293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4689 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_4689  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 259 aa  509  1e-143  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0522  transcriptional regulator, TetR family  52.68 
 
 		 259 aa  212  3.9999999999999995e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0445084 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3174  TetR family transcriptional regulator  40.45 
 
 		 230 aa  134  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0201096  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3639  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 234 aa  132  3.9999999999999996e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1498  TetR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 244 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1498  TetR family transcriptional regulator  34.4 
 
 		 244 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.98693  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1521  TetR family transcriptional regulator  34.4 
 
 		 244 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.290905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1898  transcriptional regulator, TetR family  34.48 
 
 		 225 aa  110  3e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00182667  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3927  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 218 aa  105  6e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1945  putative transcriptional regulator, TetR family  32.28 
 
 		 268 aa  99.8  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.951149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3718  transcriptional regulator, TetR family  32.74 
 
 		 223 aa  93.6  3e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000868131  normal  0.31083 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6521  putative transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 210 aa  91.7  9e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.177383 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1690  transcriptional regulator, TetR family  32.59 
 
 		 222 aa  90.9  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.072365  hitchhiker  0.0000000604778 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4938  regulatory protein, TetR  33.54 
 
 		 222 aa  86.7  4e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0214473 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2273  transcriptional regulator, TetR family  36.02 
 
 		 224 aa  86.3  5e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4098  TetR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 315 aa  85.1  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2211  transcriptional regulator, TetR family  35.8 
 
 		 211 aa  84.7  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0638  TetR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 250 aa  84.3  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0437  TetR family transcriptional regulator  29.54 
 
 		 239 aa  84.3  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3932  putative transcriptional regulator, TetR family  32.33 
 
 		 228 aa  83.6  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199219  normal  0.0173794 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4140  transcriptional regulator, TetR family  30.38 
 
 		 240 aa  83.2  0.000000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0664  TetR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 235 aa  81.6  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.773977  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1704  transcriptional regulator, TetR family  38.04 
 
 		 204 aa  80.5  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.326361  normal  0.417933 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4050  transcriptional regulator, TetR family  29.82 
 
 		 221 aa  80.1  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0170602 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4458  transcriptional regulator, TetR family  32.07 
 
 		 263 aa  79.3  0.00000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0794126 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1048  transcriptional regulator, TetR family  31.67 
 
 		 232 aa  78.2  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0498897  normal  0.620598 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8893  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 272 aa  76.6  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1243  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 229 aa  76.6  0.0000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.176443 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1702  regulatory protein TetR  35.19 
 
 		 199 aa  75.5  0.0000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2357  transcriptional regulator, TetR family  35.4 
 
 		 218 aa  75.1  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0215  transcriptional regulator, TetR family  31.43 
 
 		 246 aa  75.1  0.000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.674801 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2480  transcriptional regulator, TetR family  31.94 
 
 		 221 aa  75.1  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0883171  normal  0.233137 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2420  regulatory protein TetR  33.96 
 
 		 190 aa  72.4  0.000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000385349  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8156  putative transcriptional regulator, TetR family  38.14 
 
 		 272 aa  72.4  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0017  transcriptional regulator, TetR family  30.13 
 
 		 224 aa  71.6  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3954  transcriptional regulator, TetR family  33.15 
 
 		 183 aa  72  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00776564  normal  0.0886939 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2637  putative transcriptional regulator, TetR family  30.67 
 
 		 220 aa  71.6  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000568428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1315  TetR family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 255 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.156581 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2572  transcriptional regulator, TetR family  33.13 
 
 		 239 aa  70.1  0.00000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.314261  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1370  transcriptional regulator, TetR family  31 
 
 		 223 aa  70.5  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.705116 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4012  TetR family transcriptional regulator  38.68 
 
 		 195 aa  70.5  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00441742  normal  0.139253 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0104  TetR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 207 aa  70.1  0.00000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000192911 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9231  tetR-family regulatory protein  25.83 
 
 		 247 aa  69.7  0.00000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.484933  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7832  transcriptional regulator, TetR family  29.94 
 
 		 253 aa  69.3  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0353896 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2646  transcriptional regulator, TetR family  30.54 
 
 		 236 aa  68.9  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00299352  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1495  TetR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 200 aa  68.9  0.00000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.969103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1404  hypothetical protein  30.73 
 
 		 227 aa  68.6  0.00000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.245587  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7217  putative transcriptional regulator, TetR family  32.53 
 
 		 247 aa  68.6  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.466124  normal  0.580256 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4082  transcriptional regulator, TetR family  28.78 
 
 		 343 aa  67.8  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.63573 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2378  transcriptional repressor TetR  26.79 
 
 		 260 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0287531  normal  0.0684522 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2797  TetR family transcriptional regulator  29.18 
 
