208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0683 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_0683  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 243 aa  482  1e-135  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0129651  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10310  transcriptional regulator, tetR family  48.08 
 
 		 230 aa  154  1e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0039  transcriptional regulator  40.36 
 
 		 233 aa  145  6e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0039  transcriptional regulator, TetR family  38.57 
 
 		 202 aa  134  9.999999999999999e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0837  transcriptional regulator, TetR family  44.51 
 
 		 238 aa  122  7e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.895795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1632  Tetracyclin repressor domain protein  31.28 
 
 		 207 aa  83.2  0.000000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0188717 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2337  transcriptional regulator, TetR family  32.7 
 
 		 218 aa  83.6  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1119  transcriptional regulator, TetR family  34.15 
 
 		 211 aa  75.1  0.0000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.335801 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1997  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 250 aa  73.9  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.354177  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0251  TetR family transcriptional regulator  30.45 
 
 		 202 aa  74.3  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0832  Tetracyclin repressor domain protein  31.03 
 
 		 204 aa  72.4  0.000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0408  transcriptional regulator, TetR family  34.18 
 
 		 212 aa  68.9  0.00000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0215  transcriptional regulator, TetR family  31.55 
 
 		 246 aa  68.6  0.00000000009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.674801 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3927  transcriptional regulator, TetR family  31.37 
 
 		 218 aa  67.8  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2637  putative transcriptional regulator, TetR family  31.08 
 
 		 220 aa  65.5  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000568428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6464  putative transcriptional regulator, TetR family  33.79 
 
 		 245 aa  64.7  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0682753 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2273  transcriptional regulator, TetR family  30.54 
 
 		 224 aa  64.3  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2357  transcriptional regulator, TetR family  29.22 
 
 		 218 aa  63.2  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6164  TetR family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 285 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.406893 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1315  TetR family transcriptional regulator  30.18 
 
 		 255 aa  62.4  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.156581 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26640  transcriptional regulator, tetR family  30.56 
 
 		 215 aa  61.2  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.062936  normal  0.0737104 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0683  TetR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6521  putative transcriptional regulator, TetR family  25.68 
 
 		 210 aa  58.9  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.177383 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2646  transcriptional regulator, TetR family  27.63 
 
 		 236 aa  58.5  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00299352  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2420  regulatory protein TetR  37.04 
 
 		 190 aa  58.5  0.00000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000385349  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3718  transcriptional regulator, TetR family  28.48 
 
 		 223 aa  58.2  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000868131  normal  0.31083 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1930  TetR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 206 aa  57.4  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.189169  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1048  transcriptional regulator, TetR family  29.81 
 
 		 232 aa  57  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0498897  normal  0.620598 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1945  putative transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 268 aa  56.6  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.951149  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4140  transcriptional regulator, TetR family  28.76 
 
 		 240 aa  56.6  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5576  transcriptional regulator, TetR family  28.24 
 
 		 234 aa  56.6  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4689  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 259 aa  56.2  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0578  TetR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 267 aa  55.8  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0104  TetR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 207 aa  55.8  0.0000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000192911 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4137  putative transcriptional regulator, TetR family  30.07 
 
 		 263 aa  55.8  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0181128  normal  0.0240758 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0279  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0763  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.756053  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0658  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0732  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2378  transcriptional repressor TetR  27.54 
 
 		 260 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0287531  normal  0.0684522 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1498  TetR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 244 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.98693  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1521  TetR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 244 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.290905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1498  TetR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 244 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2480  transcriptional regulator, TetR family  29.09 
 
 		 221 aa  54.7  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0883171  normal  0.233137 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0744  TetR family transcriptional regulator  25.27 
 
 		 224 aa  53.9  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0222814 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2285  transcriptional regulator, TetR family  32.74 
 
 		 213 aa  54.3  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5652  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 283 aa  53.9  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1050  TetR family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 238 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.361662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1898  transcriptional regulator, TetR family  26.58 
 
 		 225 aa  53.9  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00182667  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3851  TetR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 210 aa  53.5  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.197556  normal  0.870182 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8044  putative transcriptional regulator, TetR family  29.22 
 
 		 249 aa  53.5  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.467604  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5638  TetR family transcriptional regulator  25.61 
 
 		 238 aa  53.5  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.491763  normal  0.336395 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3530  transcriptional regulator, TetR family  31.17 
 
