275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlut_10310 on replicon NC_012803
Organism: Micrococcus luteus NCTC 2665



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012803  Mlut_10310  transcriptional regulator, tetR family  100 
 
 
230 aa  444  1.0000000000000001e-124  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0683  transcriptional regulator, TetR family  48.44 
 
 
243 aa  184  1.0000000000000001e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0129651  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0039  transcriptional regulator  45.66 
 
 
233 aa  173  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0039  transcriptional regulator, TetR family  47.12 
 
 
202 aa  173  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0837  transcriptional regulator, TetR family  42.51 
 
 
238 aa  127  1.0000000000000001e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.895795  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1632  Tetracyclin repressor domain protein  37.2 
 
 
207 aa  97.1  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.0188717 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3927  transcriptional regulator, TetR family  37.43 
 
 
218 aa  85.5  7e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69466  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0832  Tetracyclin repressor domain protein  35.12 
 
 
204 aa  85.1  8e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2357  transcriptional regulator, TetR family  33.8 
 
 
218 aa  81.3  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2337  transcriptional regulator, TetR family  36.24 
 
 
218 aa  77.8  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2273  transcriptional regulator, TetR family  34.81 
 
 
224 aa  77.8  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4137  putative transcriptional regulator, TetR family  37.91 
 
 
263 aa  77.4  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0181128  normal  0.0240758 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0251  TetR family transcriptional regulator  31.31 
 
 
202 aa  76.3  0.0000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1119  transcriptional regulator, TetR family  30.18 
 
 
211 aa  75.9  0.0000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.335801 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6164  TetR family transcriptional regulator  34.23 
 
 
285 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.406893 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6464  putative transcriptional regulator, TetR family  29.6 
 
 
245 aa  73.9  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0682753 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0215  transcriptional regulator, TetR family  30.8 
 
 
246 aa  73.2  0.000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.674801 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2060  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 
266 aa  72.8  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.582496  normal  0.158127 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1997  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 
250 aa  71.6  0.000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.354177  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0578  TetR family transcriptional regulator  32.88 
 
 
267 aa  71.2  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5957  transcriptional regulator, TetR family  32.7 
 
 
229 aa  69.7  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.769485  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1499  TetR family transcriptional regulator  32.34 
 
 
271 aa  69.3  0.00000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.148288  normal  0.740937 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1460  transcriptional regulator, TetR family  31.18 
 
 
249 aa  68.9  0.00000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3884  transcriptional regulator, TetR family  34.86 
 
 
304 aa  68.6  0.00000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.162563 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7832  transcriptional regulator, TetR family  31.95 
 
 
253 aa  68.2  0.00000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0353896 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1243  TetR family transcriptional regulator  29.95 
 
 
229 aa  68.2  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.176443 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2911  TetR family transcriptional regulator  29.29 
 
 
248 aa  67.4  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.109038 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0408  transcriptional regulator, TetR family  34.42 
 
 
212 aa  67  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26640  transcriptional regulator, tetR family  34.19 
 
 
215 aa  66.6  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.062936  normal  0.0737104 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2480  transcriptional regulator, TetR family  31.19 
 
 
221 aa  66.2  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0883171  normal  0.233137 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2404  transcriptional regulator, TetR family  29 
 
 
247 aa  65.9  0.0000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0783886 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3530  transcriptional regulator, TetR family  34.23 
 
 
267 aa  65.1  0.0000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0209016  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4181  TetR family transcriptional regulator  29.28 
 
 
240 aa  65.5  0.0000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.367396  normal  0.615524 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0104  TetR family transcriptional regulator  35.17 
 
 
207 aa  65.1  0.0000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000192911 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0036  putative transcriptional regulator, TetR family  28.98 
 
 
234 aa  65.1  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.940738 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4050  transcriptional regulator, TetR family  31.29 
 
 
221 aa  65.1  0.0000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0170602 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2572  transcriptional regulator, TetR family  41.03 
 
 
239 aa  65.1  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.314261  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4294  transcriptional regulator, GntR family  30.56 
 
 
343 aa  64.3  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.806766 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1965  transcriptional regulator, TetR family  30.72 
 
 
234 aa  64.3  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.66981  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8044  putative transcriptional regulator, TetR family  32.54 
 
 
249 aa  63.5  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.467604  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1050  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
238 aa  62.4  0.000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.361662  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0017  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 
224 aa  62.4  0.000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3346  regulatory protein, TetR  34.78 
 
 
262 aa  62  0.000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.213794  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4082  transcriptional regulator, TetR family  35.34 
 
 
343 aa  62  0.000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.63573 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1315  TetR family transcriptional regulator  32.92 
 
 
255 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.156581 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0279  transcriptional regulator, TetR family  29.75 
 
 
268 aa  61.2  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2797  TetR family transcriptional regulator  52.86 
 
 
242 aa  61.2  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139894  normal  0.287212 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2840  transcriptional regulator, TetR family  29.54 
 
 
238 aa  60.8  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3462  regulatory protein TetR  31.8 
 
 
221 aa  60.1  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0249959  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5716  transcriptional regulator, TetR family  27.9 
 
