135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B3105 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B3105  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 260 aa  534  1e-151  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3783  putative TetR family transcriptional regulator  41.48 
 
 		 292 aa  202  4e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3817  transcriptional regulator, TetR family  30.81 
 
 		 223 aa  63.9  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.131002  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4294  transcriptional regulator, GntR family  34.43 
 
 		 343 aa  63.5  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.806766 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1499  TetR family transcriptional regulator  26.39 
 
 		 271 aa  62.4  0.000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.148288  normal  0.740937 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6164  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 285 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.406893 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3718  transcriptional regulator, TetR family  26.98 
 
 		 223 aa  62  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000868131  normal  0.31083 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7747  putative transcriptional regulator  25.63 
 
 		 342 aa  61.6  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.117612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5716  transcriptional regulator, TetR family  27.31 
 
 		 255 aa  59.7  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.831325 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1460  transcriptional regulator, TetR family  27.16 
 
 		 249 aa  59.3  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2997  transcriptional regulator, TetR family  37.63 
 
 		 239 aa  59.3  0.00000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00034517  decreased coverage  0.000048455 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11383  transcriptional regulator  32.17 
 
 		 261 aa  58.9  0.00000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.900966 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0730  TetR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 242 aa  57.8  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00296779  normal  0.0851548 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4066  putative transcriptional regulator, TetR family  25.49 
 
 		 253 aa  57.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.546263  normal  0.272387 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0017  transcriptional regulator, TetR family  30.14 
 
 		 224 aa  57  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0092  GntR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 330 aa  55.5  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1989  TetR family transcriptional regulator  23.7 
 
 		 250 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0638  TetR family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 250 aa  55.1  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4446  hypothetical protein  26.03 
 
 		 229 aa  54.7  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.25718 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3221  TetR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 232 aa  53.5  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4355  TetR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 244 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.589486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4458  transcriptional regulator, TetR family  27.97 
 
 		 263 aa  53.5  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0794126 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1139  TetR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 220 aa  52.8  0.000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0501486 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3007  transcriptional regulator, TetR family  35.11 
 
 		 239 aa  52.8  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0040024 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1040  regulatory protein TetR  29.81 
 
 		 219 aa  52.4  0.000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.591621  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1945  putative transcriptional regulator, TetR family  35.37 
 
 		 268 aa  52.4  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.951149  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1704  transcriptional regulator, TetR family  27.8 
 
 		 204 aa  52  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.326361  normal  0.417933 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5576  transcriptional regulator, TetR family  27.85 
 
 		 234 aa  51.6  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3927  transcriptional regulator, TetR family  23.77 
 
 		 218 aa  51.2  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0664  TetR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 235 aa  52  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.773977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4960  TetR family transcriptional regulator  24.88 
 
 		 230 aa  51.2  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0493125  normal  0.261942 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3300  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 214 aa  51.6  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.513465  hitchhiker  0.00580905 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1048  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 232 aa  51.6  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0498897  normal  0.620598 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2497  putative transcriptional regulator, GntR family  35.4 
 
 		 315 aa  51.6  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.182047 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0408  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 		 212 aa  51.2  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4098  TetR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 315 aa  50.8  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4188  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 256 aa  51.2  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1370  transcriptional regulator, TetR family  32.11 
 
 		 223 aa  50.8  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.705116 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3268  putative transcriptional regulator, GntR family  25 
 
 		 293 aa  50.8  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3346  regulatory protein, TetR  33.33 
 
 		 262 aa  50.1  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.213794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8044  putative transcriptional regulator, TetR family  26.53 
 
 		 249 aa  50.4  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.467604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0897  transcriptional regulator, TetR family  36 
 
 		 265 aa  50.1  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00320  transcriptional regulator, tetR family  28.97 
 
 		 256 aa  49.3  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.48619  normal  0.068604 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3174  TetR family transcriptional regulator  23.93 
 
 		 230 aa  49.3  0.00006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0201096  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0042  TetR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 219 aa  49.3  0.00006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.664551  normal  0.814156 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3270  transcriptional regulator, TetR family  28.1 
 
 		 225 aa  49.3  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.8331  normal  0.0947304 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0410  TetR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 245 aa  48.9  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.560758  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5652  transcriptional regulator, TetR family  31.09 
 
 		 283 aa  49.3  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3639  transcriptional regulator, TetR family  24.17 
 
 		 234 aa  48.9  0.00008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7217  putative transcriptional regulator, TetR family  27.16 
 
