39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3783 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_3783  putative TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 292 aa  597  1e-170  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3105  TetR family transcriptional regulator  40.23 
 
 		 260 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3718  transcriptional regulator, TetR family  25.23 
 
 		 223 aa  64.3  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000868131  normal  0.31083 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0522  transcriptional regulator, TetR family  25.62 
 
 		 259 aa  57.4  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0445084 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4913  TetR family transcriptional regulator  24.37 
 
 		 222 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.763615  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5002  TetR family transcriptional regulator  24.37 
 
 		 222 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.827142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5281  TetR family transcriptional regulator  24.37 
 
 		 222 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7747  putative transcriptional regulator  25 
 
 		 342 aa  53.9  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.117612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6218  TetR family transcriptional regulator  23.77 
 
 		 278 aa  53.5  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.480822 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0638  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 250 aa  53.1  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2572  transcriptional regulator, TetR family  23.11 
 
 		 239 aa  52.8  0.000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.314261  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4294  transcriptional regulator, GntR family  26.26 
 
 		 343 aa  51.2  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.806766 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2596  TetR family transcriptional regulator  23.6 
 
 		 257 aa  51.6  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.476942 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1989  TetR family transcriptional regulator  22.87 
 
 		 250 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1139  TetR family transcriptional regulator  25.23 
 
 		 220 aa  50.1  0.00005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0501486 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0664  TetR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 235 aa  48.9  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.773977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0040  TetR family transcriptional regulator  23.93 
 
 		 211 aa  48.9  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.970085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8044  putative transcriptional regulator, TetR family  22.16 
 
 		 249 aa  48.1  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.467604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5582  transcriptional regulator, TetR family  23.31 
 
 		 250 aa  47  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4355  TetR family transcriptional regulator  21.24 
 
 		 244 aa  46.2  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.589486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6498  transcriptional regulator, TetR family  21.69 
 
 		 246 aa  46.2  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2204  regulatory protein, TetR  29.63 
 
 		 235 aa  45.8  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0017  transcriptional regulator, TetR family  21.66 
 
 		 224 aa  45.8  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3639  transcriptional regulator, TetR family  20.91 
 
 		 234 aa  45.1  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0716  transcriptional regulator, TetR family  22.91 
 
 		 231 aa  44.3  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0221174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4689  transcriptional regulator, TetR family  22.79 
 
 		 259 aa  44.3  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3174  TetR family transcriptional regulator  21.46 
 
 		 230 aa  44.3  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0201096  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1945  putative transcriptional regulator, TetR family  27.68 
 
 		 268 aa  44.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.951149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0626  TetR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 199 aa  44.7  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2997  transcriptional regulator, TetR family  29.17 
 
 		 239 aa  44.3  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00034517  decreased coverage  0.000048455 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4596  regulatory protein TetR  32.81 
 
 		 196 aa  43.9  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1460  transcriptional regulator, TetR family  31.13 
 
 		 249 aa  44.3  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2481  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 231 aa  43.1  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2708  transcriptional regulator BetI  30.59 
 
 		 194 aa  43.5  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4446  hypothetical protein  28.07 
 
 		 229 aa  43.1  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.25718 
 
 
-
 
NC_004310  BR0554  transcriptional regulator BetI  32.31 
 
 		 198 aa  42.7  0.008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0555  transcriptional regulator BetI  32.31 
 
 		 201 aa  42.4  0.008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11383  transcriptional regulator  25 
 
 		 261 aa  42.4  0.009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.900966 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4960  TetR family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 230 aa  42.4  0.01  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0493125  normal  0.261942 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>