168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1985 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_1985  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 269 aa  539  9.999999999999999e-153  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.351825 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1316  transcriptional regulator, TetR family  47.93 
 
 		 298 aa  167  2e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1374  transcriptional regulator, TetR family  50.93 
 
 		 225 aa  154  1e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.181966  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0893  transcriptional regulator, TetR family  42.13 
 
 		 201 aa  135  6.0000000000000005e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.17617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1896  transcriptional regulator, TetR family  40.98 
 
 		 204 aa  134  9.999999999999999e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1935  transcriptional regulator, TetR family  38.53 
 
 		 233 aa  134  1.9999999999999998e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2490  transcriptional regulator, TetR family  39.39 
 
 		 200 aa  125  1e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.375188  normal  0.286749 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1806  transcriptional regulator, TetR family  39.77 
 
 		 207 aa  124  1e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.382485 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0012  transcriptional regulator, TetR family  43.9 
 
 		 207 aa  122  6e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2007  transcriptional regulator, TetR family  42.07 
 
 		 221 aa  118  7.999999999999999e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.175096  normal  0.641587 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3888  transcriptional regulator, TetR family  38.29 
 
 		 214 aa  116  5e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4340  transcriptional regulator, TetR family  40.7 
 
 		 203 aa  114  2.0000000000000002e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1807  transcriptional regulator, TetR family  38.25 
 
 		 199 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.366594 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0748  transcriptional regulator, TetR family  40.49 
 
 		 194 aa  112  9e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.866187  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2919  transcriptional regulator, TetR family  39.26 
 
 		 203 aa  111  1.0000000000000001e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0416345  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1666  transcriptional regulator, TetR family  36.16 
 
 		 209 aa  103  2e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.40268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0786  transcriptional regulator, TetR family  34.91 
 
 		 202 aa  98.6  1e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.536081  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0499  transcriptional regulator, TetR family  33.54 
 
 		 201 aa  87.4  2e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.38098  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2800  transcriptional regulator, TetR family  28.72 
 
 		 206 aa  75.9  0.0000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16270  transcriptional regulator  28.57 
 
 		 287 aa  65.5  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2346  hypothetical protein  33.14 
 
 		 217 aa  63.9  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1339  transcriptional regulator, TetR family  29.11 
 
 		 308 aa  63.9  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.752137  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1196  transcriptional regulator, TetR family  35.48 
 
 		 228 aa  62.4  0.000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.000000002147  hitchhiker  0.00000600855 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1747  TetR family transcriptional regulator  23.95 
 
 		 221 aa  62.4  0.000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4046  TetR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 212 aa  62.4  0.000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0961065 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0433  TetR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 204 aa  59.3  0.00000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.376909  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1958  TetR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 251 aa  57.4  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.455038  normal  0.501183 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1103  transcriptional regulator, TetR family  24.56 
 
 		 248 aa  55.5  0.0000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.575371  normal  0.523139 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2564  TetR family transcriptional regulator  29.88 
 
 		 214 aa  53.1  0.000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.454515 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3195  transcriptional regulator, TetR family  28.47 
 
 		 200 aa  53.5  0.000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5076  TetR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 215 aa  53.5  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.175697 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1591  TetR family transcriptional regulator  25.73 
 
 		 215 aa  53.5  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.194821 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2372  transcriptional regulator, TetR family  24.19 
 
 		 193 aa  53.5  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.74201  normal  0.115149 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13590  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 200 aa  53.1  0.000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.332381  normal  0.0844747 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3494  transcriptional regulator, TetR family  33.03 
 
 		 208 aa  53.1  0.000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0069  putative transcriptional regulator  28.17 
 
 		 202 aa  52.8  0.000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.494217  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4691  TetR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 205 aa  52.8  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.771858  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4777  TetR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 205 aa  52.8  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.681727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0772  transcriptional regulator, TetR family  29.63 
 
 		 223 aa  52.4  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2099  transcriptional regulator, TetR family  25.73 
 
 		 216 aa  52.4  0.000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  22.7 
 
 		 231 aa  51.2  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1483  TetR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 197 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2785  TetR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 196 aa  50.8  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.256269 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5283  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 208 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.261053 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3584  regulatory protein TetR  25.31 
 
