More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_2800 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_2800  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 206 aa  419  1e-116  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0786  transcriptional regulator, TetR family  36.47 
 
 		 202 aa  95.5  6e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.536081  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4340  transcriptional regulator, TetR family  35.85 
 
 		 203 aa  92.8  3e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1666  transcriptional regulator, TetR family  33.66 
 
 		 209 aa  88.6  6e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.40268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0893  transcriptional regulator, TetR family  35.62 
 
 		 201 aa  88.6  6e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.17617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0012  transcriptional regulator, TetR family  31.02 
 
 		 207 aa  85.5  5e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0499  transcriptional regulator, TetR family  32.11 
 
 		 201 aa  78.6  0.00000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.38098  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2007  transcriptional regulator, TetR family  30.3 
 
 		 221 aa  77.8  0.0000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.175096  normal  0.641587 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1985  transcriptional regulator, TetR family  28.72 
 
 		 269 aa  76.6  0.0000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.351825 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0748  transcriptional regulator, TetR family  30.59 
 
 		 194 aa  75.9  0.0000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.866187  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1374  transcriptional regulator, TetR family  29.8 
 
 		 225 aa  74.7  0.0000000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.181966  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1935  transcriptional regulator, TetR family  27.5 
 
 		 233 aa  71.2  0.000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1896  transcriptional regulator, TetR family  30.86 
 
 		 204 aa  68.9  0.00000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1316  transcriptional regulator, TetR family  27.94 
 
 		 298 aa  68.6  0.00000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2490  transcriptional regulator, TetR family  26.29 
 
 		 200 aa  67.8  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.375188  normal  0.286749 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2919  transcriptional regulator, TetR family  25.64 
 
 		 203 aa  66.6  0.0000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0416345  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1196  transcriptional regulator, TetR family  34.15 
 
 		 228 aa  65.9  0.0000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.000000002147  hitchhiker  0.00000600855 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16270  transcriptional regulator  27.59 
 
 		 287 aa  63.2  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1806  transcriptional regulator, TetR family  23 
 
 		 207 aa  63.2  0.000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.382485 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1807  transcriptional regulator, TetR family  28.33 
 
 		 199 aa  59.7  0.00000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.366594 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2556  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 208 aa  58.2  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000000489141  normal  0.182844 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1173  TetR family transcriptional regulator  22.87 
 
 		 189 aa  58.2  0.00000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0772  transcriptional regulator, TetR family  35.16 
 
 		 223 aa  57.8  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0626  TetR family transcriptional regulator  23.31 
 
 		 199 aa  55.8  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1987  TetR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0452  transcriptional regulator, TetR family  24.15 
 
 		 207 aa  54.3  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0450  transcriptional regulator, TetR family  23.98 
 
 		 349 aa  53.9  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0035112 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3888  transcriptional regulator, TetR family  24.04 
 
 		 214 aa  52.8  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0309  transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 213 aa  52.8  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.302465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4222  TetR family transcriptional regulator  26.64 
 
 		 221 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.42669  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4288  TetR family transcriptional regulator  26.64 
 
 		 221 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.458199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4600  TetR family transcriptional regulator  26.64 
 
 		 221 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0411306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4623  TetR family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 213 aa  51.6  0.000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.317667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3021  regulatory protein, TetR  25.7 
 
 		 205 aa  50.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.84883  normal  0.636371 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1135  TetR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 206 aa  51.2  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4046  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 212 aa  50.8  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0961065 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1142  TetR family transcriptional regulator  27.6 
 
 		 210 aa  51.2  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.282615  normal  0.594609 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6231  transcriptional regulator, TetR family  29.38 
 
 		 197 aa  50.4  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5527  transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 		 210 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.107312  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3944  putative transcriptional regulator, TetR family  31.91 
 
 		 183 aa  50.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000137534  hitchhiker  0.00939559 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0167  transcriptional regulator, TetR family  23.81 
 
 		 200 aa  50.1  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0074  TetR/AcrR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 196 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1591  TetR family transcriptional regulator  23.3 
 
