220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4012 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_4012  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 195 aa  381  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00441742  normal  0.139253 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1702  regulatory protein TetR  66.5 
 
 		 199 aa  223  1e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2420  regulatory protein TetR  45.45 
 
 		 190 aa  135  5e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000385349  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1404  hypothetical protein  39.15 
 
 		 227 aa  103  2e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.245587  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2574  transcriptional regulator, TetR family  39.42 
 
 		 203 aa  101  5e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0758263 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3927  transcriptional regulator, TetR family  39.26 
 
 		 218 aa  90.9  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4689  transcriptional regulator, TetR family  33.92 
 
 		 259 aa  81.6  0.000000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1898  transcriptional regulator, TetR family  27.94 
 
 		 225 aa  81.6  0.000000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00182667  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3932  putative transcriptional regulator, TetR family  35.12 
 
 		 228 aa  79.7  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199219  normal  0.0173794 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2357  transcriptional regulator, TetR family  33.13 
 
 		 218 aa  78.6  0.00000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0104  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 207 aa  78.6  0.00000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000192911 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5716  transcriptional regulator, TetR family  33.03 
 
 		 255 aa  74.3  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.831325 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4938  regulatory protein, TetR  30.48 
 
 		 222 aa  72.8  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0214473 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1704  transcriptional regulator, TetR family  39 
 
 		 204 aa  69.7  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.326361  normal  0.417933 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1945  putative transcriptional regulator, TetR family  35.06 
 
 		 268 aa  68.9  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.951149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3639  transcriptional regulator, TetR family  32.47 
 
 		 234 aa  68.6  0.00000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6521  putative transcriptional regulator, TetR family  28.23 
 
 		 210 aa  67.4  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.177383 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3300  transcriptional regulator, TetR family  36.18 
 
 		 214 aa  67.8  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.513465  hitchhiker  0.00580905 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2273  transcriptional regulator, TetR family  30.95 
 
 		 224 aa  67  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3892  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 211 aa  66.6  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4050  transcriptional regulator, TetR family  33.81 
 
 		 221 aa  65.9  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0170602 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1119  transcriptional regulator, TetR family  34.76 
 
 		 211 aa  65.9  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.335801 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3544  transcriptional regulator, TetR family  34.23 
 
 		 258 aa  65.5  0.0000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.164716  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1690  transcriptional regulator, TetR family  32.65 
 
 		 222 aa  65.5  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.072365  hitchhiker  0.0000000604778 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1048  transcriptional regulator, TetR family  31.46 
 
 		 232 aa  65.1  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0498897  normal  0.620598 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1460  transcriptional regulator, TetR family  33.55 
 
 		 249 aa  65.1  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1254  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 223 aa  64.7  0.0000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.297921  normal  0.284076 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0801  transcriptional regulator, TetR family  28.92 
 
 		 226 aa  64.3  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1997  TetR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 250 aa  63.2  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.354177  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5576  transcriptional regulator, TetR family  29.9 
 
 		 234 aa  63.2  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2916  TetR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 216 aa  63.2  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0408  transcriptional regulator, TetR family  41.94 
 
 		 212 aa  62.8  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0522  transcriptional regulator, TetR family  30.36 
 
 		 259 aa  63.2  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0445084 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3174  TetR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 230 aa  62.4  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0201096  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3718  transcriptional regulator, TetR family  32.19 
 
 		 223 aa  62.4  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000868131  normal  0.31083 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2404  transcriptional regulator, TetR family  30.63 
 
 		 247 aa  62.4  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0783886 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2572  transcriptional regulator, TetR family  31.43 
 
 		 239 aa  62.4  0.000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.314261  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1243  TetR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 229 aa  62  0.000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.176443 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0819  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 237 aa  61.6  0.000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0215  transcriptional regulator, TetR family  33.04 
 
 		 246 aa  61.6  0.000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.674801 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4140  transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 240 aa  61.6  0.000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4845  putative transcriptional regulator, TetR family  34.87 
 
 		 230 aa  61.6  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0730  TetR family transcriptional regulator  36.29 
 
 		 242 aa  61.6  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00296779  normal  0.0851548 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0039  transcriptional regulator, TetR family  28.5 
 
 		 202 aa  61.2  0.000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3083  regulatory protein TetR  27.91 
 
 		 248 aa  60.5  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.143154  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4216  putative transcriptional regulator, TetR family  30.65 
 
 		 212 aa  61.2  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00833872  hitchhiker  0.000365538 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7217  putative transcriptional regulator, TetR family  29.22 
 