 		 247 aa  48.9  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.466124  normal  0.580256 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4362  regulatory protein, TetR  30.97 
 
 		 256 aa  48.9  0.00009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0036  putative transcriptional regulator, TetR family  28.17 
 
 		 234 aa  48.9  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.940738 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4181  TetR family transcriptional regulator  27 
 
 		 240 aa  48.5  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.367396  normal  0.615524 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0104  TetR family transcriptional regulator  31 
 
 		 207 aa  48.1  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000192911 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3932  putative transcriptional regulator, TetR family  25.34 
 
 		 228 aa  48.1  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199219  normal  0.0173794 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6464  putative transcriptional regulator, TetR family  25.3 
 
 		 245 aa  48.5  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0682753 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5556  transcriptional regulator, GntR family  27.95 
 
 		 311 aa  47.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3353  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 190 aa  47.8  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.5987 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2481  TetR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 231 aa  47.8  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3892  transcriptional regulator, TetR family  26.95 
 
 		 211 aa  47.8  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2572  transcriptional regulator, TetR family  37.63 
 
 		 239 aa  47.4  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.314261  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2273  transcriptional regulator, TetR family  24.89 
 
 		 224 aa  47.4  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1243  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 229 aa  47  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.176443 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4891  transcriptional regulator, TetR family  30.26 
 
 		 261 aa  47  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.164408  normal  0.287477 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2480  transcriptional regulator, TetR family  28.38 
 
 		 221 aa  47  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0883171  normal  0.233137 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1711  regulatory protein TetR  25.63 
 
 		 226 aa  47  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.539832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4763  transcriptional regulator, TetR family  29.17 
 
 		 252 aa  47  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0000323039  decreased coverage  0.0000700922 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5425  putative transcriptional regulator, TetR family  32.63 
 
 		 272 aa  46.6  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3344  hypothetical protein  25.77 
 
 		 236 aa  46.2  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4140  transcriptional regulator, TetR family  26.09 
 
 		 240 aa  46.2  0.0005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0040  transcriptional regulator, TetR family  34.29 
 
 		 195 aa  46.2  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1602  transcriptional regulator  22.22 
 
 		 208 aa  46.2  0.0006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0331088  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1496  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 190 aa  45.4  0.0008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000100434  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1694  transcriptional regulator, TetR family  24.72 
 
 		 252 aa  45.4  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.239761 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2792  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 190 aa  45.4  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.782155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5853  transcriptional regulator, TetR family  25.42 
 
 		 258 aa  45.8  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.389129  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3884  transcriptional regulator, TetR family  30.93 
 
 		 304 aa  45.4  0.0008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.162563 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7234  putative transcriptional regulator, TetR family  24.23 
 
 		 249 aa  45.4  0.0009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2249  TetR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 227 aa  45.4  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.111246  normal  0.0445772 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3085  regulatory protein, TetR  23.4 
 
 		 223 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.355286  normal  0.26404 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1669  transcriptional regulator, TetR family  30.34 
 
 		 255 aa  45.4  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.269764  normal  0.168881 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2357  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 218 aa  45.1  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5480  TetR family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 199 aa  45.4  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.191465 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0555  transcriptional regulator BetI  34.12 
 
 		 201 aa  44.7  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4132  transcriptional regulator, TetR family  38.18 
 
 		 192 aa  44.7  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.88155  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4889  TetR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 246 aa  45.4  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0119  TetR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 201 aa  45.1  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.00000000566826  decreased coverage  0.00000000000241144 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3630  transcriptional regulator, TetR family  35.06 
 
 		 203 aa  45.4  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0460373 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1770  TetR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 250 aa  44.3  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0040  TetR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 211 aa  43.9  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.970085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1817  TetR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 250 aa  44.3  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.882667 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1751  TetR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 250 aa  44.3  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0565  transcriptional regulator BetI  37.74 
 
 		 202 aa  44.7  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.359685 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1254  TetR family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 223 aa  43.9  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.297921  normal  0.284076 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3568  TetR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 253 aa  43.9  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6218  TetR family transcriptional regulator  23.21 
 
 		 278 aa  43.9  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.480822 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0716  transcriptional regulator, TetR family  30.34 
 
 		 231 aa  44.3  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0221174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8685  Tetracyclin repressor domain protein  33.78 
 
 		 228 aa  44.3  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0279  transcriptional regulator, TetR family  32.38 
 
 		 268 aa  43.9  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2218  regulatory protein TetR  25.64 
 
 		 216 aa  44.7  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0300216  normal  0.292037 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>