 		 215 aa  49.7  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.194821 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 190 aa  49.7  0.00003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  46 
 
 		 190 aa  49.7  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2499  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 208 aa  49.3  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1747  TetR family transcriptional regulator  24.46 
 
 		 221 aa  49.3  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1709  transcriptional regulator, TetR family  31.43 
 
 		 207 aa  49.3  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17641  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4191  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 236 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.513173  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1986  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 218 aa  48.9  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0191052  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5593  TetR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 233 aa  48.9  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.531399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0402  transcriptional regulator, TetR family  26.39 
 
 		 219 aa  48.9  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.67084  normal  0.0771341 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6228  transcriptional regulator, TetR family  27.89 
 
 		 194 aa  48.9  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.301912  normal  0.923303 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4362  TetR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 228 aa  48.9  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0699129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1858  TetR family transcriptional regulator  24.29 
 
 		 234 aa  48.9  0.00006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.543066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0421  transcriptional regulator, TetR family  26.88 
 
 		 198 aa  48.5  0.00006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0795  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 199 aa  48.5  0.00007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00985009  normal  0.205797 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7752  putative transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 202 aa  48.5  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3179  regulatory protein, TetR  31.03 
 
 		 215 aa  48.5  0.00007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.323857 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2257  TetR family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 202 aa  48.5  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.92818  normal  0.36633 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2561  transcriptional regulator, TetR family  34.12 
 
 		 203 aa  47.8  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3576  TetR-like virulence regulator  25.23 
 
 		 207 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7671  TetR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 188 aa  47.8  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.403599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22050  transcriptional regulator  32.33 
 
 		 199 aa  48.1  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0903673 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  22.94 
 
 		 207 aa  47.8  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0295  transcriptional regulator, TetR family  35.19 
 
 		 220 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0107513  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5646  TetR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 233 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.176197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0832  transcriptional regulator, TetR family  28.06 
 
 		 211 aa  47.8  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.933061 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4115  transcriptional regulator, TetR family  35.19 
 
 		 194 aa  47  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.1417 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6164  TetR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 285 aa  47.4  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.406893 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0817  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 332 aa  47  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 291 aa  46.6  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1420  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 212 aa  47  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3299  transcriptional regulator, TetR family  23.74 
 
 		 201 aa  47  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000002111  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2395  transcriptional regulator, TetR family  33.87 
 
 		 205 aa  47  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.431985  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3513  TetR family transcriptional regulator  25.2 
 
 		 195 aa  47.4  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.809024  normal  0.394338 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2820  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 211 aa  47.4  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4931  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 497 aa  46.6  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.475051  normal  0.080695 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2310  TetR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 220 aa  46.2  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.987325  decreased coverage  0.00710043 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0620  TetR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 193 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2813  TetR family transcriptional regulator  25.17 
 
 		 215 aa  46.6  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0034  TetR family transcriptional regulator  23.44 
 
 		 189 aa  46.6  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.345685  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0034  TetR family transcriptional regulator  23.44 
 
 		 189 aa  46.6  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0477  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 202 aa  46.6  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3408  TetR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 205 aa  46.6  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.954504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0633  TetR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 193 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1156  TetR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 192 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00478832  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2249  TetR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 227 aa  46.6  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.111246  normal  0.0445772 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0611  TetR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 193 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00320  transcriptional regulator, tetR family  47.06 
 
 		 256 aa  46.2  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.48619  normal  0.068604 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1844  transcriptional regulator, TetR family  24.83 
 
 		 214 aa  45.8  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4522  transcriptional regulator, TetR family  25.47 
 
 		 191 aa  46.2  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.828993  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1467  transcriptional regulator, TetR family  36.49 
 
 		 217 aa  45.8  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0429  TetR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 213 aa  45.8  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0148562 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20070  transcriptional regulator, TetR family  22 
 
 		 205 aa  45.4  0.0005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5635  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 203 aa  45.8  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0445849  normal  0.712508 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2431  TetR family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 214 aa  45.8  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0857946 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2190  TetR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 223 aa  45.8  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3298  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 206 aa  45.4  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4734  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 242 aa  45.4  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>