More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6164 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_6164  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 285 aa  578  1e-164  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.406893 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6418  transcriptional regulator, TetR family  41.18 
 
 		 259 aa  189  4e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3927  transcriptional regulator, TetR family  32.58 
 
 		 218 aa  85.9  8e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69466  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3892  transcriptional regulator, TetR family  33.77 
 
 		 211 aa  84.3  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2572  transcriptional regulator, TetR family  36.97 
 
 		 239 aa  84.7  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.314261  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1945  putative transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 268 aa  82.4  0.000000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.951149  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2797  TetR family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 242 aa  80.5  0.00000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139894  normal  0.287212 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0638  TetR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 250 aa  78.2  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1499  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 271 aa  77.4  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.148288  normal  0.740937 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1254  TetR family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 223 aa  77  0.0000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.297921  normal  0.284076 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4572  putative transcriptional regulator, TetR family  31.12 
 
 		 223 aa  77  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.145324  normal  0.111989 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3718  transcriptional regulator, TetR family  27.03 
 
 		 223 aa  76.3  0.0000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000868131  normal  0.31083 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5582  transcriptional regulator, TetR family  31.84 
 
 		 250 aa  76.3  0.0000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0819  transcriptional regulator, TetR family  36.91 
 
 		 237 aa  75.9  0.0000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0664  TetR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 235 aa  75.9  0.0000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.773977  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3270  transcriptional regulator, TetR family  27.68 
 
 		 225 aa  75.5  0.0000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.8331  normal  0.0947304 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0104  TetR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 207 aa  75.5  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000192911 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2997  transcriptional regulator, TetR family  34.96 
 
 		 239 aa  74.3  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00034517  decreased coverage  0.000048455 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0832  Tetracyclin repressor domain protein  36.05 
 
 		 204 aa  73.9  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4140  transcriptional regulator, TetR family  31.21 
 
 		 240 aa  73.9  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1498  TetR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 244 aa  73.2  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1677  transcriptional regulator, TetR family  33.89 
 
 		 218 aa  72  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00000521041  normal  0.168881 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1498  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 244 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.98693  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1521  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 244 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.290905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5576  transcriptional regulator, TetR family  26.75 
 
 		 234 aa  72  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2646  transcriptional regulator, TetR family  29.15 
 
 		 236 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00299352  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2637  putative transcriptional regulator, TetR family  29.38 
 
 		 220 aa  70.9  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000568428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3174  TetR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 230 aa  70.9  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0201096  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4938  regulatory protein, TetR  35.04 
 
 		 222 aa  70.1  0.00000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0214473 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2585  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 218 aa  69.3  0.00000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.106012  normal  0.0213025 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2719  transcriptional regulator, TetR family  28.96 
 
 		 227 aa  69.7  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5716  transcriptional regulator, TetR family  29.8 
 
 		 255 aa  68.9  0.00000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.831325 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0437  TetR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 239 aa  68.9  0.00000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1040  regulatory protein TetR  31.51 
 
 		 219 aa  68.6  0.0000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.591621  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8044  putative transcriptional regulator, TetR family  29.24 
 
 		 249 aa  68.6  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.467604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0408  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 212 aa  68.6  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2719  TetR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 223 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2357  transcriptional regulator, TetR family  40.82 
 
 		 218 aa  68.2  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7234  putative transcriptional regulator, TetR family  35.04 
 
 		 249 aa  67.8  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0251  TetR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 202 aa  67.4  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0215  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 246 aa  66.6  0.0000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.674801 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0628  transcriptional regulator, TetR family  30.52 
 
 		 218 aa  66.6  0.0000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.504351 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4284  transcriptional regulator, TetR family  39.6 
 
 		 223 aa  66.6  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.620259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1017  TetR family transcriptional regulator  34 
 
 		 216 aa  66.6  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.056125 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3639  transcriptional regulator, TetR family  26.43 
 
 		 234 aa  66.2  0.0000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0039  transcriptional regulator  28.69 
 
 		 233 aa  66.6  0.0000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0522  transcriptional regulator, TetR family  29.1 
 
 		 259 aa  66.6  0.0000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0445084 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3085  regulatory protein, TetR  29.3 
 
 		 223 aa  65.9  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.355286  normal  0.26404 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8893  transcriptional regulator, TetR family  31.45 
 
