223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3348 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3348  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 185 aa  363  1e-100  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2792  TetR family transcriptional regulator  45.55 
 
 		 190 aa  143  1e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.782155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3074  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 192 aa  141  5e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3134  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 192 aa  141  5e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.641409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3091  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 192 aa  141  5e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0742554 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21360  transcriptional regulator, TetR family  43.81 
 
 		 206 aa  131  6e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.127836  normal  0.357603 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3625  TetR family transcriptional regulator  43.46 
 
 		 190 aa  128  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.130567  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4132  transcriptional regulator, TetR family  39.36 
 
 		 192 aa  114  6e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.88155  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2976  regulatory protein TetR  40.45 
 
 		 199 aa  112  2.0000000000000002e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3070  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 216 aa  108  4.0000000000000004e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2637  putative transcriptional regulator, TetR family  36.81 
 
 		 220 aa  79.7  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000568428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0279  TetR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 210 aa  74.7  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0763  TetR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 210 aa  74.7  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.756053  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0732  TetR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 210 aa  74.7  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4216  putative transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 212 aa  74.7  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00833872  hitchhiker  0.000365538 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1930  TetR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 206 aa  73.9  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.189169  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7060  tetracycline repressor domain-containing protein  33.33 
 
 		 203 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0598818  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0683  TetR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 211 aa  72  0.000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1677  transcriptional regulator, TetR family  33.1 
 
 		 218 aa  69.7  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00000521041  normal  0.168881 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1662  transcriptional regulator, TetR family  32.93 
 
 		 213 aa  68.6  0.00000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.552653  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0043  tetracycline repressor protein R, class A  33.83 
 
 		 225 aa  68.2  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0152  tetracycline repressor protein, class A  33.83 
 
 		 225 aa  68.2  0.00000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0033  tetracycline repressor protein, class A  33.83 
 
 		 225 aa  68.2  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.370137  normal  0.333737 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1945  putative transcriptional regulator, TetR family  29.91 
 
 		 268 aa  68.2  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.951149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0658  TetR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 211 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5105  transcriptional regulator, TetR family  27.96 
 
 		 223 aa  67  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000423081  normal  0.55194 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19490  transcriptional regulator, tetR family  57.63 
 
 		 168 aa  66.6  0.0000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3851  TetR family transcriptional regulator  34.16 
 
 		 210 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.197556  normal  0.870182 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1704  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 204 aa  66.2  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.326361  normal  0.417933 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4938  regulatory protein, TetR  30.1 
 
 		 222 aa  64.3  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0214473 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23630  transcriptional regulator  29.09 
 
 		 210 aa  62.8  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.119387 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1495  TetR family transcriptional regulator  34.53 
 
 		 200 aa  61.6  0.000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.969103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1952  regulatory protein TetR  40.96 
 
 		 241 aa  60.5  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1404  hypothetical protein  29.94 
 
 		 227 aa  59.3  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.245587  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3932  putative transcriptional regulator, TetR family  28.18 
 
 		 228 aa  59.3  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199219  normal  0.0173794 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0104  TetR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 207 aa  59.3  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000192911 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3985  hypothetical protein  31.01 
 
 		 228 aa  58.9  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.997476 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2683  TetR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 218 aa  58.9  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3927  transcriptional regulator, TetR family  34.04 
 
 		 218 aa  58.5  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69466  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3892  transcriptional regulator, TetR family  29.95 
 
 		 211 aa  58.2  0.00000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8044  putative transcriptional regulator, TetR family  32.1 
 
 		 249 aa  58.2  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.467604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3273  Tetracyclin repressor domain protein  29.7 
 
 		 213 aa  57.4  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.120229  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3639  transcriptional regulator, TetR family  29.86 
 
 		 234 aa  57  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8986  putative transcriptional regulator, TetR family  50.91 
 
 		 220 aa  56.6  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1499  TetR family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 271 aa  56.6  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.148288  normal  0.740937 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4284  transcriptional regulator, TetR family  30.05 
 
 		 223 aa  56.2  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.620259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2728  putative transcriptional regulator, TetR family  29.03 
 
 		 200 aa  56.2  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.427892  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4050  transcriptional regulator, TetR family  27.4 
 
 		 221 aa  55.5  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0170602 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1498  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 244 aa  55.5  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.98693  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1521  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 244 aa  55.5  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.290905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1498  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 244 aa  55.5  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3500  transcriptional regulator, TetR family  50.88 
 
 		 186 aa  55.1  0.0000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.711575  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5582  transcriptional regulator, TetR family  29.45 
 
 		 250 aa  55.1  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0819  transcriptional regulator, TetR family  33.06 
 
