133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_4340 on replicon NC_013744
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013744  Htur_4340  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 203 aa  416  9.999999999999999e-116  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0012  transcriptional regulator, TetR family  46.84 
 
 		 207 aa  165  5e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0499  transcriptional regulator, TetR family  44.39 
 
 		 201 aa  148  5e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.38098  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2919  transcriptional regulator, TetR family  37.88 
 
 		 203 aa  145  6e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0416345  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0786  transcriptional regulator, TetR family  42.51 
 
 		 202 aa  134  9.999999999999999e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.536081  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1666  transcriptional regulator, TetR family  38.5 
 
 		 209 aa  124  7e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.40268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3888  transcriptional regulator, TetR family  37.88 
 
 		 214 aa  121  7e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0893  transcriptional regulator, TetR family  38.42 
 
 		 201 aa  121  8e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.17617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1374  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 225 aa  115  3.9999999999999997e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.181966  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1316  transcriptional regulator, TetR family  36.31 
 
 		 298 aa  115  5e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1196  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 228 aa  115  6e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.000000002147  hitchhiker  0.00000600855 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1985  transcriptional regulator, TetR family  40.7 
 
 		 269 aa  114  6.9999999999999995e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.351825 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2007  transcriptional regulator, TetR family  36.56 
 
 		 221 aa  114  1.0000000000000001e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.175096  normal  0.641587 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1896  transcriptional regulator, TetR family  34.9 
 
 		 204 aa  112  3e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1806  transcriptional regulator, TetR family  31.52 
 
 		 207 aa  107  1e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.382485 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1935  transcriptional regulator, TetR family  37.7 
 
 		 233 aa  105  3e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1807  transcriptional regulator, TetR family  32.5 
 
 		 199 aa  97.4  1e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.366594 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2490  transcriptional regulator, TetR family  30.9 
 
 		 200 aa  97.1  2e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.375188  normal  0.286749 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0748  transcriptional regulator, TetR family  32.42 
 
 		 194 aa  94.4  1e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.866187  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2800  transcriptional regulator, TetR family  35.85 
 
 		 206 aa  92.8  3e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3506  TetR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 195 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal  0.0873465 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1103  transcriptional regulator, TetR family  26.84 
 
 		 248 aa  52.8  0.000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.575371  normal  0.523139 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1747  TetR family transcriptional regulator  21.56 
 
 		 221 aa  52  0.000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0626  TetR family transcriptional regulator  22.7 
 
 		 199 aa  52  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1866  TetR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 212 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.26917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  23.42 
 
 		 190 aa  49.3  0.00004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0309  transcriptional regulator, TetR family  35.94 
 
 		 213 aa  49.3  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.302465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3524  TetR family transcriptional regulator  25.39 
 
 		 223 aa  48.9  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0849134 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47520  putative transcriptional regulator  34.21 
 
 		 197 aa  48.5  0.00006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  24.38 
 
 		 190 aa  48.5  0.00007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3227  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 204 aa  48.1  0.00008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4290  transcriptional regulator, TetR family  36.62 
 
 		 226 aa  48.1  0.00008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000567463  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2692  TetR family transcriptional regulator  23.84 
 
 		 195 aa  47.4  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.728372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0832  transcriptional regulator, TetR family  26.54 
 
 		 211 aa  47.4  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.933061 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2565  transcriptional regulator, TetR family  26.99 
 
 		 195 aa  47.8  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.908518  normal  0.0361185 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1823  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 222 aa  47  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.331222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4280  transcriptional regulator, TetR family  25.44 
 
 		 203 aa  47  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.409841  normal  0.686522 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0070  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 202 aa  47.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128358  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0513  transcriptional regulator, TetR family  24.84 
 
 		 193 aa  46.2  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.826847 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2257  TetR family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 202 aa  46.2  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.92818  normal  0.36633 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3570  transcriptional regulator, TetR family  25.44 
 
 		 175 aa  45.8  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00083347  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3710  regulatory protein, TetR  32.31 
 
 		 230 aa  45.8  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1681  TetR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 217 aa  46.2  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.371055  normal  0.828695 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4091  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 222 aa  45.8  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0267897 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4611  transcriptional regulator, TetR family  27.92 
 
 		 371 aa  46.2  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3021  regulatory protein, TetR  27.73 
 
