69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_17850 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_17850  transcriptional regulator, tetR family  100 
 
 		 173 aa  343  5e-94  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.760857 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19920  transcriptional regulator, tetR family  61.18 
 
 		 207 aa  203  1e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.314765  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26640  transcriptional regulator, tetR family  38.51 
 
 		 215 aa  88.2  5e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.062936  normal  0.0737104 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4284  transcriptional regulator, TetR family  36.23 
 
 		 223 aa  67  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.620259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5582  transcriptional regulator, TetR family  33.83 
 
 		 250 aa  63.9  0.0000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7234  putative transcriptional regulator, TetR family  35.06 
 
 		 249 aa  63.2  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4140  transcriptional regulator, TetR family  32.86 
 
 		 240 aa  60.8  0.000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2596  TetR family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 257 aa  56.6  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.476942 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0716  transcriptional regulator, TetR family  32.84 
 
 		 231 aa  55.8  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0221174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3568  TetR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 253 aa  55.8  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5576  transcriptional regulator, TetR family  30.73 
 
 		 234 aa  53.9  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0683  transcriptional regulator, TetR family  33.83 
 
 		 233 aa  52.4  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.124954 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5716  transcriptional regulator, TetR family  27.64 
 
 		 255 aa  51.2  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.831325 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4845  putative transcriptional regulator, TetR family  34.65 
 
 		 230 aa  50.8  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3718  transcriptional regulator, TetR family  32.84 
 
 		 223 aa  50.8  0.000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000868131  normal  0.31083 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4458  transcriptional regulator, TetR family  33.06 
 
 		 263 aa  50.8  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0794126 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1945  putative transcriptional regulator, TetR family  32.74 
 
 		 268 aa  50.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.951149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6464  putative transcriptional regulator, TetR family  31.01 
 
 		 245 aa  50.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0682753 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3346  regulatory protein, TetR  33.64 
 
 		 262 aa  50.1  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.213794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0437  TetR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 239 aa  49.3  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1499  TetR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 271 aa  48.5  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.148288  normal  0.740937 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3300  transcriptional regulator, TetR family  31.75 
 
 		 214 aa  48.5  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.513465  hitchhiker  0.00580905 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4781  transcriptional regulator, TetR family  30.88 
 
 		 228 aa  48.1  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.809331  hitchhiker  0.00725959 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0638  TetR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 250 aa  47.8  0.00007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2357  transcriptional regulator, TetR family  33.09 
 
 		 218 aa  47.4  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2797  TetR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 242 aa  47.4  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139894  normal  0.287212 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3544  transcriptional regulator, TetR family  31.37 
 
 		 258 aa  46.2  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.164716  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0664  TetR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 235 aa  46.2  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.773977  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3445  transcriptional regulator, TetR family  34.26 
 
 		 230 aa  46.6  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23630  transcriptional regulator  24.73 
 
 		 210 aa  46.6  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.119387 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3884  transcriptional regulator, TetR family  35.51 
 
 		 304 aa  45.4  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.162563 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3932  putative transcriptional regulator, TetR family  30.51 
 
 		 228 aa  45.4  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199219  normal  0.0173794 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6498  transcriptional regulator, TetR family  30.36 
 
 		 246 aa  45.4  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1243  TetR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 229 aa  45.4  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.176443 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8156  putative transcriptional regulator, TetR family  32.81 
 
 		 272 aa  45.1  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3083  regulatory protein TetR  30.51 
 
 		 248 aa  45.1  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.143154  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1669  transcriptional regulator, TetR family  25.95 
 
 		 255 aa  45.1  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.269764  normal  0.168881 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4181  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 240 aa  45.1  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.367396  normal  0.615524 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6384  putative transcriptional regulator, TetR family  30.88 
 
 		 224 aa  44.7  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.317451  normal  0.404992 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1632  transcriptional regulator, TetR family  44.9 
 
 		 310 aa  44.7  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275496  normal  0.111085 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4687  transcriptional regulator, TetR family  37.36 
 
 		 259 aa  44.7  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.717984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2330  TetR family transcriptional regulator  55.26 
 
 		 225 aa  44.3  0.0009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.389066  normal  0.980038 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2430  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 252 aa  43.9  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.522174  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30920  transcriptional regulator, tetR family  35.29 
 
 		 266 aa  43.5  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1711  regulatory protein TetR  30.09 
 
 		 226 aa  43.9  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.539832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2698  Tetracyclin repressor domain protein  29.73 
 
 		 239 aa  43.5  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00320  transcriptional regulator, tetR family  32.67 
 
 		 256 aa  42.7  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.48619  normal  0.068604 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7832  transcriptional regulator, TetR family  31.15 
 
 		 253 aa  43.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0353896 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1167  regulatory protein, TetR  30.71 
 
 		 227 aa  43.5  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1574  transcriptional regulator, TetR family  29.52 
 
 		 258 aa  43.5  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0578  TetR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 267 aa  42.4  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5556  transcriptional regulator, GntR family  32.08 
 
 		 311 aa  42.4  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4098  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 315 aa  42.7  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4456  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 258 aa  42.4  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.162192 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0252  transcriptional regulator, TetR family  31.73 
 
 		 221 aa  42.4  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5652  transcriptional regulator, TetR family  44.9 
 
 		 283 aa  42.4  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2404  transcriptional regulator, TetR family  26.55 
 
 		 247 aa  42.4  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0783886 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3980  TetR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 268 aa  42.4  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1037  TetR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 226 aa  42  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.97893  normal  0.250899 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4078  TetR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 269 aa  42  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.152777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4066  putative transcriptional regulator, TetR family  31.96 
 
 		 253 aa  41.6  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.546263  normal  0.272387 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6035  transcriptional regulator, TetR family  30.3 
 
 		 203 aa  41.2  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0744  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 224 aa  41.2  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0222814 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3817  transcriptional regulator, TetR family  30.48 
 
 		 223 aa  41.2  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.131002  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0801  transcriptional regulator, TetR family  29.79 
 
 		 226 aa  41.2  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2060  transcriptional regulator, TetR family  28.66 
 
 		 266 aa  40.8  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.582496  normal  0.158127 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8893  transcriptional regulator, TetR family  29.77 
 
 		 272 aa  41.2  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3340  transcriptional regulator, TetR family  33.01 
 
 		 227 aa  40.8  0.01  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2637  putative transcriptional regulator, TetR family  29.57 
 
 		 220 aa  40.8  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000568428  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>