 		 242 aa  67.4  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139894  normal  0.287212 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5957  transcriptional regulator, TetR family  28.83 
 
 		 229 aa  66.6  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.769485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2052  putative transcriptional regulator, TetR family  36.14 
 
 		 241 aa  66.6  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.654374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1050  TetR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 238 aa  66.6  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.361662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3083  regulatory protein TetR  33.76 
 
 		 248 aa  66.6  0.0000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.143154  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5576  transcriptional regulator, TetR family  31.33 
 
 		 234 aa  65.9  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5716  transcriptional regulator, TetR family  33.77 
 
 		 255 aa  65.9  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.831325 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4845  putative transcriptional regulator, TetR family  29 
 
 		 230 aa  65.9  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2683  TetR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 218 aa  65.9  0.0000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3980  TetR family transcriptional regulator  38.52 
 
 		 268 aa  65.5  0.0000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7234  putative transcriptional regulator, TetR family  27.44 
 
 		 249 aa  65.5  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3892  transcriptional regulator, TetR family  31.33 
 
 		 211 aa  65.5  0.0000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2337  transcriptional regulator, TetR family  31.65 
 
 		 218 aa  65.1  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2916  TetR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 216 aa  65.1  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0252  transcriptional regulator, TetR family  34.48 
 
 		 221 aa  64.3  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1669  transcriptional regulator, TetR family  32.93 
 
 		 255 aa  63.9  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.269764  normal  0.168881 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3300  transcriptional regulator, TetR family  34.81 
 
 		 214 aa  63.9  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.513465  hitchhiker  0.00580905 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3395  transcriptional regulator, TetR family  40.82 
 
 		 173 aa  63.9  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.542573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6164  TetR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 285 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.406893 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0730  TetR family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 242 aa  64.3  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00296779  normal  0.0851548 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0819  transcriptional regulator, TetR family  30.09 
 
 		 237 aa  63.9  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5582  transcriptional regulator, TetR family  29.2 
 
 		 250 aa  63.5  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5652  transcriptional regulator, TetR family  31.93 
 
 		 283 aa  63.5  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1017  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 216 aa  63.5  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.056125 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4181  TetR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 240 aa  62.8  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.367396  normal  0.615524 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0040  TetR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 211 aa  62.8  0.000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.970085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3544  transcriptional regulator, TetR family  30.37 
 
 		 258 aa  62.8  0.000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.164716  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7747  putative transcriptional regulator  36.15 
 
 		 342 aa  62.4  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.117612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2911  TetR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 248 aa  62.4  0.000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.109038 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5933  regulatory protein TetR  34.32 
 
 		 250 aa  62  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.164219 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3007  transcriptional regulator, TetR family  33.73 
 
 		 239 aa  62  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0040024 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2585  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 218 aa  61.6  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.106012  normal  0.0213025 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4284  transcriptional regulator, TetR family  31.48 
 
 		 223 aa  62  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.620259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4216  putative transcriptional regulator, TetR family  36.67 
 
 		 212 aa  61.2  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00833872  hitchhiker  0.000365538 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0628  transcriptional regulator, TetR family  35.42 
 
 		 218 aa  60.5  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.504351 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21360  transcriptional regulator, TetR family  32.4 
 
 		 206 aa  60.8  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.127836  normal  0.357603 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8044  putative transcriptional regulator, TetR family  28 
 
 		 249 aa  59.7  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.467604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0408  transcriptional regulator, TetR family  35.14 
 
 		 212 aa  60.1  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1551  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 225 aa  59.3  0.00000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.209171  normal  0.107881 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3445  transcriptional regulator, TetR family  31.49 
 
 		 230 aa  59.3  0.00000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4687  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 259 aa  59.3  0.00000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.717984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2497  putative transcriptional regulator, GntR family  37.4 
 
 		 315 aa  59.3  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.182047 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6418  transcriptional regulator, TetR family  25.69 
 
 		 259 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4066  putative transcriptional regulator, TetR family  33.88 
 
 		 253 aa  59.3  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.546263  normal  0.272387 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0039  transcriptional regulator  28.65 
 
 		 233 aa  58.9  0.00000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1677  transcriptional regulator, TetR family  30.3 
 
 		 218 aa  58.9  0.00000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00000521041  normal  0.168881 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2404  transcriptional regulator, TetR family  25.66 
 
 		 247 aa  58.5  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0783886 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00320  transcriptional regulator, tetR family  35.51 
 
 		 256 aa  58.2  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.48619  normal  0.068604 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1040  regulatory protein TetR  30.05 
 
 		 219 aa  58.5  0.0000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.591621  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0578  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 267 aa  58.2  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>