 		 205 aa  45.4  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.84883  normal  0.636371 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11192  transcriptional regulator  26.62 
 
 		 201 aa  45.4  0.0005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6134  transcriptional regulator, TetR family  25.29 
 
 		 228 aa  45.4  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0948812  normal  0.0489287 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3535  transcriptional regulator, TetR family  26.17 
 
 		 191 aa  45.4  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3642  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 227 aa  45.4  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.494269 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2454  TetR family transcriptional regulator  24.64 
 
 		 185 aa  45.4  0.0006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5436  transcriptional regulator, TetR family  25.37 
 
 		 205 aa  45.4  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.770498 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1020  TetR family transcriptional regulator  26.13 
 
 		 198 aa  44.7  0.0008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.13954 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2103  TetR family transcriptional regulator  26.39 
 
 		 239 aa  45.1  0.0008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5527  transcriptional regulator, TetR family  34.48 
 
 		 210 aa  45.1  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.107312  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4115  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 194 aa  44.7  0.0009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.1417 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0684  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 213 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.974708 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0620  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 193 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0633  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 193 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3287  TetR family transcriptional regulator  24.56 
 
 		 195 aa  44.7  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.443656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0611  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 193 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4467  TetR family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 206 aa  44.7  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0963408 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13188  TetR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 208 aa  44.3  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.166406 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0153  TetR family transcriptional regulator  22.45 
 
 		 210 aa  44.3  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4073  TetR family transcriptional regulator  24.67 
 
 		 223 aa  44.7  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6158  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 212 aa  44.3  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.488727  normal  0.104212 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0424  TetR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 200 aa  44.3  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0278  transcriptional regulator, TetR family  25.69 
 
 		 206 aa  43.9  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.72994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0772  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 223 aa  44.3  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3413  transcriptional regulator, TetR family  28.29 
 
 		 246 aa  43.9  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3418  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 234 aa  43.9  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.111441  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0992  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 226 aa  43.5  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000245295 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2659  TetR family transcriptional regulator  25.5 
 
 		 418 aa  43.9  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2603  TetR family transcriptional regulator  22.89 
 
 		 208 aa  43.5  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2963  TetR family transcriptional regulator  23.72 
 
 		 189 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.412295 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4427  TetR family transcriptional regulator  25.85 
 
 		 216 aa  43.5  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  24.72 
 
 		 212 aa  43.9  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1522  regulatory protein TetR  25.31 
 
 		 207 aa  43.1  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.855326  normal  0.485337 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2788  transcriptional regulator, TetR family  25.83 
 
 		 201 aa  43.9  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1087  transcriptional regulator, TetR family  21.85 
 
 		 215 aa  43.9  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.9461  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1801  transcriptional regulator, TetR family  25.31 
 
 		 207 aa  43.1  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0882167  normal  0.119004 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04039  hypothetical protein  23.96 
 
 		 215 aa  43.5  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000282396  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5561  transcriptional regulator, TetR family  29.06 
 
 		 196 aa  43.9  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.842065 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16270  transcriptional regulator  22.67 
 
 		 287 aa  43.5  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0817  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 332 aa  43.1  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65900  TetR family transcriptional regulator  23.7 
 
 		 215 aa  43.1  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0425501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5318  transcriptional regulator, TetR family  26.92 
 
 		 197 aa  43.1  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2786  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 190 aa  43.1  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.06199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0421  transcriptional regulator, TetR family  25.68 
 
 		 198 aa  42.7  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2739  transcriptional regulator, TetR family  34.33 
 
 		 225 aa  42.7  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000589766  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0144  TetR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 181 aa  42.4  0.004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1987  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 210 aa  42.4  0.004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2339  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 208 aa  42.4  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00249237 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4098  TetR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 315 aa  42.4  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2734  putative transcriptional regulator, TetR family  23.08 
 
 		 206 aa  42.7  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.596696  normal  0.79417 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1864  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 204 aa  42.4  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0665556  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3270  transcriptional regulator, TetR family  22.73 
 
 		 199 aa  42.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2209  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 204 aa  42.7  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1275  transcriptional regulator, TetR family  31.15 
 
 		 214 aa  42.7  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4824  TetR family transcriptional regulator  23.13 
 
 		 228 aa  42.4  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>