 		 204 aa  50.4  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0125026  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3238  transcriptional regulator, TetR family  25.3 
 
 		 198 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.210945  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2034  TetR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 216 aa  50.1  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.480509  normal  0.0875613 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1025  transcriptional regulator, TetR family  27.11 
 
 		 192 aa  50.1  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3165  TetR family transcriptional regulator  25.15 
 
 		 243 aa  49.7  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.15717  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  32.88 
 
 		 230 aa  49.3  0.00006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1369  transcriptional regulator, TetR family  32.62 
 
 		 197 aa  49.3  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.859804 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2434  transcriptional regulator, TetR family  26.25 
 
 		 211 aa  49.3  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1710  transcriptional regulator, TetR family  21.97 
 
 		 200 aa  49.3  0.00006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000037358  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4313  TetR family transcriptional regulator  24.18 
 
 		 600 aa  48.9  0.00009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2444  transcriptional regulator, TetR family  27.52 
 
 		 211 aa  48.9  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0505938 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2300  TetR family transcriptional regulator  24.84 
 
 		 208 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2347  TetR family transcriptional regulator  24.84 
 
 		 208 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0682211  normal  0.43856 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3859  TetR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 211 aa  48.5  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.677666 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4472  transcriptional regulator, TetR family  39.39 
 
 		 205 aa  48.1  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.590949  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1087  transcriptional regulator, TetR family  25.86 
 
 		 215 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.9461  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2272  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 211 aa  47.8  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000566042  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4222  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 221 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.42669  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4288  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 221 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.458199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2339  TetR family transcriptional regulator  24.84 
 
 		 208 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00249237 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4600  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 221 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0411306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2500  transcriptional regulator, TetR family  26.09 
 
 		 211 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1007  transcription regulator protein  33.57 
 
 		 239 aa  47.4  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.605979  normal  0.178446 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2304  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 211 aa  47  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373552  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2226  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 211 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0397604  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2479  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 211 aa  47  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660065  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0306  TetR family transcriptional regulator  24.68 
 
 		 219 aa  47.4  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641939  normal  0.172302 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2603  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 208 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 291 aa  47.4  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5271  transcriptional regulator, TetR family  31.29 
 
 		 212 aa  47  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.869889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5380  TetR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 197 aa  47  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.768843  normal  0.61228 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8769  putative transcriptional regulator, TetR family  25.58 
 
 		 202 aa  47  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3689  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 213 aa  47  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3347  TetR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 187 aa  46.6  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.084846  normal  0.752924 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0595  TetR family transcriptional regulator  25.5 
 
 		 204 aa  46.6  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2692  TetR family transcriptional regulator  26.49 
 
 		 195 aa  46.6  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.728372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5621  transcriptional regulator, TetR family  26.47 
 
 		 195 aa  46.6  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00254336 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2105  transcriptional regulator, TetR family  28.75 
 
 		 202 aa  46.6  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.143952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0170  TetR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 192 aa  46.2  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.652591  normal  0.659974 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0835  TetR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 201 aa  46.6  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.861936  normal  0.897725 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2575  transcriptional regulator, TetR family  25.62 
 
 		 211 aa  46.2  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000582548  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0483  TetR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 225 aa  45.8  0.0007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0452  regulatory protein TetR  30.63 
 
 		 221 aa  45.8  0.0007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2426  TetR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 205 aa  45.8  0.0007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4824  TetR family transcriptional regulator  24.67 
 
 		 228 aa  45.8  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2488  TetR family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 201 aa  45.8  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0524247 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4300  transcriptional regulator  30.77 
 
 		 225 aa  45.8  0.0008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  24.42 
 
 		 193 aa  45.8  0.0008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2965  TetR family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 224 aa  45.8  0.0008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0278757  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0056  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 198 aa  45.8  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1173  TetR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 189 aa  45.8  0.0008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2547  TetR family transcriptional regulator  21.39 
 
 		 196 aa  45.4  0.0009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.28213  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2846  regulatory protein, TetR  29.41 
 
 		 227 aa  45.1  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2281  regulatory protein, TetR  35.21 
 
 		 205 aa  45.1  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.45314 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4218  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 202 aa  45.4  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.135159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6365  putative transcriptional regulator, TetR family  27.54 
 
 		 210 aa  45.4  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277737  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>