  0.00000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2643  TetR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 233 aa  59.7  0.00000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1548  TetR family transcriptional regulator  25.12 
 
 		 233 aa  60.1  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1521  TetR family transcriptional regulator  25.12 
 
 		 233 aa  60.1  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1045  TetR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 226 aa  59.3  0.00000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.446098  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4004  TetR family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 196 aa  58.9  0.00000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.638592  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3720  transcriptional regulator, TetR family  27.38 
 
 		 225 aa  58.9  0.00000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1574  regulatory protein, TetR  25.29 
 
 		 200 aa  58.9  0.00000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.979673 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1669  TetR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 235 aa  58.2  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21800  transcriptional regulator  27.16 
 
 		 265 aa  57.4  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.391718  normal  0.223847 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6827  putative transcriptional regulator, TetR family  25.39 
 
 		 200 aa  57.8  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0995041 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2815  TetR family transcriptional regulator  24.55 
 
 		 242 aa  58.2  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.106176  normal  0.623336 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0301  transcriptional regulator, TetR family  27.81 
 
 		 199 aa  57  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0864199  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2097  TetR family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 186 aa  57  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.191848  normal  0.237667 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13440  transcriptional regulator  38.38 
 
 		 188 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.651829 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0754  TetR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 273 aa  56.6  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1592  transcriptional regulator, TetR family  29.89 
 
 		 198 aa  56.2  0.0000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4165  TetR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 232 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.367589  normal  0.612517 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3692  TetR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 244 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.674174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3781  TetR family transcriptional regulator  24.87 
 
 		 214 aa  55.8  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2751  TetR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 232 aa  55.8  0.0000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4578  TetR family transcriptional regulator  25.52 
 
 		 238 aa  55.5  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127543  normal  0.45553 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1838  transcriptional regulator, TetR family  24.55 
 
 		 221 aa  55.1  0.0000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.834516  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2029  TetR family transcriptional regulator  24.55 
 
 		 220 aa  55.5  0.0000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5593  TetR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 233 aa  55.1  0.0000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.531399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4472  transcriptional regulator, TetR family  23.67 
 
 		 205 aa  55.1  0.0000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.590949  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1985  transcriptional regulator, TetR family  29.88 
 
 		 269 aa  54.3  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.351825 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4003  transcriptional regulator, TetR family  27.65 
 
 		 242 aa  54.3  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1335  transcriptional regulator, TetR family  28 
 
 		 194 aa  54.3  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.293374 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1523  TetR family transcriptional regulator  24.56 
 
 		 200 aa  54.7  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000120489 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3958  transcriptional regulator, TetR family  27.65 
 
 		 242 aa  54.3  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4699  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 234 aa  53.5  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.310001  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3892  regulatory protein TetR  35.63 
 
 		 214 aa  53.5  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0167  transcriptional regulator, TetR family  26.88 
 
 		 200 aa  53.9  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1129  TetR family transcriptional regulator  25.6 
 
 		 231 aa  53.9  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4596  transcriptional regulator, TetR family  26.7 
 
 		 421 aa  53.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.227831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0817  TetR family transcriptional regulator  23.56 
 
 		 212 aa  52.8  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3796  TetR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 275 aa  52.4  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.323175 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2919  transcriptional regulator, TetR family  25.57 
 
 		 203 aa  52.4  0.000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0416345  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3277  TetR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 275 aa  52.4  0.000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00759  transcriptional regulator, TetR family protein  24.85 
 
 		 224 aa  51.6  0.000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1743  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 244 aa  51.6  0.000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.065917  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0698  putative transcription regulator protein  25.32 
 
 		 264 aa  51.2  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00682473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2314  transcriptional regulator, TetR family  25.88 
 
 		 213 aa  51.2  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.251224 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3038  transcriptional regulator  25.16 
 
 		 230 aa  51.6  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6809  transcriptional regulator, TetR family  34.29 
 
 		 178 aa  50.8  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.318139  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3953  TetR family transcriptional regulator  24.12 
 
 		 232 aa  51.2  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0396138  normal  0.024229 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3265  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 206 aa  51.2  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.111309  normal  0.286417 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3363  TetR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 244 aa  50.8  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0676561  hitchhiker  0.0000000000000226443 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0194  transcriptional regulator, TetR family  36.99 
 
 		 225 aa  50.8  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4464  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 278 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3902  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 278 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1844  transcriptional regulator, TetR family  28.28 
 
 		 214 aa  50.4  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0987  regulatory protein TetR  34.41 
 
 		 192 aa  50.4  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.383045  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3625  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 278 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.662049  normal  0.863638 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3149  TetR family transcriptional regulator  24.61 
 
 		 205 aa  50.1  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2081  transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 		 193 aa  49.7  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.586313 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2190  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 277 aa  50.1  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.168858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0125  TetR family transcriptional regulator  23.91 
 
 		 238 aa  49.7  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.493759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2708  TetR family transcriptional regulator  25.57 
 
 		 266 aa  50.1  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2630  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 205 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0697093  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4455  transcriptional regulator, TetR family  27.04 
 
 		 215 aa  50.1  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0390638 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1316  transcriptional regulator, TetR family  21.59 
 
 		 298 aa  49.3  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0225  TetR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 240 aa  49.3  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.512739 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0901  TetR family transcriptional regulator  24.71 
 
 		 236 aa  49.3  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0245  transcriptional regulator  27.78 
 
 		 208 aa  49.3  0.00004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4681  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 283 aa  49.3  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.433841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0410  TetR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 245 aa  48.9  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.560758  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4061  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 240 aa  48.9  0.00005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3641  TetR family transcriptional regulator  22.29 
 
 		 200 aa  48.9  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.798229 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3296  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 200 aa  48.9  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.791383 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2438  transcriptional regulator, TetR family  27.7 
 
 		 208 aa  48.9  0.00006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1935  transcriptional regulator, TetR family  27.81 
 
 		 233 aa  48.9  0.00006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0662  TetR family transcriptional regulator  26.49 
 
 		 205 aa  48.9  0.00006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4358  regulatory protein, TetR  36.36 
 
 		 220 aa  48.5  0.00007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2550  TetR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 218 aa  48.5  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.714249  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2595  TetR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 218 aa  48.5  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.470916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2329  TetR family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 186 aa  48.5  0.00007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000143879 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1636  TetR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 226 aa  48.5  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.232227 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2589  TetR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 218 aa  48.5  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0467088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4280  transcriptional regulator, TetR family  25.41 
 
 		 203 aa  48.5  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.409841  normal  0.686522 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24490  transcriptional regulator  34.72 
 
 		 213 aa  48.1  0.00008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2276  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 403 aa  48.5  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.276985  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0648  transcriptional regulator, TetR family  23.64 
 
 		 247 aa  48.5  0.00008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0672593 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3205  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 197 aa  48.5  0.00008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3677  transcriptional regulator, TetR family  25.73 
 
 		 196 aa  48.5  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503409  normal  0.650375 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3267  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 197 aa  48.5  0.00008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0261097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3216  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 197 aa  48.5  0.00008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.278224  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1703  TetR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 106 aa  48.1  0.00009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3152  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  34.07 
 
 		 215 aa  48.1  0.00009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3314  TetR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 214 aa  48.1  0.00009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3146  transcriptional regulator, TetR family  34.07 
 
 		 215 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0376592  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>