 		 272 aa  65.9  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6464  putative transcriptional regulator, TetR family  26.91 
 
 		 245 aa  65.9  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0682753 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2497  putative transcriptional regulator, GntR family  33.54 
 
 		 315 aa  65.1  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.182047 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0036  putative transcriptional regulator, TetR family  30.48 
 
 		 234 aa  64.7  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.940738 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4689  transcriptional regulator, TetR family  28.93 
 
 		 259 aa  64.3  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4355  TetR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 244 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.589486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2378  transcriptional repressor TetR  25.2 
 
 		 260 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0287531  normal  0.0684522 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1119  transcriptional regulator, TetR family  32.24 
 
 		 211 aa  63.9  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.335801 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23630  transcriptional regulator  29.41 
 
 		 210 aa  63.9  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.119387 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4446  hypothetical protein  33.86 
 
 		 229 aa  63.9  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.25718 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2273  transcriptional regulator, TetR family  29.03 
 
 		 224 aa  63.9  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6521  putative transcriptional regulator, TetR family  31.43 
 
 		 210 aa  63.5  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.177383 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1662  transcriptional regulator, TetR family  31.41 
 
 		 213 aa  63.5  0.000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.552653  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0897  transcriptional regulator, TetR family  27.59 
 
 		 265 aa  63.5  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0683  transcriptional regulator, TetR family  25.7 
 
 		 233 aa  63.5  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.124954 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0683  transcriptional regulator, TetR family  27.63 
 
 		 243 aa  63.2  0.000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0129651  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4216  putative transcriptional regulator, TetR family  34.87 
 
 		 212 aa  63.2  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00833872  hitchhiker  0.000365538 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3109  TetR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 205 aa  63.2  0.000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0137482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1243  TetR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 229 aa  62.8  0.000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.176443 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0040  TetR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 211 aa  62.8  0.000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.970085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1989  TetR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 250 aa  62.4  0.000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4132  transcriptional regulator, TetR family  23.66 
 
 		 192 aa  62  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.88155  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3105  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 260 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0414  transcriptional regulator, TetR family  26.56 
 
 		 233 aa  61.6  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7832  transcriptional regulator, TetR family  25.64 
 
 		 253 aa  62  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0353896 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5957  transcriptional regulator, TetR family  28.45 
 
 		 229 aa  61.6  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.769485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2683  TetR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 218 aa  62  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24780  transcriptional regulator, tetR family  30 
 
 		 220 aa  60.8  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4960  TetR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 230 aa  61.2  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0493125  normal  0.261942 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4056  transcriptional regulator, TetR family  32.59 
 
 		 209 aa  61.2  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.910923  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3750  TetR family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 215 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1898  transcriptional regulator, TetR family  28.43 
 
 		 225 aa  60.8  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00182667  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0559  TetR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 215 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2337  transcriptional regulator, TetR family  31.31 
 
 		 218 aa  61.6  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0631  TetR family transcriptional regulator  27.9 
 
 		 215 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2792  TetR family transcriptional regulator  32.72 
 
 		 190 aa  60.5  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.782155  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0585  TetR family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 215 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.808799  normal  0.581317 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0716  transcriptional regulator, TetR family  26.91 
 
 		 231 aa  60.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0221174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1997  TetR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 250 aa  60.1  0.00000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.354177  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7060  tetracycline repressor domain-containing protein  29.44 
 
 		 203 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0598818  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9231  tetR-family regulatory protein  32.17 
 
 		 247 aa  60.1  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.484933  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3544  transcriptional regulator, TetR family  29.68 
 
 		 258 aa  59.7  0.00000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.164716  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0181  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 215 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0664  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 215 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.783759  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2285  transcriptional regulator, TetR family  28.12 
 
 		 213 aa  59.3  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21360  transcriptional regulator, TetR family  31.15 
 
 		 206 aa  59.3  0.00000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.127836  normal  0.357603 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3932  putative transcriptional regulator, TetR family  29.61 
 
 		 228 aa  59.3  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199219  normal  0.0173794 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04290  transcriptional regulator  32.22 
 
 		 230 aa  58.9  0.00000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0356089  normal  0.115644 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3074  TetR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 192 aa  58.9  0.00000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3134  TetR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 192 aa  58.9  0.00000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.641409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3091  TetR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 192 aa  58.9  0.00000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0742554 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2916  TetR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 216 aa  58.9  0.00000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>