 		 267 aa  53.1  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0209016  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0043  tetracycline repressor protein R, class A  30.1 
 
 		 225 aa  52.8  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0152  tetracycline repressor protein, class A  30.1 
 
 		 225 aa  52.8  0.000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0033  tetracycline repressor protein, class A  30.1 
 
 		 225 aa  52.8  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.370137  normal  0.333737 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1690  transcriptional regulator, TetR family  28.95 
 
 		 222 aa  52.8  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.072365  hitchhiker  0.0000000604778 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2683  TetR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 218 aa  52.8  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3174  TetR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 230 aa  52.4  0.000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0201096  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3954  transcriptional regulator, TetR family  31.61 
 
 		 183 aa  52  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00776564  normal  0.0886939 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0040  transcriptional regulator, TetR family  34.83 
 
 		 195 aa  52  0.000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0036  putative transcriptional regulator, TetR family  25.89 
 
 		 234 aa  52  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.940738 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0414  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 233 aa  52  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2911  TetR family transcriptional regulator  22.83 
 
 		 248 aa  51.2  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.109038 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8893  transcriptional regulator, TetR family  42.62 
 
 		 272 aa  51.6  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2404  transcriptional regulator, TetR family  28.89 
 
 		 247 aa  52  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0783886 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2840  transcriptional regulator, TetR family  27.07 
 
 		 238 aa  51.6  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1040  regulatory protein TetR  28.3 
 
 		 219 aa  51.2  0.00001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.591621  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3639  transcriptional regulator, TetR family  27.53 
 
 		 234 aa  51.6  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4050  transcriptional regulator, TetR family  27.15 
 
 		 221 aa  51.2  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0170602 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4066  putative transcriptional regulator, TetR family  25.82 
 
 		 253 aa  50.8  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.546263  normal  0.272387 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3070  transcriptional regulator, TetR family  40.45 
 
 		 216 aa  50.8  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0819  transcriptional regulator, TetR family  29.2 
 
 		 237 aa  51.2  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1499  TetR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 271 aa  50.8  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.148288  normal  0.740937 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1265  transcriptional regulator, TetR family  30.84 
 
 		 249 aa  50.4  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0071426 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2728  putative transcriptional regulator, TetR family  26.76 
 
 		 200 aa  50.8  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.427892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4458  transcriptional regulator, TetR family  46.55 
 
 		 263 aa  51.2  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0794126 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2982  TetR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 232 aa  51.2  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.435152  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7060  tetracycline repressor domain-containing protein  29.05 
 
 		 203 aa  50.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0598818  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2060  transcriptional regulator, TetR family  26.14 
 
 		 266 aa  50.4  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.582496  normal  0.158127 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6384  putative transcriptional regulator, TetR family  28.78 
 
 		 224 aa  50.4  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.317451  normal  0.404992 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0437  TetR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 239 aa  50.1  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6425  putative transcriptional regulator, TetR family  35.09 
 
 		 247 aa  50.1  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00857124 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2797  TetR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 242 aa  50.4  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139894  normal  0.287212 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7832  transcriptional regulator, TetR family  38.36 
 
 		 253 aa  50.1  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0353896 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7234  putative transcriptional regulator, TetR family  28.12 
 
 		 249 aa  49.7  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0638  TetR family transcriptional regulator  33 
 
 		 250 aa  49.7  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3348  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 185 aa  49.3  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5933  regulatory protein TetR  31.61 
 
 		 250 aa  48.9  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.164219 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4938  regulatory protein, TetR  28.57 
 
 		 222 aa  48.9  0.00008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0214473 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3273  Tetracyclin repressor domain protein  25.91 
 
 		 213 aa  48.1  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.120229  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1460  transcriptional regulator, TetR family  25.61 
 
 		 249 aa  48.1  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3710  regulatory protein, TetR  36.62 
 
 		 230 aa  48.1  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0522  transcriptional regulator, TetR family  28.3 
 
 		 259 aa  47.8  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0445084 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2785  TetR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 196 aa  48.5  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.256269 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6218  TetR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 278 aa  48.1  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.480822 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2190  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 223 aa  48.1  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1370  transcriptional regulator, TetR family  26.63 
 
 		 223 aa  47.8  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.705116 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3462  regulatory protein TetR  25.73 
 
 		 221 aa  48.1  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0249959  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1382  transcriptional regulator, TetR family  34.65 
 
 		 217 aa  47.4  0.0002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>