291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4284 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_4284  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 
223 aa  442  1e-123  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.620259  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1945  putative transcriptional regulator, TetR family  36.68 
 
 
268 aa  121  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.951149  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4140  transcriptional regulator, TetR family  33.18 
 
 
240 aa  115  5e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5576  transcriptional regulator, TetR family  33.19 
 
 
234 aa  109  4.0000000000000004e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7234  putative transcriptional regulator, TetR family  38.22 
 
 
249 aa  96.7  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5582  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 
250 aa  93.2  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8893  transcriptional regulator, TetR family  32.47 
 
 
272 aa  91.7  8e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0683  transcriptional regulator, TetR family  31.43 
 
 
233 aa  88.2  9e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.124954 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0716  transcriptional regulator, TetR family  30.54 
 
 
231 aa  87  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0221174  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4845  putative transcriptional regulator, TetR family  37.8 
 
 
230 aa  85.5  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1243  TetR family transcriptional regulator  33.73 
 
 
229 aa  82.8  0.000000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.176443 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2596  TetR family transcriptional regulator  30.14 
 
 
257 aa  82.4  0.000000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.476942 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0252  transcriptional regulator, TetR family  37.04 
 
 
221 aa  82  0.000000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0744  TetR family transcriptional regulator  32.89 
 
 
224 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0222814 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9231  tetR-family regulatory protein  30.97 
 
 
247 aa  79.7  0.00000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.484933  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0730  TetR family transcriptional regulator  35.4 
 
 
242 aa  79  0.00000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00296779  normal  0.0851548 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8156  putative transcriptional regulator, TetR family  35.97 
 
 
272 aa  77.8  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0801  transcriptional regulator, TetR family  32.87 
 
 
226 aa  76.6  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8044  putative transcriptional regulator, TetR family  35.63 
 
 
249 aa  76.3  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.467604  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5716  transcriptional regulator, TetR family  33.54 
 
 
255 aa  75.9  0.0000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.831325 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2273  transcriptional regulator, TetR family  39.58 
 
 
224 aa  74.7  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1690  transcriptional regulator, TetR family  37.24 
 
 
222 aa  73.2  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.072365  hitchhiker  0.0000000604778 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5425  putative transcriptional regulator, TetR family  42.37 
 
 
272 aa  73.2  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6464  putative transcriptional regulator, TetR family  38.71 
 
 
245 aa  72.8  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0682753 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2637  putative transcriptional regulator, TetR family  29.82 
 
 
220 aa  72.4  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000568428  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4098  TetR family transcriptional regulator  33.93 
 
 
315 aa  71.6  0.000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2840  transcriptional regulator, TetR family  32.33 
 
 
238 aa  71.2  0.00000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0017  transcriptional regulator, TetR family  35.65 
 
 
224 aa  70.9  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4066  putative transcriptional regulator, TetR family  32.93 
 
 
253 aa  70.5  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.546263  normal  0.272387 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4082  transcriptional regulator, TetR family  35.42 
 
 
343 aa  69.7  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.63573 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7747  putative transcriptional regulator  36.59 
 
 
342 aa  70.1  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.117612  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1499  TetR family transcriptional regulator  31.28 
 
 
271 aa  70.1  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.148288  normal  0.740937 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2797  TetR family transcriptional regulator  33.97 
 
 
242 aa  69.3  0.00000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139894  normal  0.287212 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6164  TetR family transcriptional regulator  37.39 
 
 
285 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.406893 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7832  transcriptional regulator, TetR family  37.01 
 
 
253 aa  68.9  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0353896 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4137  putative transcriptional regulator, TetR family  35.38 
 
 
263 aa  68.9  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0181128  normal  0.0240758 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2497  putative transcriptional regulator, GntR family  38.71 
 
 
315 aa  68.9  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.182047 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4687  transcriptional regulator, TetR family  39.47 
 
 
259 aa  68.6  0.00000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.717984  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1048  transcriptional regulator, TetR family  31.32 
 
 
232 aa  68.2  0.00000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0498897  normal  0.620598 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5652  transcriptional regulator, TetR family  36.57 
 
 
283 aa  67.4  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2911  TetR family transcriptional regulator  33.61 
 
 
248 aa  68.2  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.109038 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6521  putative transcriptional regulator, TetR family  34.04 
 
 
210 aa  67.8  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.177383 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3300  transcriptional regulator, TetR family  40.74 
 
 
214 aa  68.2  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.513465  hitchhiker  0.00580905 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0036  putative transcriptional regulator, TetR family  29.81 
 
 
234 aa  67.8  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.940738 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4050  transcriptional regulator, TetR family  27.4 
 
 
221 aa  68.2  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0170602 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19920  transcriptional regulator, tetR family  34.16 
 
 
207 aa  67.8  0.0000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.314765  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1704  transcriptional regulator, TetR family  37.62 
 
 
204 aa  68.2  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.326361  normal  0.417933 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3927  transcriptional regulator, TetR family  28.29 
 
 
218 aa  68.2  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69466  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0638  TetR family transcriptional regulator  28.9 
 
