47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_5002 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_4913  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 222 aa  436  1e-121  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.763615  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5281  TetR family transcriptional regulator  99.55 
 
 		 222 aa  436  1e-121  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5002  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 222 aa  436  1e-121  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.827142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3783  putative TetR family transcriptional regulator  23 
 
 		 292 aa  53.5  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2357  transcriptional regulator, TetR family  30.41 
 
 		 218 aa  52.8  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2052  putative transcriptional regulator, TetR family  31.22 
 
 		 241 aa  52.8  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.654374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3954  transcriptional regulator, TetR family  42.05 
 
 		 183 aa  52.4  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00776564  normal  0.0886939 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3892  transcriptional regulator, TetR family  35.05 
 
 		 211 aa  50.8  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8044  putative transcriptional regulator, TetR family  28.66 
 
 		 249 aa  50.1  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.467604  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2572  transcriptional regulator, TetR family  30.45 
 
 		 239 aa  48.5  0.00008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.314261  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8156  putative transcriptional regulator, TetR family  33.12 
 
 		 272 aa  48.5  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3718  transcriptional regulator, TetR family  30.46 
 
 		 223 aa  48.5  0.00008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000868131  normal  0.31083 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19280  transcriptional regulator  36.47 
 
 		 235 aa  48.5  0.00009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.28299  normal  0.286722 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0819  transcriptional regulator, TetR family  36.59 
 
 		 237 aa  47.8  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4284  transcriptional regulator, TetR family  32.89 
 
 		 223 aa  47.4  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.620259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8893  transcriptional regulator, TetR family  29.14 
 
 		 272 aa  47.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3414  TetR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 226 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0624049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3639  transcriptional regulator, TetR family  27.75 
 
 		 234 aa  46.2  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1828  regulatory protein TetR  40 
 
 		 207 aa  45.8  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.790266  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1898  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 225 aa  45.4  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00182667  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3202  TetR family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 250 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.437074 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3167  TetR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 236 aa  45.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0319866  normal  0.111754 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3152  TetR family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 250 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.840022 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3140  TetR family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 250 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.852276  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0437  TetR family transcriptional regulator  27.39 
 
 		 239 aa  44.3  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0684  TetR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 213 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.974708 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1631  transcriptional regulator  38.46 
 
 		 190 aa  44.3  0.002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0987628 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5480  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 199 aa  43.5  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.191465 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1662  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 213 aa  43.1  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.552653  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2597  hypothetical protein  28.18 
 
 		 222 aa  42.7  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.323808  normal  0.0340242 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2902  TetR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 217 aa  42.4  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2858  TetR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 217 aa  42.4  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2727  transcriptional regulator, TetR family  26.54 
 
 		 264 aa  42.4  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0135  transcriptional regulator, TetR family  37.88 
 
 		 217 aa  42.4  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0251  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 202 aa  42  0.007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6545  TetR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 227 aa  42  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.129926 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3578  TetR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 198 aa  42  0.007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00935563  normal  0.0256006 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3471  hypothetical protein  36.84 
 
 		 236 aa  42  0.007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00958807 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1669  transcriptional regulator, TetR family  36.96 
 
 		 255 aa  42  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.269764  normal  0.168881 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3670  hypothetical protein  36.84 
 
 		 236 aa  42  0.008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3932  putative transcriptional regulator, TetR family  29.74 
 
 		 228 aa  41.6  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199219  normal  0.0173794 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0039  transcriptional regulator  33.79 
 
 		 233 aa  41.6  0.009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5697  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 227 aa  41.6  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.949992  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 231 aa  41.6  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1491  TetR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 232 aa  41.6  0.01  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.784951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6061  TetR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 191 aa  41.6  0.01  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.660328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1997  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 250 aa  41.6  0.01  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.354177  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>