 		 247 aa  59.7  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.466124  normal  0.580256 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2211  transcriptional regulator, TetR family  30.65 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2683  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 218 aa  60.5  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3007  transcriptional regulator, TetR family  33.82 
 
 		 239 aa  60.1  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0040024 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5652  transcriptional regulator, TetR family  26.96 
 
 		 283 aa  60.5  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2637  putative transcriptional regulator, TetR family  31.31 
 
 		 220 aa  59.3  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000568428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7234  putative transcriptional regulator, TetR family  32.28 
 
 		 249 aa  58.9  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1930  TetR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 206 aa  58.5  0.00000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.189169  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4137  putative transcriptional regulator, TetR family  29.01 
 
 		 263 aa  58.5  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0181128  normal  0.0240758 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5957  transcriptional regulator, TetR family  31.48 
 
 		 229 aa  58.2  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.769485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3980  TetR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 268 aa  58.2  0.00000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0040  TetR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 211 aa  58.2  0.00000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.970085  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2797  TetR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 242 aa  58.2  0.00000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139894  normal  0.287212 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3346  regulatory protein, TetR  33.04 
 
 		 262 aa  58.2  0.00000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.213794  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1370  transcriptional regulator, TetR family  35.54 
 
 		 223 aa  58.2  0.00000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.705116 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4181  TetR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 240 aa  57.8  0.00000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.367396  normal  0.615524 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1017  TetR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 216 aa  57.4  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.056125 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5425  putative transcriptional regulator, TetR family  27.4 
 
 		 272 aa  57.4  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4066  putative transcriptional regulator, TetR family  29.01 
 
 		 253 aa  57.4  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.546263  normal  0.272387 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9231  tetR-family regulatory protein  30.77 
 
 		 247 aa  57.8  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.484933  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0437  TetR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 239 aa  57  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0017  transcriptional regulator, TetR family  31.07 
 
 		 224 aa  57  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3400  transcriptional regulator, TetR family  37.04 
 
 		 248 aa  56.6  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.160802  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4188  transcriptional regulator, TetR family  29.22 
 
 		 256 aa  56.6  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3552  regulatory protein TetR  30.29 
 
 		 235 aa  56.6  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3270  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 225 aa  57  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.8331  normal  0.0947304 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4294  transcriptional regulator, GntR family  36.46 
 
 		 343 aa  56.6  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.806766 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1498  TetR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 244 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.98693  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1521  TetR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 244 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.290905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1498  TetR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 244 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24780  transcriptional regulator, tetR family  29.47 
 
 		 220 aa  56.2  0.0000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8044  putative transcriptional regulator, TetR family  32.24 
 
 		 249 aa  55.8  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.467604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0716  transcriptional regulator, TetR family  27.81 
 
 		 231 aa  55.8  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0221174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8156  putative transcriptional regulator, TetR family  27.22 
 
 		 272 aa  55.8  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1315  TetR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 255 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.156581 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2480  transcriptional regulator, TetR family  33.54 
 
 		 221 aa  55.5  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0883171  normal  0.233137 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2560  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 272 aa  55.1  0.0000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.283011  normal  0.208167 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1050  TetR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 238 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.361662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0056  transcriptional regulator, TetR family  38.32 
 
 		 289 aa  54.3  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7060  tetracycline repressor domain-containing protein  32.84 
 
 		 203 aa  53.9  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0598818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3954  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 183 aa  54.3  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00776564  normal  0.0886939 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4730  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 182 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3530  transcriptional regulator, TetR family  27.98 
 
 		 267 aa  53.9  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0209016  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04290  transcriptional regulator  32.58 
 
 		 230 aa  53.5  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0356089  normal  0.115644 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0832  Tetracyclin repressor domain protein  29.73 
 
 		 204 aa  53.5  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0638  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 250 aa  53.1  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10210  transcriptional regulator  26.01 
 
 		 272 aa  53.1  0.000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.472309  normal  0.0650558 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2646  transcriptional regulator, TetR family  27.4 
 
 		 236 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00299352  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3851  TetR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 210 aa  52.8  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.197556  normal  0.870182 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1662  transcriptional regulator, TetR family  32.89 
 
 		 213 aa  52.4  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.552653  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0240  TetR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 281 aa  52.4  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.679484 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1965  transcriptional regulator, TetR family  29.06 
 
 		 234 aa  52.8  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.66981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1167  regulatory protein, TetR  39.8 
 
 		 227 aa  52.4  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2285  transcriptional regulator, TetR family  30.68 
 
 		 213 aa  52.4  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>