 
255 aa  60.1  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.831325 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8893  transcriptional regulator, TetR family  28.14 
 
 
272 aa  59.7  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3718  transcriptional regulator, TetR family  27.57 
 
 
223 aa  59.7  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000868131  normal  0.31083 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2497  putative transcriptional regulator, GntR family  30.38 
 
 
315 aa  59.3  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.182047 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1690  transcriptional regulator, TetR family  35.17 
 
 
222 aa  59.3  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.072365  hitchhiker  0.0000000604778 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1945  putative transcriptional regulator, TetR family  30.82 
 
 
268 aa  59.3  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.951149  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6218  TetR family transcriptional regulator  34.53 
 
 
278 aa  59.3  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.480822 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2879  regulatory protein TetR  30.86 
 
 
226 aa  58.9  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0744  TetR family transcriptional regulator  30.74 
 
 
224 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0222814 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0414  transcriptional regulator, TetR family  31.17 
 
 
233 aa  58.9  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5652  transcriptional regulator, TetR family  31.18 
 
 
283 aa  58.9  0.00000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3174  TetR family transcriptional regulator  26.9 
 
 
230 aa  58.2  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0201096  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7234  putative transcriptional regulator, TetR family  28.14 
 
 
249 aa  57.8  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6498  transcriptional regulator, TetR family  30.86 
 
 
246 aa  57  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0240  TetR family transcriptional regulator  36.13 
 
 
281 aa  57.4  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.679484 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5425  putative transcriptional regulator, TetR family  35.8 
 
 
272 aa  57  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3042  transcriptional regulator, TetR family  32.69 
 
 
202 aa  57  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.578311 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0897  transcriptional regulator, TetR family  34.33 
 
 
265 aa  56.6  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3817  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 
223 aa  55.8  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.131002  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5933  regulatory protein TetR  34.32 
 
 
250 aa  55.8  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.164219 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4781  transcriptional regulator, TetR family  31.3 
 
 
228 aa  55.8  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.809331  hitchhiker  0.00725959 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0819  transcriptional regulator, TetR family  34.85 
 
 
237 aa  55.5  0.0000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5576  transcriptional regulator, TetR family  27.39 
 
 
234 aa  55.5  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1278  TetR family transcriptional regulator  27.88 
 
 
191 aa  55.1  0.0000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.190846  normal  0.885926 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1370  transcriptional regulator, TetR family  28.11 
 
 
223 aa  55.1  0.0000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.705116 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7217  putative transcriptional regulator, TetR family  28.47 
 
 
247 aa  55.1  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.466124  normal  0.580256 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10210  transcriptional regulator  25.62 
 
 
272 aa  54.3  0.000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.472309  normal  0.0650558 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6425  putative transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 
247 aa  54.7  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00857124 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2430  transcriptional regulator, TetR family  30.45 
 
 
252 aa  54.3  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.522174  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2727  transcriptional regulator, TetR family  28.66 
 
 
264 aa  54.7  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3639  transcriptional regulator, TetR family  29.68 
 
 
234 aa  55.1  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0716  transcriptional regulator, TetR family  26.79 
 
 
231 aa  54.7  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0221174  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4763  transcriptional regulator, TetR family  30.22 
 
 
252 aa  54.3  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0000323039  decreased coverage  0.0000700922 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5079  TetR family transcriptional regulator  27.71 
 
 
192 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.925622 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2997  transcriptional regulator, TetR family  41.79 
 
 
239 aa  53.9  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00034517  decreased coverage  0.000048455 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8986  putative transcriptional regulator, TetR family  26.72 
 
 
220 aa  53.9  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19280  transcriptional regulator  42.03 
 
 
235 aa  53.1  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.28299  normal  0.286722 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1040  regulatory protein TetR  31.37 
 
 
219 aa  53.1  0.000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.591621  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0983  TetR family transcriptional regulator  28.92 
 
 
212 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0056  transcriptional regulator, TetR family  31.93 
 
 
289 aa  53.5  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1001  TetR family transcriptional regulator  28.92 
 
 
212 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.735096  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1011  TetR family transcriptional regulator  28.92 
 
 
212 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.632644 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6384  putative transcriptional regulator, TetR family  27.85 
 
 
224 aa  53.5  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.317451  normal  0.404992 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4140  transcriptional regulator, TetR family  30.67 
 
 
240 aa  53.5  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4012  TetR family transcriptional regulator  39.47 
 
 
195 aa  52.8  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00441742  normal  0.139253 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00320  transcriptional regulator, tetR family  32.35 
 
 
256 aa  52.8  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.48619  normal  0.068604 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3445  transcriptional regulator, TetR family  34 
 
 
230 aa  53.1  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4066  putative transcriptional regulator, TetR family  31.17 
 
 
253 aa  52.8  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.546263  normal  0.272387 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3670  hypothetical protein  35.63 
 
 
236 aa  52.8  0.000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0683  transcriptional regulator, TetR family  27.91 
 
 
233 aa  52.4  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.124954 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4046  TetR family transcriptional regulator  37.38 
 
 
212 aa  52.4  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0961065 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>