 		 237 aa  55.1  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6464  putative transcriptional regulator, TetR family  30.51 
 
 		 245 aa  55.1  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0682753 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2572  transcriptional regulator, TetR family  39.76 
 
 		 239 aa  54.7  0.0000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.314261  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3346  regulatory protein, TetR  35.97 
 
 		 262 aa  54.7  0.0000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.213794  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2797  TetR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 242 aa  54.3  0.0000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139894  normal  0.287212 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3395  transcriptional regulator, TetR family  37.37 
 
 		 173 aa  54.3  0.0000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.542573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3174  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 230 aa  54.3  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0201096  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1254  TetR family transcriptional regulator  40.22 
 
 		 223 aa  54.3  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.297921  normal  0.284076 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4137  putative transcriptional regulator, TetR family  31.17 
 
 		 263 aa  53.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0181128  normal  0.0240758 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3954  transcriptional regulator, TetR family  30.14 
 
 		 183 aa  53.1  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00776564  normal  0.0886939 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0628  transcriptional regulator, TetR family  28.34 
 
 		 218 aa  52.8  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.504351 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5576  transcriptional regulator, TetR family  26.02 
 
 		 234 aa  52.8  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0215  transcriptional regulator, TetR family  31.43 
 
 		 246 aa  52.4  0.000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.674801 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1702  regulatory protein TetR  33.51 
 
 		 199 aa  52.4  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04290  transcriptional regulator  29.55 
 
 		 230 aa  52.4  0.000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0356089  normal  0.115644 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1690  transcriptional regulator, TetR family  27.97 
 
 		 222 aa  52  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.072365  hitchhiker  0.0000000604778 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0437  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 239 aa  52  0.000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3400  transcriptional regulator, TetR family  32.84 
 
 		 248 aa  51.6  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.160802  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0408  transcriptional regulator, TetR family  30.07 
 
 		 212 aa  51.6  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1048  transcriptional regulator, TetR family  37.23 
 
 		 232 aa  51.6  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0498897  normal  0.620598 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3085  regulatory protein, TetR  31.03 
 
 		 223 aa  51.6  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.355286  normal  0.26404 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3718  transcriptional regulator, TetR family  28.67 
 
 		 223 aa  51.6  0.000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000868131  normal  0.31083 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0460  regulatory protein TetR  31.21 
 
 		 227 aa  51.2  0.000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.266812  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2916  TetR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 216 aa  51.2  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4181  TetR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 240 aa  51.2  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.367396  normal  0.615524 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1243  TetR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 229 aa  50.8  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.176443 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3817  transcriptional regulator, TetR family  33.61 
 
 		 223 aa  50.8  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.131002  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2193  regulatory protein TetR  36.13 
 
 		 243 aa  50.4  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00970434  hitchhiker  0.00792169 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4458  transcriptional regulator, TetR family  47.46 
 
 		 263 aa  50.8  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0794126 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2585  transcriptional regulator, TetR family  35.06 
 
 		 218 aa  50.8  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.106012  normal  0.0213025 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6521  putative transcriptional regulator, TetR family  30.25 
 
 		 210 aa  50.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.177383 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0201  tetracyclin repressor-like  35.96 
 
 		 239 aa  50.4  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.54472  normal  0.150657 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0040  TetR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 211 aa  49.7  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.970085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8893  transcriptional regulator, TetR family  40.58 
 
 		 272 aa  49.7  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26640  transcriptional regulator, tetR family  33.11 
 
 		 215 aa  50.1  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.062936  normal  0.0737104 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2357  transcriptional regulator, TetR family  29.37 
 
 		 218 aa  50.4  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3544  transcriptional regulator, TetR family  29.2 
 
 		 258 aa  49.7  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.164716  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3568  TetR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 253 aa  49.7  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2480  transcriptional regulator, TetR family  45.45 
 
 		 221 aa  49.3  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0883171  normal  0.233137 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0683  transcriptional regulator, TetR family  29.89 
 
 		 243 aa  49.3  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0129651  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2698  Tetracyclin repressor domain protein  32.61 
 
 		 239 aa  49.7  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4294  transcriptional regulator, GntR family  44.44 
 
 		 343 aa  48.9  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.806766 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1119  transcriptional regulator, TetR family  48 
 
 		 211 aa  48.9  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.335801 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1898  transcriptional regulator, TetR family  24.29 
 
 		 225 aa  48.9  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00182667  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4572  putative transcriptional regulator, TetR family  41.57 
 
 		 223 aa  48.9  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.145324  normal  0.111989 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0744  TetR family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 224 aa  48.5  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0222814 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2633  transcriptional regulator, TetR family  39.06 
 
 		 204 aa  48.5  0.00005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.487613  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>