 
250 aa  67  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4294  transcriptional regulator, GntR family  39.42 
 
 
343 aa  67.4  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.806766 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3083  regulatory protein TetR  25.28 
 
 
248 aa  67.4  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.143154  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17850  transcriptional regulator, tetR family  36.23 
 
 
173 aa  67  0.0000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.760857 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2879  regulatory protein TetR  30.67 
 
 
226 aa  66.6  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3892  transcriptional regulator, TetR family  29.53 
 
 
211 aa  66.6  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5957  transcriptional regulator, TetR family  28.02 
 
 
229 aa  66.2  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.769485  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4781  transcriptional regulator, TetR family  35.54 
 
 
228 aa  65.9  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.809331  hitchhiker  0.00725959 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3884  transcriptional regulator, TetR family  28.16 
 
 
304 aa  65.9  0.0000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.162563 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4458  transcriptional regulator, TetR family  29.77 
 
 
263 aa  65.9  0.0000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0794126 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2357  transcriptional regulator, TetR family  32.56 
 
 
218 aa  65.5  0.0000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2285  transcriptional regulator, TetR family  30.99 
 
 
213 aa  65.1  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0437  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
239 aa  65.1  0.0000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1898  transcriptional regulator, TetR family  28.71 
 
 
225 aa  64.7  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00182667  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3007  transcriptional regulator, TetR family  31.13 
 
 
239 aa  64.7  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0040024 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1997  TetR family transcriptional regulator  40.57 
 
 
250 aa  63.9  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.354177  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21360  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 
206 aa  63.5  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.127836  normal  0.357603 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3718  transcriptional regulator, TetR family  31.08 
 
 
223 aa  63.5  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000868131  normal  0.31083 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3568  TetR family transcriptional regulator  36.92 
 
 
253 aa  64.3  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3932  putative transcriptional regulator, TetR family  39.22 
 
 
228 aa  63.2  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199219  normal  0.0173794 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1527  transcriptional regulator, TetR family  36.89 
 
 
263 aa  63.5  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.413191  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2060  transcriptional regulator, TetR family  33.88 
 
 
266 aa  63.2  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.582496  normal  0.158127 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4689  transcriptional regulator, TetR family  30.86 
 
 
259 aa  62.8  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5853  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 
258 aa  62.8  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.389129  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0279  transcriptional regulator, TetR family  28.4 
 
 
268 aa  62.8  0.000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5105  transcriptional regulator, TetR family  30.28 
 
 
223 aa  62.4  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000423081  normal  0.55194 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2211  transcriptional regulator, TetR family  36.8 
 
 
211 aa  62  0.000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4456  transcriptional regulator, TetR family  34.96 
 
 
258 aa  62  0.000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.162192 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3400  transcriptional regulator, TetR family  35.37 
 
 
248 aa  61.6  0.000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.160802  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1711  regulatory protein TetR  35.24 
 
 
226 aa  61.6  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.539832  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0664  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 
235 aa  61.6  0.000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.773977  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0683  TetR family transcriptional regulator  37.86 
 
 
211 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1632  Tetracyclin repressor domain protein  34.46 
 
 
207 aa  61.2  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.0188717 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26640  transcriptional regulator, tetR family  36.36 
 
 
215 aa  60.8  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.062936  normal  0.0737104 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3980  TetR family transcriptional regulator  29.08 
 
 
268 aa  61.2  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3462  regulatory protein TetR  30.49 
 
 
221 aa  61.2  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0249959  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0408  transcriptional regulator, TetR family  40.86 
 
 
212 aa  61.6  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3348  TetR family transcriptional regulator  30.57 
 
 
185 aa  61.6  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3340  transcriptional regulator, TetR family  30.32 
 
 
227 aa  61.2  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1965  transcriptional regulator, TetR family  33.61 
 
 
234 aa  60.5  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.66981  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1050  TetR family transcriptional regulator  28.63 
 
 
238 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.361662  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2052  putative transcriptional regulator, TetR family  31.36 
 
 
241 aa  60.5  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.654374  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3817  transcriptional regulator, TetR family  31.53 
 
 
223 aa  60.5  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.131002  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6498  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 
246 aa  59.7  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0658  TetR family transcriptional regulator  36.89 
 
 
211 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6384  putative transcriptional regulator, TetR family  29.57 
 
 
224 aa  59.7  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.317451  normal  0.404992 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3530  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 
267 aa  59.7  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0209016  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3346  regulatory protein, TetR  33.59 
 
 
262 aa  59.7  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.213794  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6279  transcriptional regulator, TetR family  33.04 
 
 
235 aa  59.3  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.993212 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00320  transcriptional regulator, tetR family  26.5 
 
 
256 aa  59.3  0.00000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.48619  normal  0.068604 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1669  transcriptional regulator, TetR family  31.72 
 
 
255 aa  59.3  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.269764  normal  0.168881 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4216  putative transcriptional regulator, TetR family  33.61 
 
 
212 aa  58.9  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00833872  hitchhiker  0.000365538 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>